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多重比較
東邦大学 地理生態学研究室
柊 雅実
多重比較とは
:サンプル
:比較
多群における各群間での母平均の比較
(どの群とどの群に有意差があるか)
A
B
D
C
分散分析とは
何が違うのか?
分散分析ANOVAの限界
分散分析の帰無仮説
「各群の母平均は均等である」
分散分析では
どの群とどの群の母平均(A群とB群,B群とC群,etc…)
に有意差があるか分からない
多重比較が必要
t検定の繰り返し?
A
①
t検定を全群間に対して
繰り返せば良いのか?
(右図)
④
⑤
B
D
⑥
②
③
C
t検定をk回繰り返すごとに、
帰無仮説を棄却する危険率がk倍になる(第一種の過誤)
t検定を繰り返すだけではダメ
この危険率を補正した
種々の検定法が存在する
(これが「多重比較」)
多重比較における二つの立場
事前比較
:実行することが実験・調査の計画段階で
決められていた多重比較
(明確な仮説アリ)
事後比較
:実験終了後に検討したくなった多重比較
(明確な仮説ナシ)
ANOVA不要
ANOVA必要
分散分析後に実行しなければならない
無計画に事後比較を行うのは危険
検定方法の選択基準
着眼点
具体的な方法
・どの群間に興味があるか?
(2群間比較 or 対比較 or 対比 ?)
・事前比較か事後比較か
(ANOVA不要 or 必要 ?)
・各群のデータの正規性
(parametric or nonparametric
?)
自分の研究内容によって判断
明確な仮説があるかないかで判断
シャピロ・ウィルク検定、正規QQプロット、etc
・各群のデータの等分散性
(各群の分散が等しいか ?)
バートレット検定、etc
・各群のn数
(一致 or 不一致 ?)
自分のデータより判断
多重比較の検索表
大まかな区分
パラメトリック法
ノンパラメトリック法
有意水準の補正法
2群間比較:対照群と各群との比較
対比較:全ての2群同士を比較
対比:全ての対比を比較
方法名
比較
ANOVA
正規分布
分散
各群のn数
Tukey‐Kramer法
対比較
不要
正規分布
等分散
制限なし
Dunnett法
2群間
比較
不要
正規分布
等分散
制限なし
Williams法
2群間
比較
不要
正規分布
等分散
一致
Steel-Dwass法
対比較
不要
制限なし
制限なし
制限なし
Steel法
2群間
比較
不要
制限なし
制限なし
制限なし
Shirley‐Williams法
2群間
比較
不要
制限なし
制限なし
一致
Bonferoni/Dunn
法
2群間
比較
不要
制限なし
制限なし
制限なし
パラメトリック法 ①
Tukey-Kramer法
Tukey‐Kramer法
比較
ANOVA
正規分布
分散
各群のn数
対比較
不要
正規分布
等分散
制限なし
特徴
・もっとも一般的な方法で,全ての群間を比較する方法
・過去のTukey法は各群のデータ数(n)が一致する必要があったが,
Tukey‐Kramer法は一致しなくても良い
適用例
40歳男性における飲酒習慣と血圧との関連
収縮期血圧(mmHg)
飲酒者
非飲酒者
やめた
(n=100)
(n=80)
(n=90)
平均
平均
平均
130
125
135
全ての群間の差に興味がある
パラメトリック法 ②
Dunnett法
Dunnet法
比較
ANOVA
正規分布
分散
各群のn数
2群間比較
不要
正規分布
等分散
制限なし
特徴
・コントロール群と各群の平均値の比較
・Tukey-kramer法などに比べて,有意差が出やすい
非飲酒者と他の2群の比較
に興味がある
適用例
40歳男性における飲酒習慣と血圧との関連
収縮期血圧(mmHg)
飲酒者
非飲酒者
やめた
(n=100)
(n=80)
(n=20)
平均
平均
平均
130
125
135
パラメトリック法 ③
Williams法
Williams法
比較
ANOVA
正規分布
分散
各群のn数
2群間比較
不要
正規分布
等分散
一致
特徴
・Dunnett法と同じく,コントロール群と各群の比較
・ただし,n数の一致が条件
・群の母平均の順番が想定可能な場合,Dunneett法より検出力が良くなる
適用例
収縮期血圧(mmHg)
40歳男性における飲酒習慣と血圧との関連
非飲酒者
週一回飲酒
毎日飲酒
(n=50)
(n=50)
(n=50)
平均
平均
平均
125
130
135
ノンパラメトリック法
方法名
概要
①Steel‐Dwass法
Tukey-Kramer法のノンパラメトリック版
②Steel法
Dunnett法のノンパラメトリック版
③Shirley‐Williams法
Williams法のノンパラメトリック版
・ただし,ノンパラメトリックな多重比較には各群のサンプルサイズが10以上必要
有意水準の補正法
Bonferoni/Dunn法
Bonferoni/Dunn法
比較
ANOVA
正規分布
分散
各群のn数
2群間比較
不要
正規分布
等分散
制限なし
特徴
・多重比較検定として,ほとんどの場合に適用可能
・2群の検定を k 回繰り返すとき,有意確率を k 倍する方法
・応用範囲が広い反面,有意水準が厳しい
・特に群が多い場合,有意差が出にくい
適用例
40歳男性における飲酒習慣と血圧との関連
飲酒者
①
非飲酒者
②
①・②・③の内,
興味があるところだけ検定
③
やめた
検定回数を,有意確率にかける
まとめ
Tukey‐Kramer法
Dunnettt法(順序性なし)
or
Williams法(順序性あり)
コントロール群
第一群
第二群
注:多重比較法は今回話したものが全てではない
第51回日本生態学会大会(釧路)の自由集会
データ解析で出会う統計的問題
--多重検定と多重比較をめぐって
「企画の趣旨」より抜粋
2004年 企画者:粕谷英一・久保拓弥
・「多重検定や多重比較の効果の補正は,不適切な手法を選びやすく,
目的に合わない使い方の巣窟である」
・「統計学的な多重比較をするときに常に多重検定は必要か,
モデル選択でもっと簡単にならないか」
GLM?
(一般化線形モデル)
参考文献・サイト
山田作太郎・北田修一(2003) 『生物統計学入門』 成山堂
Michael J.Crawley 著 野間口謙太郎・菊池泰樹 訳 (2008)
『統計学:Rを用いた入門書』 共立出版
橋本修二(1997)「薬理試験における統計解析のQ&A‐多重比較に関する問題‐」.
日本薬理誌.Vol.110.325~332.
「私のための統計処理」 滋賀県立医科大の横田先生のHP
http://www.shiga-med.ac.jp/~koyama/index.html
「多重比較 multiple comparison」 大阪大学大学院薬学研究科のHP
http://www.ibaraki-kodomo.com/toukei/posthoc.html
「Rによる統計処理」 群馬大学の青木先生のHP
http://aoki2.si.gunma-u.ac.jp/R/index.html