Data Sheet: DNA Sequencing NeoPrep ™ 用 TruSeq® Nano DNA ライブラリー調製キット 少ない DNA インプット量と、大幅に短くなったハンズオン時間で、完全なゲノムカバレッジを実現 する DNA ライブラリー調製キット 少量のインプットから高品質なライブラリー 特長 デジタルマイクロフルイディクス技術を利用することで、NeoPrep システムは TruSeq Nano DNA のパフォーマンスを向上さ せ、複数のユーザーが使用した場合でも一貫性の高い結果をも たらします。この技術は、液滴を正確に操作し、必要となるインプッ ト DNA 量が少なく、25~75ng の gDNA から高品質なライブラ リーを調製できます（表 1）。 加えて、1~100ng のインプット DNA からもライブラリーを調製可能なことが示されており、マ ニュアルによるプロトコールに比べ、インプット量は最大で 10 倍 少なくなっています。 • シンプル、シームレスなワークフロー NeoPrep ワークフローには装置内での定量およびノーマ ライゼーションが含まれ、すぐにシーケンスできるライブ ラリーを調製 • 比類の無い性能と再現性 TruSeq Nano DNA キットと同じカバレッジおよび品質の ライブラリーを最小限のハンズオン時間で調製、ユーザー 間のばらつきも低減 • 少ない必要インプット量 表 1：作業効率比較 最少 25ng の gDNA からライブラリーを調製 マニュアル 簡単、迅速な、 NeoPrep 用の TruSeq Nano DNA ライブラリー調製 実績ある TruSeq Nano DNA ケミストリーが、NeoPrep ライブ ラリー調製システムで使用できるようになりました。 NeoPrep システムは、イルミナの全ての次世代シーケンサー用にライブラ リー調製を行うための統合されたソリューションであり、ライブラ リー調製がこれまでよりはるかに容易になります。 NeoPrep シス テムによって、ライブラリー調製が非常に簡単になり、すぐにシー ケンスできるライブラリーを再現性高く調製し、高品質なデータと 優れたゲノムカバレッジがわずかなハンズオン時間で得られます。 NeoPrep 試薬キット TruSeq Nano DNA Library Prep Kit TruSeq Nano DNA Library Prep Kit for NeoPrep インプット量 100~200ng 25~75ng ライブラリー調製 アッセイ時間 a 約 5.5 時間 5 時間 ハンズオン時間 b 約 4 時間 30 分 ターゲットインサート サイズ 350bp または 550bp 350bp または 550bp ライブラリー定量用の 機器 Qubit、qPCR または RT-PCR 装置 必要なし a. ライブラリー調製、定量、およびノーマライゼーションを行った場合の NeoPrep アッ セイ時間は 7 時間です。 b. 16 ライブラリーの調製からノーマライゼーションまでを行う場合のハンズオン時間 です。 すぐにシーケンスできるライブラリーを簡単に NeoPrep システムは、断片化した gDNA サンプルおよび試薬を NeoPrep ライブラリーカードにロードして「Start Run」ボタンを 押し、一定時間後に定量およびノーマライゼーション済みのライ ブラリーを回収するだけです。 NeoPrep の装置が平滑末端 DNA フラグメントの生成、ビーズベースのサイズ選択、インデックスア ダプターのライゲーションを行い、調製ステップにおけるマニュア ル操作は数時間短縮されます。シンプルで直感的なワークフロー により、 わずか 30 分のハンズオン時間で、 1 ランですぐにシーケン スできる 16 サンプルのライブラリーを調製します（図 1） 。 NeoPrep ライブラリー調製システムおよび NeoPrep 用 TruSeq キットの組み合わせは、包括的なイルミナ NGS ソリューションの 重要な構成要素です。 NeoPrep で調製したライブラリーは全て のイルミナ次世代シーケンサーでシーケンス可能であり、データ は BaseSpace® コアアプリで解析できるので、幅広いゲノムアプ リケーションにおいてシームレスなワークフローを実現します。 ハンズオン 時間合計 マニュアル 断片化および サイズ選択 A テール ライゲーション 増幅 NeoPrep NeoPrep システムへの ローディング NeoPrep システムによる処理 定量 ノーマライゼーション すぐに シーケンスできる ライブラリーの回収 すぐに シーケンスできる ライブラリーの回収 約 4 時間 30 分 図 1：マニュアルおよび NeoPrep による TruSeq Nano DNA ライブラリー調製のワークフロー どちらのワークフローも断片化した gDNA からスタートします。 NeoPrep システムでは、ハンズオン時間が 4 時間から 30 分に短縮されます。 Data Sheet: DNA Sequencing 少なくなったステップ数、短いハンズオン時間 NeoPrep システムにより、TruSeq Nano DNA のワークフロー が大幅に簡単になり、ライブラリーを調製するのに必要なハンズ オン時間が短縮されます。結果として、ライブラリー調製の所要 時間が大きく減り、追加で必要になる機器も少なく、ラン時間も 速くなり、 ライブラリーの再現性もこれまでにないほど向上します。 （表 2）。 優れたゲノムカバレッジ NeoPrep のワークフローによって、ライブラリーのバイアスが低 減し、ゲノム全体のカバレッジ均一性が向上するため、GC リッチ 領域、プロモーター領域、反復領域など、従来はシーケンス困 難だったゲノム領域でも優れたカバレッジが得られます。高品質 なデータにより、1 塩基単位の解像度で体細胞変異および de novo 変異の詳細な情報が得られ、原因変異の精確な同定に役 立ちます（図 2）。 % Normalized Coverage ノーマライズ後のカバレッジ（ %） C Coverage of Challenging Regions, Human gDNA シーケンス困難な領域のカバレッジ、ヒ ト gDNA (TruSeq Nano Nano DNA DNA 550bp 550 bp) （TruSeq ） まとめ NeoPrep 用 TruSeq Nano DNA キットは、実績ある TruSeq ケ ミストリーの性能と NeoPrep システムのシンプルさを組み合わ せ、業界で最も広く使用されているライブラリー調製法をさらに パワーアップします。 TruSeq Nano DNA ワークフローは必要 インプット DNA 量が少なく、PCR によるバイアスを抑え、ゲノ ムの詳細かつ精確な情報をもたらします。 TruSeq Nano DNA キットを使用した NeoPrep ライブラリーは、イルミナの全ての次 世代シーケンサーでランを行うことができ、BaseSpace コアア プリによるデータ解析との組み合わせで、様々なゲノムアプリケー ションに対し、一貫したシームレスなワークフローを実現します。 詳しい情報 NeoPrep システムの詳細については www.illuminakk.co.jp/neoprep をご覧ください。 TruSeq Nano DNA ライブラリー調製キットの詳細については www.illuminakk.co.jp/nano をご覧ください。 120 表 2：製品情報 100 キット 80 カタログ番号 TruSeq Nano DNA Library Prep Kit for NeoPrep （16 Samples, 24 Indexes） 60 40 システム 20 NeoPrep Library Prep System（設置を含む） 0 Genes 遺伝子 Exons ≧ ≥ 75% ≥ 85% GC AT エクソン 75% GC GC ≧ AT DN DN Manual マニュアル NeoPrep ng NeoPrep 75 75ng 図 2：NeoPrep およびマニュアルによるライブラリー調製 NeoPrep システム で調製したライブラリーは、イルミナ TruSeq Nano DNA を用いるマニュアル 調製法と同等のパフォーマンスを示しています。「≧ 75% GC」 および「≧ 85% GC」は、100 塩基に 75% 以上および 85% 以上の GC 含量を持つ領域 として定義しています。 AT DN は 30 塩基の AT 繰り返し配列を示します。 イルミナ株式会社 代理店 〒108-0014 東京都港区芝 5-36-7 三田ベルジュビル 22 階 Tel (03) 4578-2800 Fax (03) 4578-2810 www.illuminakk.co.jp www.facebook.com/illuminakk 本製品の使用目的は研究に限定されます。 販売条件：www.illuminakk.co.jp/tc © 2015 Illumina, Inc. All rights reserved. Illumina, IlluminaDx, BaseSpace, BeadArray, BeadXpress, cBot, CSPro, DASL, Design Studio, GAIIx, Genetic Energy, Genome Analyzer, GenomeStudio, GoldenGate, HiScan, HiSeq, Infinium, iSelect, MiSeq, Nextera, NextSeq, NuPCR, SeqMonitor, Solexa, TruSeq, TruSight, VeraCode, the pumpkin orange color, the Genetic Energy streaming bases design は、Illumina, Inc. の商標または登録商標です。 その他の会社名や商品名は、各社の商標または登録商標です。予告なしに仕様および価格を変更する場合があります。 Pub. No. 770-2014-J021 01MAY2015 NP-101-1001 SE-601-1001
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