presentation du module virologie

UNIVERSITE MOHAMMED V - SOUISSI
FACULTE DE MEDECINE ET DE PHARMACIE RABAT
PRESENTATION DU MODULE
VIROLOGIE
1. Identification du MODULE
1
UPR
Titre du module
Coordinateur
Population cible
Enseignants participants au
Module
Session
Volume horaire
Lieu
Site Web :
Contact
UPR Microbiologie
Virologie
Pr Mimoun Zouhdi,
Etudiants concernés : 2ème année Médecine
Pr L. Lahlou Amine ; Pr AE. Alaoui ; Pr S.Mrani ; Pr
M.Seffar ; Pr S.Zouhair ; Pr H L'Kassmi ; Pr S.Elkabbaj
Pr T.Doblali
2ème Semestre
Volume horaire total : 21 h
Nb d’heures / séance : 1 à 2h
Localisation des séances dans la semaine : Mercredi de
8h à 10h, Jeudi de 8h à 10h, Samedi de de 9h à 11h
Amphithéâtre Faraj, Faculté de Médecine et de
Pharmacie de Rabat
www.medramo.ac.ma
Pr Idriss Lahlou Amine
Courriel : [email protected]
Présentation du Module de Virologie
UNIVERSITE MOHAMMED V - SOUISSI
FACULTE DE MEDECINE ET DE PHARMACIE RABAT
2. Introduction
Place du module dans le cursus de formation :
Le module de Virologie est dispensé à la deuxième année de Médecine et fait
partie de la discipline de Microbiologie qui englobe en plus la bactériologie.
Ce module vise à faire acquérir aux futurs médecins les connaissances de base en
virologie, indispensables à l’acquisition de compétences pour la prise en charge des
maladies infectieuses d’origine virale.
But du module :
Le but de l’enseignement de Virologie est de permettre au futur médecin de situer
les virus pathogènes pour l’homme dans le monde du vivant, de définir leur
structure, réplication, modes de transmission, de décrire les méthodes
diagnostiques d’une infection virale et maîtriser les principes de base de leur
prévention et de leur traitement.
Description générale :
Le Module de Virologie comporte 13 cours : 8 cours de 2 h et 5 cours de 1 h
1. Structure et classification des virus (2h)
2. Multiplication intracellulaire des virus (2h)
3. Mécanismes généraux des infections virales (1h)
4. Diagnostic virologique : méthodes classiques et moléculaires (2h)
5. Orthomyxoviridae (2h)
6. Paramyxoviridae (1h)
7. Herpesviridae (2h)
8. Picornaviridae(1h)
9. Virus des hépatites entérales (2h)
10. Virus des hépatites parentérales (2h)
11. Retroviridae (2h)
12. Togaviridae (1h)
13. Rhabdoviridae(1h)
3. Les objectifs d’apprentissage
Objectifs généraux
1- Acquérir les connaissances virologiques fondamentales
2- Comprendre les maladies infectieuses virales.
3- Décrire les méthodes de diagnostic virologique
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Programme et objectifs spécifiques
Cours n°1 : Structure et classification des virus
Durée : 2 h
Objectifs
Contenus essentiels (titres de chapitres)
-Définir un virus
- Citer les particularités des virus dans le monde
du vivant (bactéries, parasites,..)
- Décrire la structure générale d’un virus
- Citer les critères de classification des virus.
- Structure des virus : génome, capside, enveloppe
-Classification des virus (« International Committee on
Taxonomy of Viruses », ITCV).
Cours n°2 : Multiplication intracellulaire des virus
Durée : 2 h
Objectifs
Contenus essentiels
- Préciser les conditions nécessaires à la
multiplication d’un virus
- Expliquer les étapes de la multiplication virale
dans une cellule
-Multiplication d’un virus : Eléments nécessaires à la
biosynthèse cellulaire des virions (réplication)
- Cycle de multiplication virale : attachement, pénétration,
décapsidation, réplication, assemblage, libération.
- Conséquences de la multiplication virale pour la cellule
infectée
Cours n°3 : Mécanismes généraux des infections virales
Durée : 1 h
Objectifs
Contenus essentiels
- Décrire les modes de propagation des virus
dans l’organisme
- Distinguer entre virus nus et virus à enveloppe
en termes de résistance aux conditions physicochimiques
- Expliquer à l’aide d’exemples les modes de
transmission et les différents types d’infections
virales
- Propagation du virus dans l’organisme : voies de
pénétration, diffusion du virus, organes cibles, voies
d’excrétion
- Les différents types d’infection virale : infections aigües,
infections persistantes
-Facteurs intervenant dans la pathogénèse : facteurs liés au
virus, facteurs liés à l’hôte.
Cours n°4 : Diagnostic virologique : méthodes classiques et moléculaires
Durée : 2 h
Objectifs
Contenus essentiels
-Décrire le mode de recueil et d’acheminement
au laboratoire des prélèvements pathologiques
destinés à l’analyse virologique
-Décrire les techniques de diagnostic direct et
indirect des infections virales
-Décrire le principe de l’hybridation moléculaire
et son application en virologie humaine
-Décrire
le
principe
des
méthodes
d’amplification génique et leurs applications
en virologie humaine
-Nature, recueil et transport des prélèvements virologiques
-Techniques de diagnostic direct : microscopie électronique,
détection immunologique des constituants antigéniques de
virus, culture cellulaire.
-Techniques
de
diagnostic
indirect :
technique
immunoenzymatique de type ELISA, technique d’immunoempreinte (Western Blot, Immunoblot), technique
d’immunofluorescence indirecte..
-Méthodes d’hybridation moléculaire et d’amplification
génique : principe, intérêt, limites et applications en
virologie clinique
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Cours n°5 : Orthomyxoviridae
Durée : 2 h
Objectifs
Contenus essentiels
- Décrire le schéma général de la structure des
virus influenza.
-Décrire l'organisation génomique et les
caractères antigéniques des virus influenza.
-Décrire l’épidémiologie et la physiopathologie
de l’infection grippale
- Décrire les indications et la mise en œuvre du
diagnostic virologique.
1. Caractères généraux des virus influenza
2. Multiplication des virus influenza
3. Épidémiologie
4. Physiopathologie de l’infection grippale
5. Diagnostic virologique
5.1. Indications
5.2. Diagnostic direct : prélèvements et transport, Isolement
viral, identification des virus influenza (types, sous-types et
variants), détection des antigènes viraux, détection du
génome viral par RT-PCR
5.3. Diagnostic sérologique : prélèvements et techniques
Cours n°6 : Paramyxoviridae
Durée : 1 h
Objectifs
Contenus essentiels
-Décrire le schéma général de la structure des virus
de la famille des Paramyxoviridae.
- Décrire l'organisation génomique et les caractères
antigéniques des virus de la famille des
Paramyxoviridae.
-Décrire l'épidémiologie et la physiopathologie des
infections à Paramyxoviridae.
- Décrire les indications et la mise en œuvre du
diagnostic
virologique
des
infections
à
Paramyxoviridae
1. Caractères généraux des Paramyxoviridae
2.Multiplication des virus : VRS, PIV, oreillons, rougeole
3.Épidémiologie : VRS, PIV, oreillons, rougeole
4. Physiopathologie : VRS, PIV, oreillons rougeole
5. Diagnostic virologique
5.1. Indications
5.2.Diagnostic direct : prélèvements et transport,
isolement viral, détection des antigènes viraux,
détection du génome viral par RT-PCR
5.3.Diagnostic sérologique : prélèvements et techniques
Cours n°7 : Herpesviridae
Durée : 2 h
Objectifs
Contenus essentiels
- Décrire le schéma général de la structure des
virus de la famille des Herpesviridae.
- Décrire l'organisation génomique et les
caractères antigéniques des herpesvirus
humains.
- Expliquer l'épidémiologie et les particularités
de la physiopathologie des différents
herpesvirus humains.
- Décrire les indications et la mise en œuvre
des différents examens virologiques pour leur
diagnostic.
1. Caractères généraux des Herpesviridae
2. Epidémiologie
3. Physiopathologie : tropisme cellulaire, organes cibles,
siège de l'infection latente.
4. Diagnostic virologique
4.1. Indications
4.2. Diagnostic direct : prélèvements et transport, isolement
viral,détection des antigènes viraux (immunocytodiagnostic,
ELISA), détection du génome viral par PCR qualitative et
quantitative
4.3.Diagnostic indirect : prélèvements, techniques et
interprétation des résultats
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Cours n°8 : Picornaviridae
Durée : 1 h
Objectifs
Contenus essentiels
- Décrire le schéma général de la structure des
virus de la famille des Picornaviridae.
- Décrire l'épidémiologie et la physiopathologie
des infections à entérovirus.
- Décrire les indications et la mise en oeuvre du
diagnostic virologique des infections à
entérovirus et rhinovirus.
1. Caractères généraux des Picornaviridae
2. Epidémiologie : réservoir, transmission, zone de diffusion
3. Physiopathologie
4. Diagnostic virologique
4.1. Contexte du diagnostic
4.2. Diagnostic direct : prélèvements et transport,
isolement viral, identification du sérotype viral, détection du
génome viral par RT-PCR
4.3. Diagnostic sérologique: réaction de séroneutralisation
du pouvoir infectieux en culture cellulaire utilisant la souche
du malade
Cours n°9 : Hépatites entérales
Durée : 2 h
Objectifs
Contenus essentiels
- Décrire le schéma général de la structure des
virus responsables d’hépatites entérales.
-Décrire l'épidémiologie et la physiopathologie,
des infections à virus de l’hépatite A et E
- Décrire les indications et la mise en oeuvre du
diagnostic virologique des infections à virus de
l’hépatite A et E.
1. Caractères généraux des virus
2.Epidémiologie: réservoir, transmission, zone de diffusion
3. Physiopathologie
4. Diagnostic virologique
4.1. Indications
4.2. Diagnostic indirect : diagnostic sérologique par
méthode ELISA (IgM et IgG).
4.3. Diagnostic direct : détection du génome par RT-PCR
dans le plasma et/ou dans les selles
Cours n°10 : Hépatites parentérales
Durée : 2 h
Objectifs
Contenus essentiels
- Décrire la structure et l’organisation génomique
des virus HBV, HDV, HCV
- Décrire l’épidémiologie et la physiopathologie des
virus HBV, HDV, HCV
- Décrire les indications, la mise en oeuvre des
différentes techniques utiles pour le diagnostic et
la surveillance virologique des infections par HBV,
HDV et HCV
1. Caractères généraux des virus HBV, HDV et HCV
2. Epidémiologie
3. Physiopathologie
4. Diagnostic virologique
4.1. Diagnostic direct : mise en évidence du virus et/ou
de
ses
constituants
(techniques
ELISA,
immunohistochimie, techniques d’amplification par
PCR qualitative et quantitative, techniques de
génotypage, séquençage)
4.2. Diagnostic indirect : prélèvements, techniques
ELISA, cinétique des marqueurs virologiques dans le
sérum en cas d’hépatite aiguë et chronique
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Cours n°11 : Retroviridae- Les virus de l'immunodéficience humaine (VIH1 et 2)
Durée : 2 h
Objectifs
Contenus essentiels
-Décrire la structure, l’organisation génomique,
et le mode de réplication du VIH.
-Décrire l'épidémiologie et la physiopathologie,
de l'infection par le VIH.
-Décrire les différentes techniques de
diagnostic virologique utilisées pour le
diagnostic et le suivi thérapeutique des sujets
infectés par les VIH.
1. Caractères généraux des virus HIV
2. Epidémiologie
3. Physiopathologie
4. Diagnostic virologique
4.1. Indications
4.2.Diagnostic
indirect:
prélèvements,
tests
de
dépistage/ELISA, tests rapides, tests de confirmation par
Western Blot
4.3. Diagnostic direct : mise en évidence du virus et/ou de
ses constituants (antigénémie p24, recherche qualitative et
quantitative de l’ARN viral par PCR, surveillance biologique
des traitements antirétroviraux)
Cours n°12 : Togaviridae- Rubivirus
Durée : 1 heure
Objectifs
Contenus essentiels
- Décrire le schéma général de la structure du
virus de la rubéole.
- Décrire l'épidémiologie et la physiopathologie,
de l'infection à virus de la rubéole
- Décrire les indications et la mise en oeuvre de
la sérologie virale.
1. Caractères généraux du virus de la rubéole
2. Epidémiologie
3. Physiopathologie
3.1. La rubéole de l’enfant et de l’adulte (notions de primoinfection et réinfection).
3.2. La rubéole congénitale
4. Diagnostic virologique
4.1. Contexte du diagnostic: dépistage systématique,
dépistage effectué dans un contexte clinique évocateur,
diagnostic de l’infection congénitale
4.2. Diagnostic sérologique : prélèvements et techniques de
diagnostic
Cours n°13 : Rhabdoviridae- Lyssavirus
Durée : 1 heure
Objectifs
Contenus essentiels
- Décrire le schéma général de la structure des
Lyssavirus.
-Décrire l'épidémiologie et la physiopathologie
de la rage humaine.
-Décrire les indications et la mise en oeuvre des
examens virologiques utiles pour le diagnostic
de la rage.
1. Caractères généraux du virus de la rage
2. Épidémiologie
3. Physiopathologie
4. Diagnostic virologique
4.1. Objectifs du diagnostic
4.2. Diagnostic direct : prélèvements et techniques
4.3. Diagnostic sérologique
Présentation du Module de Virologie
6
UNIVERSITE MOHAMMED V - SOUISSI
FACULTE DE MEDECINE ET DE PHARMACIE RABAT
5. Les méthodes d’enseignement et les activités d’apprentissage
Méthodes d’enseignement de Virologie

Cours magistral illustré
7
Méthodes d’apprentissage :

Cours magistral illustré interactif: la présence est souhaitée, le
contenu du cours et le support d’images permettra de mieux
mémoriser les cours de virologie fondamentale sous tous ses
aspects.
6. Modalités d’évaluation




En fin de semestre, date fixée par la faculté : épreuve de
Microbiologie incluant les programmes de bactériologie et
virologie.
Durée : 1h
Modalités: questions rédactionnelles (QCM possible)
Note de l’épreuve de Virologie : sur 20
7. Autres informations

Personnes ressources : désignés en début de chaque année
universitaire
 Références recommandées
*Traité de Virologie médicale. Jean-Marie Huraux,
Jean-Claude Nicolas, Henri Agut, Hélène Peigue-Lafeuille,.Editions
ESTEM De Boeck, 2003.
* Virologie médicale. Collection Azay. A. Mammette.
Presses universitaires de Lyon, 2002.
Présentation du Module de Virologie

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