プログラミング、計算機利用上のTips 分類 項目 計算機利用 計算機の利用について 補足資料 ページ Unix (Linux)の基本的なコマンド 容量制限について サーバ上のディスク容量のチェック方法 ターミナルで文字を大きくする方法 X11ターミナルで文字を大きくする方法 Fortran プログラミングについて 最近あった事例 : コンパイル・実行時のエラー コンパイルオプション 配列サイズを越えて使用していないかのチェック プログラムは正しそうなのに、エラーが出る場合 データファイルは正しそうなのに、読み込みエラーが出る場合 描画 グラフィックスの出力方法 Mac OSXの画面のキャプチャ (付:Windowsの画面のキャプチャ) 1 計算機の利用方法 ホスト計算機へのログイン方法 : Mac OS X ① 文字端末としての利用 ・「アプリケーション」→「ユーティリティ」→「ターミナル」を起動 「ssh ah.s.kyushu-u.ac.jp」 と打ち込み、enterキー ② X端末としての利用 ・「アプリケーション」→「ユーティリティ」→「XQuartz」(X11)を起動 → xtermが開く 「ssh -X ah.s.kyushu-u.ac.jp」 と打込み、enterキー 情報講義室ではログインIDの入力が不要だが、自宅等からの接続には必要 「ssh -X -l loginID ah.s.kyushu-u.ac.jp」 と打ち込み、enterキー ・いずれの場合も、接続されたら、パスワードの入力を行う。 2 計算機の利用方法 ホスト計算機へのログイン方法 (Mac OS X上) ②’ X端末としての利用 ※こちらのほうが使いやすいかもしれない。 ・「アプリケーション」→「ユーティリティ」→「ターミナル」を起動 「ssh -Y ah.s.kyushu-u.ac.jp」 と打込み、enterキー 接続されたら、パスワードの入力を行う。 ・「ターミナル」を使うので、日本語表示が可能。 3 計算機の利用方法 ホスト計算機への接続方法 : Windows ・文字端末としての利用 ・「tera term」等のターミナルソフトを起動 ・下左図のように設定して接続し、下右図の画面で「ユーザ名」にID, 「パスフレーズ」に パスワードを入力する。 4 基本的なLinux(UNIX)のコマンド(1) ls 現在のディレクトリの内容を表示 ls [ファイル1] [ファイル2] 指定したファイル名の一覧を表示 ls [ディレクトリ] 指定したディレクトリの内容を表示 ls -l [ディレクトリ] 指定したディレクトリ内のファイルの属性の表示 pwd 現在のディレクトリ名を表示 cd [ディレクトリ] 指定したディレクトリにカレントディレクトリを変更 cd ホームディレクトリへ移動 cat [ファイル] 指定したファイルの内容を表示 more [ファイル] 指定したファイルの内容をenterキーで進めながら表示 cp [ファイル1] [ファイル2] ファイル1の内容をファイル2にコピー rm [ファイル1] 指定したファイルを削除 rmdir [ディレクトリ] 指定したディレクトリを削除(ディレクトリが空の場合) rm -r [ディレクトリ] 指定したディレクトリを削除する。(ディレクトリ内の内容も削除) 5 基本的なLinux(UNIX)のコマンド(2) mv [ファイル1] [ファイル2] ファイル名を[ファイル1]から[ファイル2]へ変更 mv [ファイル] [ディレクトリ] 指定したファイルを指定したディレクトリへ移動 mkdir [ディレクトリ] ディレクトリを指定したディレクトリ名で作成 chmod ファイル・ディレクトリのパーミッション変更 ps プロセスの状態を表示 kill [プロセス番号] 指定したプロセスを強制終了 ex [ファイル] ラインエディタ emacs [ファイル] テキストエディタ vi [ファイル] テキストエディタ view [ファイル] テキストエディタ (Read only mode) man [コマンド名] 指定したコマンドのマニュアルの表示 6 容量制限について ~ 教育情報サービスのページの記載 • http://ecs.kyushu-u.ac.jp/?page_id=197 7 自分がどれくらい容量を使っているかの確認 ● Finderで、自分のIDの箇所をクリックした後、 「ファイル」メニュー→「情報を見る」を選択 「サイズ」の欄を見る(少し時間がかかる) 8 「ターミナル」で文字を大きくするには、 ● 「ターミナル」メニュー → 「環境設定」 9 「xterm」で文字を大きくするには、 (方法その1) ● 次の内容のファイルを作り、「.Xdefaults」という名前で保存する。 XTerm*VT100*font: 10x20 ● xterm上で次のコマンドを実行する。 $ xrdb .Xdefaults ● 「アプリケーション」メニューから、新たに「xterm」を実行する。 (方法その2) ● xtermを実行する際のオプションで、フォントサイズを指定する。 $ xterm -fn 10x20 (新しいウインドウが開く) ◯ 使えるフォントサイズは、5x7 5x8 6x9 6x10 6x12 6x13 7x13 8x13 7x14 9x15 8x16 10x20 12x24 など。 対応していないサイズを指定すると、デフォル 10 トのサイズになってしまう模様。 プログラミングについて ・いきなりプログラムを書くのではなく、計算式、計算手順を明 確にしておく。(特に複雑な処理の場合) ・フローチャートを書く。 ・プログラム中にwrite文を入れ、変数の値を書き出す。 ・簡単な例で検証する。 ・サブルーチン毎に動作確認をする。 11 最近あった事例 : コンパイル、実行時のエラー ・値を代入していない変数の値は、ゼロではなく、不定。 ・サブルーチンや関数の引数の型(real, integerなど)の不一致 ・宣言した配列サイズを超えて使おうとした。 ・fortran95(自由形式)では、1行の文字数が132文字まで。 複数行にわたって1つの式を書く場合は、継続行として、先行 する行の末尾に「&」をつける。 a=a+b+c a=a+b& +c 12 コンパイラオプションについて ・プログラム実行中にエラーが発生した場合にエラー情報を 出力させる方法として、コンパイラオプションの利用がある。 ・コンパイラによって、使えるものと使えないものがあるのに注 意。 使用例 目的 f95 ○○.f90 -fbounds-check プログラム実行時に、配列宣言した範囲を超えた 配列要素を使おうとしたときに、警告が表示される。 (gfortranでも使える) 13 プログラムは正しそうなのにコンパイルでエラーが出る場合 エラーメッセージに、「UTF-16がどうしたこうした」と出る場合、Emacsでプ ログラムを編集した際に、ファイルの先頭に妙な文字が入ってしまっているこ とがある。(Emacs上では見えないため、原因がわかりづらい。) 確認方法 $ cat ファイル名 として、画面上にファイルの中身が表示されるので、先頭に「??」があるか どうかを確認する。 対処方法 (「??」があった場合。根本的な解決ではないが。) ・ 上で、画面に表示されたものの「??」を除く部分をマウスで選択してコピー ・ Emacs等のエディタで、新しいファイルの編集を行い、コピーしたものを貼付け て、別名のファイルとして保存する。 14 プログラムは正しそうなのにコンパイルでエラーが出る場合(2) コンパイル時に、何も文字がない行でエラーが発生する場合は、 全角スペース(日本語文字の空白文字)が入っている可能性がある。 (エディタ上では見えないため、原因がわかりづらい。) 対処・確認方法 ・エラーが発生している行の左端に、コメント記号を入れてみる。 ・エラーが発生している行を消してみる。 ・ スペースの部分で1文字ずつ、全角文字が入っていないかをチェックする。 15 データは正しそうなのに実行時に読み込みエラーが出る場合 データファイル読み込み時に、プログラムもデータも正しそうなのに、「Fortran runtime error: End of file」のエラーメッセージが出る場合、Emacsでデータファ イルを編集した際に、中に妙な文字が入ってしまっていることがある。 (Emacs等からではその文字が見えないため、原因がわかりづらい。) 対処方法 ・ 怪しげなデータは捨ててしまって、新しくデータファイルを作り直す。 16 X Window Systemで描画プログラムを実行する場合 ● 「XQuarts, X11(xterm)」上で「ssh -X ah.s.kyushu-u.ac.jp」でログインし、 実行。 または、 ● 「ターミナル」でホスト計算機に「ssh -Y ah.s.kyushu-u.ac.jp」でログインし、 実行。 これをやらずに「ターミナル」上で実行すると、Segmentationなんとかというエ ラーメッセージが表示される。 ●コンパイルする場合は、「ターミナル」でも「XQuartz」でもどちらでもよい。 ● ホスト計算機にログインした時に、「.Xauthorityでエラーが発生」とかいう エラーメッセージが表示される場合は、個人の使用容量制限(100MB?)を オーバーしている可能性がある。 → 不要なファイルを削除。 だめなら、パソコンから一旦ログアウトしてみる。 17 グラフィックスの出力方法 X windowでディスプレイ上に表示し、作図結果を見る. eps形式でファイルに出力 ・ダブルクリックして「プレビュー」で開いて確認.(PDFに変換 される) ・Wordに貼付ける場合は、「挿入」→「写真」→「ファイルから の画像…」→ファイルを選択. (または、「挿入」→「図」→ファイルを選択) 18 Mac OSXで画面のキャプチャ 「アプリケーション」→「ユーティリティ」→「グラブ」 グラブを起動したら、「取り込み」→「ウインド ウ」と選択して、あとは表示に従って操作。 (参考)Windowsの場合は、 ・「Print Screen」を押すと、画面全体がクリップボードにコピーされる。後は、Word 等で「貼り付け」とする。 ・「Alt」+「Print Screen」をおすと、選択したウインドウのみがコピーされる。 19
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