別紙 合成時解読法(SBS)用 シーケンス試薬(200 サイクル) 仕 様 書 独立行政法人 製品評価技術基盤機構 1.目的 独立行政法人製品評価技術基盤機構(以下「当機構」という。)バイオテクノロジー センターでは、知的基盤整備計画等に基づき、「我が国のバイオ産業の発展に貢献する ための微生物遺伝資源の情報付加」、「産業界のニーズに基づく微生物遺伝資源が生産 する物質の情報等の収集や共同事業の実施」等の業務を行っている。 これらの業務では、高速解析ゲノムシーケンサーを活用して、環境中から抽出した DNA 試料を解析することによって、菌叢や、遺伝子機能に関する情報収集を行う必要がある。 また、RNA 試料の網羅的解析によって、発現の有無及び発現量を推定する必要がある。 当該装置に使用する、伸長反応と蛍光の読み取りステップを繰り返し、大量の塩基配 列の解読を行うための合成時解読法(SBS:Sequencing by Syntheses)によるシーケン ス試薬を調達する。 2.仕様 TruSeq SBS Kit v3- HS (200Cycles)( 品番 : FC-401-3001) イル ミ ナ 株 式 会社 製 と同等以上のものであること。 なお、主な仕様を以下に示す。 (1) 解読塩基数 HiSeq 1000 システムにおいて、本試薬を使ってメーカー標準プロトコルによりゲノ ム解析(ペアエンドシーケンス)を行ったとき、DNA 試料の1リードあたりの解読長 が、両末端 100bp ずつ以上であること。 (2) 解析データの再現性 上記(1)によりゲノム解析を行ったときの解析結果は、クオリティー30(99.9%の正 確さ)以上の塩基が 80%以上の良好なシーケンスデータが得られること。 (3) 試薬の反応量及び反応時間 1ランで 200Gbp 以上のデータを出力し、9日間以内に終了できる反応量及び反応時 間であること。 (4) 組成 dNTP を基質として含有し、DNA 合成酵素、蛍光物質、保護基等を組成とするキット であること。 3.数量 1ラン 4.納入期限 平成28年10月14日(金)まで 5.納入場所 東京都渋谷区西原2-49-10 当機構 別館3階 試薬保管室(別館3南330) 6.品質保持期間 品質保持期間が、納品後2か月以上あること。ただし、品質保持のために維持すべき 保存温度は、常温から-80℃までの範囲内とする。 「合成時解読法(SBS)用シーケンス試薬(200 サイクル)」機能証明書作成要領 「合成時解読法(SBS)用シーケンス試薬(200 サイクル)」の見積合わせの公開に参加す る者においては、本要領に基づき機能証明書を作成し提出すること。 1.明記する項目(別紙1にならい作成及び記入すること。) (1)納入予定物品の品名及び品番 (2)製造業者名 (3)仕様 ⅰ)同等品を納入予定の場合は、仕様書本文の「2.仕様」について、納入予定 物品の仕様を記載すること。また、要求仕様を満たしているか否かを判別でき る資料として、カタログ、取扱説明書や必要があればデータ等を併せて提出す ること。 ⅱ)TruSeq SBS Kit v3-HS (200Cycles)(品番:FC-401-3001)イルミナ株式 会社製を納品予定の場合は、仕様の記載は不要とする。なお、カタログ等を提 出すること。 2.様式 機能証明書の様式は、A4たて判で横書き、日本語で作成することとし、この要領 に定める以外は任意とする。(参考 (別紙1)機能証明書作成例) なお、機能証明書の表紙は別紙2によることとする。 3.提出方法 機能証明書は、別紙2の表紙、機能証明書、カタログ等の順序で綴り、次のとおり提 出すること。 (1)提出部数:書面1部 (2)提出場所:独立行政法人製品評価技術基盤機構 (3)提出期限:平成28年8月23日(火曜日) (4)提出方法:郵送又は提出場所に持参 財務・会計課 15時必着 契約担当 (別紙1)機能証明書作成例 「合成時解読法(SBS)用シーケンス試薬(200 サイクル)」機能証明書 1.品名及び品番 品 名 : ○○○○○○ 品 番 : ○○○○ 2.製造業者名 ○○○株式会社 3.仕様 例1)機能証明作成要領1(3)ⅰ)の場合 仕様書記載事項 (1) 解読塩基数 当社証明事項 (1) 解読塩基数 HiSeq 1000 システムにおいて、本試薬を HiSeq 1000 システムにおいて、本試薬を 使ってメーカー標準プロトコルによりゲノ 使ってメーカー標準プロトコルによりゲノ ム解析(ペアエンドシーケンス)を行った ム解析(ペアエンドシーケンス)を行った とき、DNA試料の1リードあたりの解読長が とき、DNA試料の1リードあたりの解読長が 、両末端100bpずつ以上であること。 、両末端100bpずつの解読が可能である。 ↓ 以下同様に記載 ↓ 以下同様に記載 以上、すべての事項について、仕様を満たしています。 例2)機能証明作成要領1(3)ⅱ)の場合 カタログ等のとおり、全ての事項について、仕様を満たしています。 4 . 品質保持期間については、指定された要件で納品致します。 5.責任の所在 「合成時解読法(SBS)用シーケンス試薬(200 サイクル)」について、すべての事項を □□□□株式会社が責任を持って対応いたします。 (別紙2) 平成 年 月 日 独立行政法人 製品評価技術基盤機構 企画管理部長 殿 会社名 住 所 代表者名 印又はサイン 「合成時解読法(SBS)用シーケンス試薬(200 サイクル)」機能証明書の 提出について 「合成時解読法(SBS)用シーケンス試薬(200 サイクル)」の見積合わせの公開に参加 するにあたり要求仕様を満たしていることを証明するため、機能証明書作成要領により 作成した機能証明書を提出します。
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