Ne 10 eduDV クリックしてください ネオン(Ne)原子の電子(波動関数)を 計算して三次元可視化してみましょう! Ne 10 00. Automatic 【データ自動入力】 クリックしてください Ne 10 AUTO 21. 対称なし 【単原子】 クリックしてください Ne 10 Atom 原子番号 01~20 クリックしてください Ne 10 10 Ne Neon 2 6 [He] 2s 2p クリックしてください Ne 10 「f01」タグが 表に出ています f01: 原子位置と原子番号が書いて あるDV-Xαの入力ファイル Ne 10 f08e ネオン原子の電子 (原子軌道関数) のエネルギー準位表 軌道名 エネルギー(eV) 電子数 Ne 10 「f01」タグをクリック して表に出して下さい f01: 原子位置と原子番号が書いて あるDV-Xαの入力ファイル Ne 10 クリックしてください F01がアクティブな 状態でVESTAを 起動します VESTA Properties … Ne 10 クリックしてください Properties Ne 10 ダイアログボックス Unit cell (単位格子) Line (線) OK Do not show (非表示) Ne 10 Edit – Edit Data – Volumetric Data… Ne 10 Import… Isosurfaces: 等値表面描画に用いるデータ Ne 10 Ne2p-1p1.scat ネオンの2px軌道 1m1: l 1p1: l 10: l =1, m =1, m =1, m =-1, : py軌道 =+1, : px軌道 =0, : pz軌道 (方位量子数) (磁気量子数) (方位量子数) (磁気量子数) (方位量子数) (磁気量子数) Ne 10 1. Add to current data 2. OK Ne 10 1. Apply 2. OK 等値表面(曲面)の 値を変更する Ne 10 Properties… 等値表面(曲面)の値が大きすぎる (波動関数の図が小さすぎる)ので、 値を小さくして図を大きくする Ne 10 Isosurfacesタグ クリック Isosurface level: 0.002 Ne 10 OK Ne 10 拡大(Zoom in) Ne 10 ドラッグして波動関数 (等値曲面図)を回転させる Ne 10 Show modelのチェックを外す Ne 10 Toolsタグをクリック Rotation modes: Animationを選択 Ne 10 File – Exit でVESTAを終了 Ne 10 いいえ(N) Ne 10 ファイル(F) – 全終了(Q) 秀丸エディタを終了します Ar 18 eduDV クリックしてください アルゴン(Ar)原子の電子(波動関数)を 計算して三次元可視化してみましょう! Ar 18 00. Automatic 【データ自動入力】 クリックしてください Ar 18 AUTO 21. 対称なし 【単原子】 クリックしてください Ar 18 Atom 原子番号 01~20 クリックしてください Ar 18 18 Ar Argon 2 6 [Ne] 3s 3p クリックしてください Ar 18 「f01」タグが 表に出ています f01: 原子位置と原子番号が書いて あるDV-Xαの入力ファイル Ar 18 f08e アルゴン原子の電子 (原子軌道関数) のエネルギー準位表 軌道名 エネルギー(eV) 電子数 Ar 18 「f01」タグをクリック して表に出して下さい f01: 原子位置と原子番号が書いて あるDV-Xαの入力ファイル Ar 18 クリックしてください F01がアクティブな 状態でVESTAを 起動します VESTA Properties … Ar 18 クリックしてください Properties ダイアログボックス Unit cell (単位格子) Line (線) OK Do not show (非表示) Ar 18 Ar 18 Edit – Edit Data – Volumetric Data… Ar 18 Import… Isosurfaces: 等値表面描画に用いるデータ Ar 18 Ar3p-1p1.scat アルゴンの3px軌道 1m1: l 1p1: l 10: l =1, m =1, m =1, m =-1, : py軌道 =+1, : px軌道 =0, : pz軌道 (方位量子数) (磁気量子数) (方位量子数) (磁気量子数) (方位量子数) (磁気量子数) Ar 18 Add to current data OK Ar 18 1. Apply 2. OK 等値表面(曲面) の値を変更する Ar 18 Properties… Isosurfacesタグ Ar 18 等値表面(曲面)の値が小さすぎる (波動関数の図が大きすぎる)ので、 値を大きくして図を小さくする クリック Isosurface level: 0.1 Ar 18 OK Ar 18 拡大(Zoom in) Ar 18 ドラッグして波動関数 (等値曲面図)を回転させる Ar 18 Show modelのチェックを外す Ar 18 Toolsタグをクリック Animation を選択 2px軌道と違い、 3px軌道は位相 が入れ子構造 Ar 18 File – Exit でVESTAを終了 Ar 18 いいえ(N) Ar 18 ファイル(F) – 全終了(Q) 秀丸エディタを終了します H2O eduDV クリックしてください 水(H2O)分子の電子(波動関数)を 計算して三次元可視化してみましょう! H2O 00. Automatic 【データ自動入力】 クリックしてください H2O AUTO 07. C2v対称 【折れ線AB2型分子】 クリックしてください H2O c2v12n (ノンスピン版 ・全自動実行)… クリックしてください H2O H2O 水分子 ノンスピン版 クリックしてください 「f01」タグが 表に出ています f01: 原子位置と原子番号が書いて あるDV-Xαの入力ファイル f08e 水分子の電子 (分子軌道) のエネルギー準位表 軌道名 エネルギー(eV) 電子数 HOMO = 1b2軌道, LUMO = 4a1軌道 「f01」タグをクリック して表に出して下さい f01: 原子位置と原子番号が書いて あるDV-Xαの入力ファイル クリックしてください F01がアクティブな 状態でVESTAを 起動します VESTA H2 O Properties … クリックしてください Properties ダイアログボックス OK H2 O Unit cell (単位格子) Line (線) Do not show (非表示) H2 O Edit – Edit Data – Volumetric Data… H2 O Import… Isosurfaces: 等値表面描画に用いるデータ H2 O 005_1b2.sca 水の1b2分子軌道 004_3a1: 3a1分子軌道(HOMO-1) 005_1b2: 1b2分子軌道(HOMO) 006_4a1: 4a1分子軌道(LUMO) H2 O Add to current data OK H2 O 1. Apply 2. OK H2 O 等値表面(曲面)の 値を変更する Properties… Isosurfacesタグ H2 O 等値表面(曲面)の値が大きすぎる (波動関数の図が小さすぎる)ので、 値を小さくして図を大きくする クリック Isosurface level: 0.002 H2 O OK H2 O 拡大(Zoom in) H2 O ドラッグして波動関数 (等値曲面図)を回転させる H2 O Toolsタグをクリック Animation を選択 H2 O Dragに戻す H2 O Edit – Edit Data – Volumetric Data… H2 O Delete 005_1b2.scaファイル (HOMO)をクリックして選択 反転、Deleteボタンで削除 H2 O Import… Isosurfaces: 等値表面描画に用いるデータ 006_4a1.sca H2 O 水の4a1分子軌道 004_3a1: 3a1分子軌道(HOMO-1) 005_1b2: 1b2分子軌道(HOMO) 006_4a1: 4a1分子軌道(LUMO) H2 O Add to current data OK H2 O 1. Apply 2. OK 等値表面(曲面)の 値を変更する H2 O Properties… Isosurfacesタグ H2 O 等値表面(曲面)の値が大きすぎる (波動関数の図が小さすぎる)ので、 値を小さくして図を大きくする クリック Isosurface level: 0.02 H2 O OK H2 O 拡大(Zoom in) H2 O ドラッグして波動関数 (等値曲面図)を回転させる H2 O Toolsタグをクリック Animation を選択 H2 O Dragに戻す H2 O Edit – Edit Data – Volumetric Data… H2 O Delete 006_4a1.scaファイル (LUMO)をクリックして選択 反転、Deleteボタンで削除 H2 O Import… Isosurfaces: 等値表面描画に用いるデータ H2 O CHG3D.scat 水の電子密度 CHG3D: 水分子の電子密度 POT3D: 水分子の静電ポテンシャル H2 O Add to current data OK H2 O Import… Surface coloring: 等値表面の彩色に用いるデータ H2 O POT3D.scat 水の静電ポテンシャル CHG3D: 水分子の電子密度 POT3D: 水分子の静電ポテンシャル H2 O Add to current data OK H2 O 1. Apply 2. OK H2 O 等値表面(曲面)の 値を変更する Properties… Isosurfacesタグ H2 O 等値表面(曲面)の値が大きすぎる (電子密度の図が小さすぎる)ので、 値を小さくして図を大きくする クリック Isosurface level: 0.02 H2 O OK H2 O 拡大(Zoom in) 静電ポテンシャルマップ ~電子の僅かな偏りを見る~ H2 O 赤い箇所:δ− 電子の多い所 青い箇所:δ+ 電子の少ない所 ドラッグして静電ポテンシャルマップ (等値曲面彩色図)を回転させる Toolsタグをクリック Animation を選択 H2 O H2 O Dragに戻す H2 O File – Exit でVESTAを終了 H2 O いいえ(N) H2 O ファイル(F) – 全終了(Q) 秀丸エディタを終了します C6H6 eduDV クリックしてください ベンゼン(C6H6)の電子(波動関数)を 計算して三次元可視化してみましょう! C6H6 00. Automatic 【データ自動入力】 クリックしてください C6H6 AUTO 13. D6h対称 【A6B6型分子】 クリックしてください C6H6 d6h66n (ノンスピン版 ・全自動実行) クリックしてください C6H6 C6H6 ベンゼン分子 ノンスピン版 クリックしてください 「f01」タグが 表に出ています f01: 原子位置と原子番号が書いて あるDV-Xαの入力ファイル f08e ベンゼン分子の電子 (分子軌道) のエネルギー準位表 HOMO = 1e1g LUMO = 1e2u 軌道名 エネルギー(eV) 電子数 F08E.hlgap ベンゼン分子の HOMOとLUMOの エネルギー差 eV cm-1(波数) HOMO = 1e1g LUMO = 1e2u nm(波長) 「f01」タグをクリック して表に出して下さい f01: 原子位置と原子番号が書いて あるDV-Xαの入力ファイル クリックしてください VESTA F01がアクティブな 状態でVESTAを 起動します C6H6 Properties … クリックしてください Properties ダイアログボックス OK Unit cell (単位格子) Line (線) Do not show (非表示) C6H6 C6H6 Edit – Edit Data – Volumetric Data… C6H6 Import… Isosurfaces: 等値表面描画に用いるデータ C6H6 020_1e1g.sca 縮退:同じエネルギー準位で 完全に重なり合っていること エネルギーは重なり合って いるが、波動関数の形は違う 020_1e1g: 1e1g(HOMO) 021_1e1g: 1e1g(HOMO) 022_1e2u: 1e2u(LUMO) 023_1e2u: 1e2u(LUMO) 二重縮退 二重縮退 C6H6 Add to current data OK C6H6 1. Apply 2. OK C6H6 拡大(Zoom in) C6H6 ドラッグして波動関数 (等値曲面図)を回転させる C6H6 Toolsタグをクリック Animation を選択 C6H6 Dragに戻す C6H6 Edit – Edit Data – Volumetric Data… C6H6 Delete 020_1e1g.scaファイル (HOMO)をクリックして選択 反転、Deleteボタンで削除 C6H6 Import… Isosurfaces: 等値表面描画に用いるデータ C6H6 022_1e2u.sca 縮退:同じエネルギー準位で 完全に重なり合っていること エネルギーは重なり合って いるが、波動関数の形は違う 020_1e1g: 1e1g(HOMO) 021_1e1g: 1e1g(HOMO) 022_1e2u: 1e2u(LUMO) 023_1e2u: 1e2u(LUMO) 二重縮退 二重縮退 C6H6 Add to current data OK C6H6 1. Apply 2. OK C6H6 Toolsタグをクリック Animation を選択 C6H6 Dragに戻す C6H6 Edit – Edit Data – Volumetric Data… C6H6 Delete 022_1e2u.scaファイル (LUMO)をクリックして選択 反転、Deleteボタンで削除 C6H6 Import… Isosurfaces: 等値表面描画に用いるデータ C6H6 CHG3D.scat CHG3D: 水分子の電子密度 POT3D: 水分子の静電ポテンシャル C6H6 Add to current data OK C6H6 Import… Surface coloring: 等値表面の彩色に用いるデータ C6H6 POT3D.scat CHG3D: 水分子の電子密度 POT3D: 水分子の静電ポテンシャル C6H6 Add to current data OK C6H6 1. Apply 2. OK C6H6 等値表面(曲面)の 値を変更する Properties… Isosurfacesタグ C6H6 等値表面(曲面)の値が大きすぎる (電子密度の図が小さすぎる)ので、 値を小さくして図を大きくする クリック Isosurface level: 0.02 C6H6 OK 静電ポテンシャルマップ ~電子の僅かな偏りを見る~ C6H6 赤い箇所:δ− 電子の多い所 青い箇所:δ+ 電子の少ない所 ドラッグして静電ポテンシャルマップ (等値曲面彩色図)を回転させる C6H6 Toolsタグをクリック Animation を選択 C6H6 Dragに戻す C6H6 File – Exit でVESTAを終了 C6H6 いいえ(N) C6H6 ファイル(F) – 全終了(Q) 秀丸エディタを終了します UF6 eduDV クリックしてください 六フッ化ウラン(UF6)の電子(波動関数)を 計算して三次元可視化してみましょう! UF6 00. Automatic 【データ自動入力】 クリックしてください UF6 AUTO 15. Oh対称 【AB6型分子】 クリックしてください UF6 oh16n (ノンスピン版 ・全自動実行) クリックしてください UF6 UF6 六フッ化ウラン分子 ノンスピン版 クリックしてください 「f01」タグが 表に出ています f01: 原子位置と原子番号が書いて あるDV-Xαの入力ファイル 計算開始時刻 計算終了時刻 oh16n_UF6_time.txt 六フッ化ウラン分子 の分子軌道計算に 要した計算時間 f08e 六フッ化ウラン分子の 電子(分子軌道)の エネルギー準位表 HOMO = 10t1u LUMO = 2a2u 軌道名 エネルギー(eV) 電子数 F08E.hlgap 六フッ化ウラン分子の HOMOとLUMOの エネルギー差 eV cm-1(波数) HOMO = 10t1u LUMO = 2a2u nm(波長) 「f01」タグをクリック して表に出して下さい f01: 原子位置と原子番号が書いて あるDV-Xαの入力ファイル クリックしてください VESTA F01がアクティブな 状態でVESTAを 起動します UF6 ウランとフッ素の結合の線が 引かれていない … UF6 Edit - Bonds … UF6 2. Search A2 bonded to A1 クリック 1. クリック UF6 F(フッ素) 1.6 Å では短すぎる ので 2.0 Å にする UF6 UF6 1. Apply 2. OK UF6 Properties … クリックしてください Properties ダイアログボックス OK Unit cell (単位格子) Line (線) Do not show (非表示) UF6 UF6 Edit – Edit Data – Volumetric Data… UF6 Import… Isosurfaces: 等値表面描画に用いるデータ UF6 071_10t1u.sca 縮退:同じエネルギー準位で 完全に重なり合っていること エネルギーは重なり合って いるが、波動関数の形は違う 071_10t1u: 10t1u(HOMO) 072_10t1u: 10t1u(HOMO) 073_10t1u: 10t1u(HOMO) 074_2a2u: 2a2u(LUMO) 三重縮退 UF6 Add to current data OK UF6 1. Apply 2. OK UF6 拡大(Zoom in) UF6 Toolsタグをクリック Animation を選択 UF6 Dragに戻す UF6 File – Exit でVESTAを終了 UF6 いいえ(N) UF6 ファイル(F) – 全終了(Q) 秀丸エディタを終了します
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