試薬 キット到着後の保存状態 Lysis Buffer 室温 Bind I Buffer 室温 Bind

FormaPure-2 070108
Agencourt FormaPure Kit プロトコール
キット内容物の保存条件
試薬
キット到着後の保存状態
Lysis Buffer
室温
Bind I Buffer
室温
Bind II Buffer
4℃
Wash Buffer
室温
Proteinase K
-20℃
Proteinase K Buffer
室温
抽出精製プロトコール
(1)キット初回使用時のみのステップ:Proteinase K に専用バッファー(PK Buffer)を下
記用量(40mg/mL)加え、よく溶解する(高濃度の溶液のため、泡立ちに気をつけながら溶
解する)。溶液はマイナス 20℃で保存する。
添加するPKBuffer量
50 Prep Kit 96 Prep Kit 384 Prep Kit
1.2mL
2.3mL
2.3mL/tube
*50 サンプル用キット(FormaPure Kit – Small もしくは FormaPure Starter Kit)の場合は、PK チューブに
Proteinase K Buffer を直接加える。96 サンプル用キット(FormaPure Kit – Medium)あるいは 384 サンプル
用キット(FormaPure Kit – Large)の場合は、別の容器で溶解する。
(2)キット初回使用時のみのステップ:Wash Buffer に 100%イソプロパノールを下記用
量で加える。よく混和し、室温に保存する。
50 Prep Kit 96 Prep Kit 384 Prep Kit
添加するisopropanol量
15mL
28mL
112mL/tube
*ステップ(1)
(2)はキット初回使用時のみのステップ。2回目以降のキット使用は下記ステップ1よ
り始める。
1.1サンプルあたり 20uL の Binding Buffer II と 300uL の 100%イソプロパノールを混合す
る(用事調整:例
10 サンプルの場合、200uL の Binding Buffer II と 3mL の 100%イソプロ
パノールを混和する)。
2.チューブもしくは 96 ウェルプレートに、Lysis Buffer を 200uL 分注する。
3.FFPE 切片(10 ミクロンを 1~5 切片:10mg まで)をチューブもしくは 96 ウェルプレ
ートに入れ、70~72℃で 60 分インキュベート。
*このインキュベーションを過度に行うと RNA にダメージを与える場合があるので注意が必要。
4.ステップ(1)で調整した PK 溶液 20uL を加え、よく混和する(ピペッティング 2 回
以上)。
5.55℃で 60 分インキュベートする。続いて 2 分間、氷上で冷やす。
6.上記ステップ5のライゼートを、新たなチューブもしくは 96 ウェルプレートに移す。
7.150uL の Bind I Buffer と、ステップ1で調整した 320uL の Bind II Buffer を加える。ピ
ペッティング 5 回以上でよく混ぜた後、55℃で 5 分間インキュベートする。
8.Magnetic 6-tube Stand もしくは Ring Super Magnet Plate 上で 5 分間静地。
*溶液が透明になったことを確認した上で次のステップに進む。
9.Magnetic 6-tube Stand もしくは Ring Super Magnet Plate 上に、チューブもしくは 96 ウェ
ルプレートを静地したまま、磁性ビーズに触れないように溶液をピペッティングで吸い取
る。
*この操作は Magnetic 6-tube Stand にチューブを静置いたまま、もしくは Ring Super Magnet Plate 上に 96
ウェルプレートを静地したまま行う。寄せられた磁性ビーズが溶液内で崩れてしまった場合は、数 uL の上
清を残す。
RNA のみの抽出:ステップ13に進む(DNase 処理を行う場合はステップ10~12の洗
浄は必要無い)。
DNA および RNA の同時抽出:下記ステップに進む。
10.Magnetic 6-tube Stand もしくは Ring Super Magnet Plate から、チューブもしくは 96 ウ
ェルプレートを移動させ、300uL の Wash Buffer を加える。ピペッティング 5 回以上でよく
混和後、1 分間放置。
11.続いて Magnetic 6-tube Stand もしくは Ring Super Magnet Plate 上で、チューブもしく
は 96 ウェルプレートを 1 分間静地。
*溶液が透明になったことを確認した上で次のステップに進む。
12.磁性ビーズに触れないように溶液をピペッティングで吸い取る。
*この操作は Magnetic 6-tube Stand にチューブを静置いたまま、もしくは Ring Super Magnet Plate 上に 96
ウェルプレートを静地したまま行う。寄せられた磁性ビーズが溶液内で崩れてしまった場合は、数 uL の上
清を残す。
13.Magnetic 6-tube Stand もしくは Ring Super Magnet Plate から、チューブもしくは 96 ウ
ェルプレートを移動させ、750uL の 70%エタノールを加える。ピペッティング 5 回以上で磁
性ビーズを良く混和する。
14.Magnetic 6-tube Stand もしくは Ring Super Magnet Plate 上に、チューブもしくは 96 ウ
ェルプレートを 1 分間静地。
*溶液が透明になったことを確認した上で次のステップに進む。
15.磁性ビーズに触れないように溶液をピペッティングで吸い取る。
*この操作は Magnetic 6-tube Stand にチューブを静置いたまま、もしくは Ring Super Magnet Plate 上に 96
ウェルプレートを静地したまま行う。寄せられた磁性ビーズが溶液内で崩れてしまった場合は、数 uL の上
清を残す。
RNA のみの抽出:下記ステップに進む。
DNA および RNA の同時抽出:ステップ21に進む。
16. Magnetic 6-tube Stand もしくは Ring Super Magnet Plate から、チューブもしくは 96
ウェルプレートを移動させ、調整した 100uL の DNase 溶液を加える。
*DNase 溶液を用事調整する―80uL のヌクレアーゼフリー水と、10uL の 10X DNase buffer(cat# 8170G,、
Ambion 社)、10uL の DNaseI(cat#2222、Ambion 社)を混和する。
17.ピペッティング 5 回以上で DNase 溶液と磁性ビーズを良く混和後、37℃で 15 分間イ
ンキュベートする。
18.550uL の Wash Buffer を加え、ピペッティング 5 回以上で良く混合する。その後、室
温で 10 分間インキュベート。
*DNase 溶液を除かず、ステップ20後のチューブもしくは 96 ウェルプレートに直接 Wash Buffer を加え
る。
19.Magnetic 6-tube Stand もしくは Ring Super Magnet Plate 上に、チューブもしくは 96 ウ
ェルプレートを 10 分間静地。
*溶液が透明になったことを確認した上で次のステップに進む。
20.磁性ビーズに触れないように溶液をピペッティングで吸い取る。
*この操作は Magnetic 6-tube Stand にチューブを静置いたまま、もしくは Ring Super Magnet Plate 上に 96
ウェルプレートを静地したまま行う。寄せられた磁性ビーズが溶液内で崩れてしまった場合は、数 uL の上
清を残す。
21.Magnetic 6-tube Stand もしくは Ring Super Magnet Plate から、チューブもしくは 96 ウ
ェルプレートを移動させ、750uL の 70%エタノールを加える。ピペッティング 5 回以上で磁
性ビーズを良く混和する。
22.Magnetic 6-tube Stand もしくは Ring Super Magnet Plate 上に、チューブもしくは 96 ウ
ェルプレートを 5 分間静地。
*溶液が透明になったことを確認した上で次のステップに進む。
23.磁性ビーズに触れないように溶液をピペッティングで吸い取る。
*この操作は Magnetic 6-tube Stand にチューブを静置いたまま、もしくは Ring Super Magnet Plate 上に 96
ウェルプレートを静地したまま行う。寄せられた磁性ビーズが溶液内で崩れてしまった場合は、数 uL の上
清を残す。
24.Magnetic 6-tube Stand もしくは Ring Super Magnet Plate から、チューブもしくは 96 ウ
ェルプレートを移動させ、500uL の 90%イソプロパノールを加える。ピペッティング 5 回以
上で磁性ビーズを良く混和後、70℃で 3 分間インキュベートする。
25.Magnetic 6-tube Stand もしくは Ring Super Magnet Plate 上に、チューブもしくは 96 ウ
ェルプレートを 1 分間静地。
*溶液が透明になったことを確認した上で次のステップに進む。
26.磁性ビーズに触れないように溶液をピペッティングで吸い取る。
*この操作は Magnetic 6-tube Stand にチューブを静置いたまま、もしくは Ring Super Magnet Plate 上に 96
ウェルプレートを静地したまま行う。
27.24~26の 90%イソプロパノールによる洗浄ステップをもう 1 度繰り返す。
28.Magnetic 6-tube Stand もしくは Ring Super Magnet Plate から、チューブもしくは 96 ウ
ェルプレートを移動させ、750uL の 70%エタノールを加える。ピペッティング 5 回以上で磁
性ビーズを良く混和する。
29.Magnetic 6-tube Stand もしくは Ring Super Magnet Plate 上に、チューブもしくは 96 ウ
ェルプレートを 1 分間静地。
*溶液が透明になったことを確認した上で次のステップに進む。
30.磁性ビーズに触れないように溶液をピペッティングで吸い取る。
*この操作は Magnetic 6-tube Stand にチューブを静置いたまま、もしくは Ring Super Magnet Plate 上に 96
ウェルプレートを静地したまま行う。寄せられた磁性ビーズが溶液内で崩れてしまった場合は、数 uL の上
清を残す。
31.10 分間静地し、風乾。
*エタノールの残留が見えないまで十分静地するが、過度に風乾しない。
32.Magnetic 6-tube Stand もしくは Ring Super Magnet Plate から、チューブもしくは 96 ウ
ェルプレートを移動させ、80uL のヌクレアーゼフリー水を加える。ピペッティング 5 回以
上で磁性ビーズをリサスペンド後、65~70℃で 30 秒間インキュベートする。
*溶出液量はサンプル量や下流のアプリケーションに合わせて変動させることができるが、少なくとも
40uL は必要。潜在的な磁性ビーズのキャリーオーバーのリスクを減らすためには、溶出液量を増やす。
33.Magnetic 6-tube Stand もしくは Ring Super Magnet Plate 上に、チューブもしくは 96 ウ
ェルプレートを移し、1 分間静地後、核酸溶出液を分取する。
*溶液が透明になったことを確認した上で溶出液を分取する。