DISS. ETH NO. 23374 Patterns and processes of forest biodiversity – new insights from remotely sensed habitat structure A thesis submitted to attain the degree of DOCTOR OF SCIENCES of ETH ZURICH (Dr. sc. ETH Zurich) presented by FLORIAN ZELLWEGER Master of Science UZH, University of Zurich born on 04.05.1979 citizen of Hauptwil (TG) accepted on the recommendation of Prof. Dr. Harald Bugmann, examiner Dr. Kurt Bollmann, co-examiner PD Dr. Jörg Müller, co-examiner 2016 Summary Forest structure, composition and associated habitat quality are key variables for analysing patterns and processes of forest biodiversity. Forest structure – the 3D distribution of vegetation in forests – affects the availability and diversity of resources and niches and provides a great variety of habitat elements, such as breeding and roosting sites, shelter and concealment. Based on ecological niche theory, it is expected that forest biodiversity is promoted by a rich and complex combination of structural components. However, measuring forest structure is challenging and traditional field sampling methods are resource demanding and limited in spatial coverage. Novel data and methods to measure forest structure are thus required to improve our understanding of its role for forest biodiversity. This thesis explores new avenues provided by remote sensing, particularly airborne Light Detection and Ranging (LiDAR), to advance in this field of research. The overarching goal was to analyse species diversity and habitat use of a broad variety of species and taxa by using contiguous and large-area airborne LiDAR measurements of forest structure. In Chapter 1 I used local (10 m2) species occurrences of vascular plants, bryophytes and snails across Swiss forests to investigate the relative importance of key predictors of species richness, i.e. climate, edaphic features, and forest structure. I mapped species richness for a selected region using a grain size of 30 m to allow for a fine-scale spatial evaluation of species richness of multiple taxa. Furthermore, I used National Forest Inventory data to infer potential target variables for forest managers to improve the in situ habitat quality for these taxa. I found that, besides climate, site factors related to forest structure, topography and soil pH were important predictors of species richness of all taxa. The strength and direction of the effect of these factors on species richness varied with taxa. Snail habitat had the largest potential for improvements by targeted forest management, e.g., by increasing the proportion of alluvial tree species or the amount of dead wood. This study promoted a multi-species approach for forest biodiversity conservation and exemplified the usefulness of highly resolved data of biotic and abiotic site factors for predicting, mapping and managing stand-scale species richness of multiple taxa. In Chapter 2 I showed how LiDAR-derived forest structure and associated habitat quality can be used to map the forest species richness of plants, butterflies and breeding birds at a grain size of 1 km2 across the forest landscape in Switzerland. I assessed the 3 relative importance of forest structure compared to climate and edaphic features and found that forest structure was an important predictor for all taxa, particularly for flying taxa such as birds and butterflies. Climate also had a large effect on all taxa. However, its effect on butterfly species richness was mainly indirect, via correlations with forest structure and slope, which again was related to land-use intensity. The response of species richness to environmental conditions was taxon-specific, as were the distribution patterns. Accounting for a range of taxa in spatially prioritising biodiversity conservation measures will thus be challenging. This study showed that the growing availability of LiDAR data greatly increases our abilities to contiguously describe forest structure and associated habitat quality across large areas. This furthers our understanding of niche-driven species assembly processes in forest landscapes. In Chapter 3 we studied whether the responses of bats to forest structure are determined by wing shape and echolocation call design, i.e. whether they are guildspecific. We used acoustic bat samples and related them to forest structural parameters derived from both LiDAR and observational field surveys. We found guild-specific responses to forest structure. A large scatter of vegetation elements along the vertical forest profile generally reduced the activity of bats in the forest interior, and edge specialist bats were more active with increasing roughness of the outer canopy surface. We found that bat-relevant forest structure was more reliably measured using LiDAR data than data collected in the field. We also found that leaf-off LiDAR represents the vertical forest structure better than leaf-on data. This study showed that bats respond to forest habitat structure in a functionally different way and that LiDAR can provide information on forest habitat structure that is not easily available from field surveys, not to mention contiguously across large areas. It further suggests that the amount of ecologically relevant information related to forest structure in leaf-off LiDAR should not be underestimated. LiDAR thus considerably increases the scope of inference from future studies of species-habitat-structure relationships. The main purpose of Chapter 4 was to compare the relative role of trophic interactions, vegetation structural complexity and the associated provision of niches and habitat elements, and environmental filtering for driving community assembly of vascular plants, butterflies and breeding birds in Switzerland. To this end, I related vegetation compositional and environmental distances to pairwise species composition dissimilarity matrices. I found a profound effect of producer (plant) on consumer (butterfly and bird) community dissimilarity, indicating strong trophic interactions and 4 non-independent distribution ranges. Together with the finding that climate (degreedays) predicted plant community dissimilarity, this study emphasises the need to account for differences in response times of interacting taxa in future assessments of climate change impacts on species distribution ranges. In this thesis I used large species and environmental, particularly LiDAR datasets to further our understanding of how forest structure affects species diversity and habitat use in forests. Forest structure and its complexity appeared to be universal predictors of species diversity and habitat use. Given the methods and data developed and applied herein, the relationship between forest habitat structure and biodiversity can now be analysed and mapped across large areas at an unprecedented level of detail. This will considerably increase our future abilities to evaluate, monitor and manage biodiversity in forests. 5 Zusammenfassung Die Struktur und Zusammensetzung des Waldes und die damit verbundene Habitatqualität sind Schlüsselvariablen für die Analyse der Waldbiodiversität. Die Waldstruktur – die dreidimensionale Verteilung der Vegetation im Wald – beeinflusst die Verfügbarkeit und Diversität von Ressourcen und Nischen und bietet eine grosse Vielfalt von Habitatelementen, wie beispielsweise Nist- und Schlafplätze oder Schutzund Versteckmöglichkeiten. Basierend auf der Theorie der ökologischen Nische geht man davon aus, dass die Waldbiodiversität durch eine reichhaltige und komplexe Kombination verschiedener struktureller Merkmale gefördert wird. Die Erfassung der Waldstruktur ist jedoch von jeher eine Herausforderung, denn traditionelle terrestrische Methoden sind teuer und räumlich oft auf kleine Gebiete begrenzt. Um das Verständnis des Zusammenhangs zwischen Waldstruktur und Waldbiodiversität zu verbessern, braucht es deshalb neue Methoden und Daten. In dieser Doktorarbeit untersuchte ich neue Möglichkeiten aus der Fernerkundung und speziell dem flugzeuggestützten Laserscanning (Light Detection and Ranging, LiDAR), um die Waldstruktur besser zu erfassen. Das übergeordnete Ziel bestand darin, flächendeckende und über grosse Gebiete verfügbare LiDAR-Messungen der Waldstruktur für die Analyse der Diversität und Habitatnutzung von verschiedenen Artengruppen anzuwenden. Im ersten Kapitel verwendete ich lokale (10 m2) Artennachweise von Gefässpflanzen, Moosen und Schnecken in Schweizer Wäldern, um die relative Bedeutung von Klima, Bodenmerkmalen und Waldstruktur für den Artenreichtum zu untersuchen. Dieser wurde in einer Beispielsregion mit einer Auflösung von 30 m kartiert, um eine räumlich feinmaschige Analyse des Artenreichtums zu ermöglichen. Des Weiteren verwendete ich Daten aus dem Landesforstinventar, um potentielle Zielgrössen für Forstbetriebe abzuleiten, mit welchen die Habitatqualität auf Bestandesebene verbessert werden kann. Neben dem Klima waren Standortsfaktoren wie Waldstruktur, Topographie und Boden-pH wichtige Prädiktoren für den Artenreichtum aller Artgruppen. Die Stärke und Richtung des Zusammenhangs zwischen dem Artenreichtum und diesen Faktoren war artgruppenspezifisch. Das grösste Potenzial für Förderungsmassnahmen durch gezielte forstliche Eingriffe haben Habitate für Schnecken. Beispielsweise wirken sich mehr Totholz sowie ein höherer Anteil an Baumarten, die typisch sind für Auen, positiv auf die Habitatqualität vieler Schneckenarten aus. Diese Studie zeigte, dass Massnahmen für die 6 Förderung der Waldbiodiversität die Verbreitungsmuster von verschiedenen Artengruppen berücksichtigen sollten. Ausserdem unterstreicht diese Studie den Wert von hochaufgelösten Daten zu biotischen und abiotischen Standortfaktoren für die Vorhersage, Kartierung und das Management von Artenvielfalt auf der Bestandesebene. Im zweiten Kapitel nutzte ich LiDAR und daraus abgeleitete Waldstrukturparameter, um den Artenreichtum von Gefässpflanzen, Schmetterlingen und Brutvögeln mit einer räumlichen Auflösung von 1 km2 in Schweizer Wäldern zu kartieren. Ich verglich die relative Bedeutung von Waldstruktur mit Klima und Bodeneigenschaften und fand heraus, dass die Waldstruktur den Artenreichtum aller Artgruppen erheblich beeinflusste. Zudem war das Klima für die Vorhersage des Artenreichtums aller Artgruppen wichtig. Auf den Artenreichtum der Schmetterlinge war der Effekt des Klimas mehrheitlich indirekt, da dieses mit der Waldstruktur und Hangneigung und die damit verbundene Landnutzungsintensität korrelierte. Die artgruppenspezifische Bedeutung der Umweltbedingungen führte zu einer unterschiedlichen räumlichen Verteilung des Artenreichtums pro Artengruppe. Es ist deshalb schwierig, bei Massnahmen zur Förderung der Biodiversität im Wald gleichzeitig mehrere Artgruppen zu berücksichtigen. Aus diesem Grund empfehle ich räumlich Prioritäten für die Förderung einzelner Artengruppen zu setzen. Diese Studie zeigte, dass die zunehmende Verfügbarkeit von LiDAR-Daten unsere Möglichkeiten für eine flächendeckende Beschreibung der Waldstruktur und der damit verbundenen Habitatqualität massgeblich verbessert. Dadurch können neue Erkenntnisse gewonnen werden, wie nischen-basierte Prozesse die Artenzusammensetzung in Wäldern mitbestimmen. Das Ziel des dritten Kapitels bestand darin herauszufinden, inwiefern die Aktivität von Fledermäusen von der Waldstruktur abhängt und ob ein allfälliger Zusammenhang von der Flügelform und den Eigenschaften der Echolokalisationsrufe mitbestimmt wird, d.h. ob er gildenspezifisch ist. Wir verwendeten akustische Aufnahmen von Fledermäusen und setzten sie in Beziehung zu Waldstrukturparametern, die wir sowohl mittels LiDAR als auch mit terrestrischen Feldaufnahmen erhoben hatten. In der Tat zeigte sich, dass Fledermäuse gildenspezifisch auf die Waldstruktur reagieren. Eine hohe Streuung der Vegetationselemente entlang des vertikalen Waldprofils hatte einen negativen Einfluss auf die Aktivität jener Fledermäuse, die oft im Waldesinnern anzutreffen sind. Bei Arten, die auf die Nutzung von Randlinien spezialisiert sind, erhöhte sich ausserdem die Aktivität in Beständen mit hoher Rauheit der Kronendachoberfläche. Wir fanden auch heraus, dass LiDAR aufschlussreichere Waldstrukturmessungen liefert als terrestrische 7 Feldaufnahmen. Die vertikale Struktur des Waldes wurde zudem besser quantifiziert mit LiDAR-Daten, die während der laubfreien Zeit erhoben wurden. Diese Studie zeigte, dass Fledermäuse in funktional unterschiedlicher Art und Weise auf Waldstrukturen reagieren. Zudem lieferte LiDAR verlässliche Informationen zu Waldstruktur und Habitatqualität, die mittels Felderhebungen nur sehr aufwändig, wenn überhaupt, erhoben werden können, geschweige denn flächendeckend über grosse Gebiete. Diese Studie machte auch deutlich, dass aus LiDAR-Befliegungen im Winter ökologisch wertvolle Informationen zur Waldstruktur gewonnen werden können. Somit ergeben sich durch LiDAR neue Möglichkeiten für Studien zu Art-Habitatstruktur Beziehungen. Das vierte Kapitel gibt Aufschluss über die relative Bedeutung verschiedener Mechanismen, welche die Zusammensetzung von Artengemeinschaften mitbestimmen. Ich untersuchte den Einfluss von trophischen Interaktionen, Umweltfilterung und struktureller Komplexität auf die Zusammensetzung von Gefässpflanzen-, Schmetterling- und Brutvogelgemeinschaften in der Schweiz. Zu diesem Zweck habe ich Unterschiede in der Pflanzenzusammensetzung sowie Unterschiede in verschiedenen Umweltfaktoren mit paarweisen Unterschieden in der Artenzusammensetzung in Beziehung gesetzt. Unterschiede in der Artenzusammensetzung der Produzenten (Pflanzen) hatten einen grossen Einfluss auf jene der Konsumenten (Schmetterlinge und Vögel), was auf starke trophische Interaktionen und gekoppelte Verbreitungen hindeutet. Zusammen mit dem Ergebnis, dass das Klima (Anzahl Grad-Tage) die Unterschiede in der Pflanzenzusammensetzung erklärte, legte diese Studie nahe, dass künftige Studien, welche die Auswirkungen des Klimawandels auf Artverbreitungen analysieren, den unterschiedlichen Anpassungszeiträumen von interagierenden Artengruppen Rechnung tragen sollten. Durch die Verwendung von umfangreichen Art- und Umwelt-, insbesondere LiDARDatensätzen, fördert diese Doktorarbeit unser Verständnis des Zusammenhangs zwischen Waldstruktur und Artenvielfalt sowie Habitatnutzung. Mit den hier verwendeten Methoden und Daten sind wir in der Lage, den Zusammenhang zwischen Waldstruktur und Biodiversität in einem beispielslosen Detailliertheitsgrad zu analysieren und über grosse Gebiete zu kartieren. Dies erhöht unsere künftigen Möglichkeiten, die Biodiversität im Wald zu evaluieren, zu beobachten und zu fördern. 8
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