生物統計学・第1回統計解析を始める前に

生物統計学・第13回
Rを使いこなす
OS、インストール、基本操作、CRAN、プログラミング
2014年1月9日
生命環境科学域応用生命科学類
尾形善之
本日の予定
★ノートパソコン組
♦ 実習
★スクリーン組
♦ 実演
本日の内容
★座学
♦ チェックポイントがあります
★ノートパソコン組
♦ 予め課題を見せるので、挑戦してください
♦ 何かあればTAに尋ねてください
★スクリーン組
♦ Rで主成分分析を実演します
♦ 最後に課題を出します
まずは座学
★Rとは
♦ 元々は統計解析用のプログラミング言語
♦ 無償の統計解析ソフトウェア
♦ 比較的高速で演算できる
♦ 対話式、または自作関数の利用
♦ 直感的な操作環境ではない
まずは座学
★Rでできること
♦ 統計解析：ほぼすべて
• 標準
– 主成分分析など
• 拡張
– CRAN
インストール
★ダウンロード
♦ Rプロジェクトのサイトまで何回かリンク
♦ OSごとに異なるファイルをダウンロード
★インストール
♦ だいたい「はい」で大丈夫です
作業の基本
★対話式
♦ ひとつずつ命令していく
• 実演します
★自作関数（バッチ処理）の利用
♦ 纏めて命令群を作成しておく（自作関数）
♦ 自作関数を読み込んで実行する
チェックポイント
★Rとは？
★Rの作業の基本は？
ノートパソコン組の課題
★渡したデータ(ryoudata140109.txt)の主
成分分析を実行し、以下の問に答えなさ
い。
♦ 第2主成分と第3主成分の負荷量のグラフを作成し、
考察しなさい。
♦ 第2主成分と第3主成分の得点のグラフを作成し、考
察しなさい。
スクリーン組
★これからRの実演に入ります
今日の実演内容
★Rのダウンロード
★Rのインストール
★Rの動作確認
★Rを使った主成分分析
次回の予告
★次回はPerlです。
♦ Windows
• 「ActivePerl」をインストールします
• 「Perlをはじめよう」をインストールします
♦ Macintosh
• すでに入っています
♦ 動作確認
• コマンドプロンプト（ターミナル）で「Perl -v」を実行します
スクリーン組の課題
★今日のデータに関して、
♦ データの特徴について書きなさい。
♦ 主成分分析の結果の以下の内容について考察し
なさい。
• 寄与率
• 負荷量
• 得点

Download Report