MagCaptureTM RNA Pull Down Assay Kit

MagCaptureTM
RNA Pull Down Assay Kit
本キットは新規アビジン様タンパク質Tamavidin®2のアミノ酸改変体の一つでビオチン溶出が可
能な性質を持つTamavidin®2-REVを固相化した磁気ビーズと弊社独自の溶出用バッファーを組
み込んだキットです。
ビオチン化RNA(bait RNA)を利用したRNA Pull Down法に用いる事ができ、ビオチン化RNAを
含むリボヌクレオプロテイン(RNP)複合体を変性させることなく、ビオチン競合溶出によって回収
することができます。
そのため、SDSなどを用いた変性溶出法に比べ回収物への非特異的タンパク質の混入を抑え
る利点があり、目的のRNAと相互作用するタンパク質の同定や機能未知な新規lncRNAの機能
解析を行うアプリケーションに有用です。
<Tamavidin®2-REV ~ビオチンとの可逆的結合性能~>
Takakura, Y. et al.: "Tamavidin® 2-REV : an engineered tamavidin with reversible biotin-binding
capability.", J. Biotechnol., 164(1), 19-25(2013).
Tamavidin®2-REVは、新規アビジン様タンパク質「Tamavidin®2」の改変体です。ビオチンとの結合力
を低減することにより、可逆的なビオチン結合複合体を形成することができます。これにより、過剰ビ
オチンの添加により、ビオチン化分子の競合溶出が可能です。
(従来のアビジン/ストレプトアビジンとビオチンとの結合力は非常に強固で、不可逆的に結合します)
【キット内容】 10回用
○ RPD Capture Magnetic Beads
・・・500μL
○ RPD Wash Buffer
・・・55mL
○ RPD Cell Lysis Buffer
・・・25mL
○ RPD Reconstitution Buffer
・・・1,500μL
○ RPD Biotin Elution Buffer
・・・1,000μL
【操作手順 概要】
データ ~HOTAIR RNA を用いたRNA Pull Down Assay~
(kDa)
4% SDS溶液 溶出
キット添付ビオチン溶液 溶出
HOTAIR
HOTAIR
Mock
Sample buffer溶出
Sample buffer溶出
キット添付ビオチン溶液 溶出
Mock
4% SDS溶液 溶出
HOTAIR
M
HOTAIR
本キット
0.1% Input
Sample buffer溶出
M
HOTAIR
(kDa)
Sample buffer溶出
: ベイトRNA
従来品
ストレプトアビジン磁気ビーズ
Mock
キット添付ビオチン溶液 溶出
HOTAIR
キット添付ビオチン溶液 溶出
Mock
4% SDS溶液 溶出
Sample buffer溶出
Mock
HOTAIR
4% SDS溶液 溶出
HOTAIR
Sample buffer溶出
Sample buffer溶出
HOTAIR
HOTAIR
Sample buffer溶出
Mock
0.1% Input
M
WB
本キット
ストレプトアビジン磁気ビーズ
0.1% Input
従来品
銀染色
: ベイト RNA
100
Ezh2
75
250
150
銀染色
100
ベイトRNA : ビオチン標識HOTAIR RNAセンス鎖
溶出 : Sample Buffer、4%SDS溶液、キット添付ビオチン溶液
サンプル: K562細胞(1×107細胞)のトータルセルライセート
75
50
Western Blot
一次抗体:抗Ezh2抗体
二次抗体:抗ウサギIgG(Fc), モノクローナル抗体,
POD結合(code No. 016-23943)
37
25
従来品と比較して本キットでは低バックグラウンドでRNA結
合タンパク質を回収。
20
15
コードNo.
品名
規格
容量
希望納入価格(円)
297-77501
MagCaptureTM RNA Pull Down Assay Kit
遺伝子研究用
10回用
58,000
■ MagCaptureTM Tamavidin®2-REV
■ MagCaptureTM HP Tamavidin®2-REV
本品はTamavidin®2-REVの磁気ビーズ結合品です。粒子径の異なる2種類をご用意しています。
※ MagCaptureTM HP Tamavidin®2-REV は低粒子径タイプです。
データ ~HOTAIR RNA を用いたRNA Pull Down Assay/MagCaptureTM Tamavidin®2-REV
SDS sample buffer Elution
Antisense
M
MagCaptureTM
Tamavidin®2-REV
Sense
(kDa)
Antisense
従来品 Streptavidin
磁気ビーズ
Mock
WB
Sense
Antisense
Sense
Mock
Antisense
M
Sense
(kDa)
Mock
従来品 Streptavidin MagCaptureTM
磁気ビーズ
Tamavidin®2-REV
Mock
SDS sample buffer Elution
銀染色
100
250
Ezh2
75
150
100
Streptavidinとの性能比較
75
銀染色
ベイトRNA : ビオチン標識HOTAIR RNAセンス鎖
溶出 : Sample Buffer
サンプル: K562細胞(5×106細胞)のトータルセルライセート
50
Western Blot
一次抗体:抗Ezh2抗体
二次抗体:抗ウサギIgG(Fc), モノクローナル抗体,
POD結合(code No. 016-23943)
37
25
20
従来品と比較して本キットでは低バックグラウンドでRNA結合タン
パク質を回収。
15
10
データ ~HOTAIR RNA を用いたRNA Pull Down Assay/MagCaptureTM HP Tamavidin®2-REV
銀染色
SDS sample buffer Elution
WB
MagCaptureTM MagCaptureTM HP
Tamavidin®2-REV Tamavidin®2-REV
SDS sample buffer Elution
MagCaptureTM MagCaptureTM HP
Tamavidin®2-REV Tamavidin®2-REV
MagCaptureTM Tamavidin®2-REVとの回収量比較
銀染色
ベイトRNA : ビオチン標識HOTAIR RNAセンス鎖
溶出 : Sample Buffer
サンプル: K562細胞(5×106細胞)のトータルセルライセート
Western Blot
一次抗体:抗Ezh2抗体
二次抗体:抗ウサギIgG(Fc), モノクローナル抗体,
POD結合(code No. 016-23943)
MagCaptureTM HP Tamavidin®2-REV を用いることでRNA結合タン
パク質の回収量(SDS sample buffer溶出)が向上した。
コードNo.
136-18341
133-18611
品名
MagCapture
MagCapture
規格
容量
希望納入価格(円)
Tamavidin®2-REV
遺伝子研究用
2mL
40,000
HP Tamavidin®2-REV
遺伝子研究用
2mL
58,000
TM
TM
Tamavidin®2 組換え体 シリーズ
キノコの一種であるタモギダケ(Pleurotus cornucopiae)からクローニングされたアビジン様
ビオチン結合タンパク質Tamavidin®2のアミノ酸改変型のラインアップです。従来のTamavidin®2
の特長に加え、各製品それぞれに異なった特長がありますので、用途に応じて使い分けがで
きます。
耐熱性 ※2 有機溶媒耐性
ビオチン結合速度定数 ビオチン解離速度定数
分子量
品名
等電点(pl)※1
Tamavidin®2
7.4
Tm=85℃
あり
(1.0±0.5)×106
Tamavidin®2-REV
8
Tm=75℃
-
(1.3±0.5)×106
(1.5±0.4)×10-5
約60kDa
6
(ka(M-1S-1))
(kd(S-1))
(4量体)
検出限界値以下 ※4 約60kDa
Tamavidin®2-LPI
6
Tm=65℃
-
(1.2±0.1)×10
検出限界値以下
約60kDa
Tamavidin®2-HOT
7.23
高耐熱性
高耐性 ※3
(3.0±1.7)×105
検出限界値以下
約60kDa
※1 等電点:Tamavidin®2-LPIのみ実測値。他はアミノ酸配列より算出した値。
※2 耐熱性(Tm値):ビオチン結合活性が加熱前の50%となる20分加熱温度。Tamavidin®2-HOTについては、99.9℃、30分間加熱後も結合活性90%以上を保持する
のでTm値の算出不可。
※3 高耐性:40-50% DMSO中。
※4 検出限界値:5×10-6(kd(S-1))
コードNo.
209-18261
品名
205-18263
Tamavidin®2, recombinant
特長
規格
‐
203-18264
203-19401
209-19403
202-19351
208-19353
209-19361
205-19363
容量
1mg
希望納入価格(円)
5mg
25,000
25mg
120,000
1mg
18,000
5mg
70,000
8,500
Tamavidin®2-REV, recombinant
ビオチンと可逆
的結合性
Tamavidin®2-LPI, recombinant
非特異的結合
低減性
1mg
12,000
5mg
48,000
Tamavidin®2-HOT, recombinant
超耐熱・有機溶
媒耐性
1mg
18,000
5mg
70,000
免疫化学用
ライセンスについて ・・・Tamavidin®は日本たばこ産業株式会社の登録商標です。Tamavidin®2は日本たばこ産業株式会社か
らライセンスを受けて販売しております。
●本文に記載しております試薬は、試験・研究用にのみ使用されるもので、「医薬品」、「食品」、「生活用品」などとして使用できません。
●希望納入価格には消費税等が含まれておりません。 ●希望納入価格は予告なく変更する場合がございますがご了承下さい。
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