仕様書【PDF:105KB】 - Nite 独立行政法人 製品評価技術基盤機構

別紙
合成時解読法(SBS)用
シーケンス試薬(200 サイクル)
仕
様
書
独立行政法人 製品評価技術基盤機構
1.目的
独立行政法人製品評価技術基盤機構(以下「当機構」という。)バイオテクノロジー
センターでは、知的基盤整備計画等に基づき、「我が国のバイオ産業の発展に貢献する
ための微生物遺伝資源の情報付加」、「産業界のニーズに基づく微生物遺伝資源が生産
する物質の情報等の収集や共同事業の実施」等の業務を行っている。
これらの業務では、高速解析ゲノムシーケンサーを活用して、環境中から抽出した DNA
試料を解析することによって、菌叢や、遺伝子機能に関する情報収集を行う必要がある。
また、RNA 試料の網羅的解析によって、発現の有無及び発現量を推定する必要がある。
当該装置に使用する、伸長反応と蛍光の読み取りステップを繰り返し、大量の塩基配
列の解読を行うための合成時解読法(SBS:Sequencing by Syntheses)によるシーケン
ス試薬を調達する。
2.仕様
TruSeq
SBS
Kit
v3- HS (200Cycles)( 品番 : FC-401-3001) イル ミ ナ 株 式 会社 製
と同等以上のものであること。
なお、主な仕様を以下に示す。
(1) 解読塩基数
HiSeq 1000 システムにおいて、本試薬を使ってメーカー標準プロトコルによりゲノ
ム解析(ペアエンドシーケンス)を行ったとき、DNA 試料の1リードあたりの解読長
が、両末端 100bp ずつ以上であること。
(2) 解析データの再現性
上記(1)によりゲノム解析を行ったときの解析結果は、クオリティー30(99.9%の正
確さ)以上の塩基が 80%以上の良好なシーケンスデータが得られること。
(3) 試薬の反応量及び反応時間
1ランで 200Gbp 以上のデータを出力し、9日間以内に終了できる反応量及び反応時
間であること。
(4) 組成
dNTP を基質として含有し、DNA 合成酵素、蛍光物質、保護基等を組成とするキット
であること。
3.数量
1ラン
4.納入期限
平成28年10月14日(金)まで
5.納入場所
東京都渋谷区西原2-49-10
当機構
別館3階
試薬保管室(別館3南330)
6.品質保持期間
品質保持期間が、納品後2か月以上あること。ただし、品質保持のために維持すべき
保存温度は、常温から-80℃までの範囲内とする。
「合成時解読法(SBS)用シーケンス試薬(200 サイクル)」機能証明書作成要領
「合成時解読法(SBS)用シーケンス試薬(200 サイクル)」の見積合わせの公開に参加す
る者においては、本要領に基づき機能証明書を作成し提出すること。
1.明記する項目(別紙1にならい作成及び記入すること。)
(1)納入予定物品の品名及び品番
(2)製造業者名
(3)仕様
ⅰ)同等品を納入予定の場合は、仕様書本文の「2.仕様」について、納入予定
物品の仕様を記載すること。また、要求仕様を満たしているか否かを判別でき
る資料として、カタログ、取扱説明書や必要があればデータ等を併せて提出す
ること。
ⅱ)TruSeq
SBS
Kit
v3-HS (200Cycles)(品番:FC-401-3001)イルミナ株式
会社製を納品予定の場合は、仕様の記載は不要とする。なお、カタログ等を提
出すること。
2.様式
機能証明書の様式は、A4たて判で横書き、日本語で作成することとし、この要領
に定める以外は任意とする。(参考
(別紙1)機能証明書作成例)
なお、機能証明書の表紙は別紙2によることとする。
3.提出方法
機能証明書は、別紙2の表紙、機能証明書、カタログ等の順序で綴り、次のとおり提
出すること。
(1)提出部数:書面1部
(2)提出場所:独立行政法人製品評価技術基盤機構
(3)提出期限:平成28年8月23日(火曜日)
(4)提出方法:郵送又は提出場所に持参
財務・会計課
15時必着
契約担当
(別紙1)機能証明書作成例
「合成時解読法(SBS)用シーケンス試薬(200 サイクル)」機能証明書
1.品名及び品番
品
名
:
○○○○○○
品
番
:
○○○○
2.製造業者名
○○○株式会社
3.仕様
例1)機能証明作成要領1(3)ⅰ)の場合
仕様書記載事項
(1) 解読塩基数
当社証明事項
(1) 解読塩基数
HiSeq 1000 システムにおいて、本試薬を
HiSeq 1000 システムにおいて、本試薬を
使ってメーカー標準プロトコルによりゲノ 使ってメーカー標準プロトコルによりゲノ
ム解析(ペアエンドシーケンス)を行った ム解析(ペアエンドシーケンス)を行った
とき、DNA試料の1リードあたりの解読長が とき、DNA試料の1リードあたりの解読長が
、両末端100bpずつ以上であること。
、両末端100bpずつの解読が可能である。
↓
以下同様に記載
↓
以下同様に記載
以上、すべての事項について、仕様を満たしています。
例2)機能証明作成要領1(3)ⅱ)の場合
カタログ等のとおり、全ての事項について、仕様を満たしています。
4 . 品質保持期間については、指定された要件で納品致します。
5.責任の所在
「合成時解読法(SBS)用シーケンス試薬(200 サイクル)」について、すべての事項を
□□□□株式会社が責任を持って対応いたします。
(別紙2)
平成
年
月
日
独立行政法人 製品評価技術基盤機構
企画管理部長
殿
会社名
住
所
代表者名
印又はサイン
「合成時解読法(SBS)用シーケンス試薬(200 サイクル)」機能証明書の
提出について
「合成時解読法(SBS)用シーケンス試薬(200 サイクル)」の見積合わせの公開に参加
するにあたり要求仕様を満たしていることを証明するため、機能証明書作成要領により
作成した機能証明書を提出します。