Präsentation der Auftaktveranstaltung

Tag der Biotechnologie
Der Tag der Biotechnologie findet am 14.7.2015 von 13.00‐20.00 Uhr in der Peter‐Behrens‐Halle, Gustav‐Meyer‐Allee 25, 13355 Berlin statt.
Programm:
13.00‐14.30 Uhr: Bachelor‐Kolloquium
14.30‐16.00 Uhr: Festvortrag 16.00‐19.00 Uhr: Postershow der Promovenden
Ab 19.00 Uhr: Geselliger Abend mit Grillen und Getränken
Anmeldung über die Webseite:
https://www.biotech.tu‐berlin.de/menue/tag_der_biotechnologie/
Wahlpflichtliste A – BVT Veranstaltungen
VL/SE Betriebswirtschaftliche Projektplanung biotechnischer Prozesse (6LP)
Blockveranstaltung vom 26.4.16 bis 18.5.16, Schriftliche Prüfung, 26.‐28.4. 10‐16, 9.5.‐12.5. 10‐13, 13.5.‐18.5. 10‐16
Ackerstr. 76, Z20
Anmeldung bis 25.4.2016 per e‐mail an stefan.junne@tu‐berlin.de UND auf ISIS2 und Quispos
ODER
PR Projektierung biotechnologischer Prozesse (9LP)
Voraussetzung ist gleichzeitige Teilnahme am obigen Modul „Betriebswirtschaftliche Projektplanung biotechnischer Prozesse“
Blockveranstaltung vom 26.4.16 bis 18.5.16, Projektierungs / Businessplanprojektarbeit während des SS in Gruppen,
Abschlußpräsentation (nach Vereinbarung), Anmeldung bis 25.4.2016 per e‐mail an stefan.junne@tu‐berlin.de UND auf ISIS2 und Quispos
Wahlpflichtliste A – BVT Veranstaltungen
Unifying Concepts of Biomolecular Synthesis (6LP)
Zeit: 21.4. bis 23.6.16 jeweils Donnerstags 13‐17 Uhr, 27.6. bis 30.6.16 9‐17 Uhr
Ort: Ackerstr. 76, ACK Z20
Anmeldung: Quispos und auf ISIS2
Day
Thursday
Date
21.4.
Thursday
28.4.
Time
13‐15
15‐17
13‐16
16‐17
L1
S1
L2
Subject
Concepts of Biocatalysis
Introductory seminar to projects
The microbial use of sugars: a complex physiology of of simple biochemical reactions
Thursday
12.5.
13‐16
16‐17
Thursday
19.5.
13‐16
L4
Algae and DHA production
16‐17
S4
Project seminar
13‐16
L5
Biocatalysis of modified Nucleosides as bioactive compounds and drugs
16‐17
S5
Project seminar
13‐16
L6
Synthesis and production of bioactive peptides
16‐17
S6
Project seminar
Thursday
26.5.
2.6.
Stress responses in bioreactors
Project seminar
Neubauer
Andri Hutari / Peter Neubauer
Thursday
9.6.
13‐16
L7
Continuous bioprocessing ‐ from evolution in bioreactors to continuous processes
16‐17
Thursday
13‐17
S7
L8
Project seminar
16.6.
Project seminar
13‐17
S8
L9
16‐17
S9
Project seminar
10‐14
L10
in silico screening approaches for identification
of biocatalysts with desired properties (e.g., substrate specificity)
14‐17
13‐17
S10
L11
L12
Industrial scale production of peptide pharamceuticals and antibiotics
Synthetic biology and genome editing
10‐13
L13
Anaerobic biocatalysis of halogen compounds
16‐17
Thursday
Monday
Tuesday
Wednesday
Thursday
Thursday
Friday
23.6.
27.6.
28.6.
29.6.
30.6.
1.7.
9‐12
14‐17
9‐12
13‐17
10‐12
Biokatalytische Prozesse und Wertstoffrückgewinnung
Biocatalysis of modified Nucleosides as bioactive compounds and drugs
Sarah Kamel
Neubauer /Elvis Legala
Peter Neubauer /Christian Schipp
Thomas Grimm
Heba Yehia / Maryke Fehlau
Prof. Matthias Höhne, Univ. Greifswald
Project seminar
Anaerobic biocatalysis of halogen compounds
P1
P2
E
Neubauer
Project seminar
S2
L3
S3
Thursday
Lecturer
Neubauer
Group presentations
Group presentations Dr. Burghard König (Sandoz)
Johannes Kabisch
PhD students of Prof. Lorenz Adrian (UfZ Leipzig)
PhD students of Prof. Lorenz Adrian (UfZ Leipzig) and Peter Neubauer
Wahlpflichtliste A – BVT Veranstaltungen
Bioelektronik – SoSe 2016 (Birkholz)
Einführung in die Was haben Leben und IT gemeinsam?
Was sind ISFETs und was machen sie in DNA‐
Sequenzierern?
Wie intelligent können Mikrotiterplatten und Lab‐on‐
Chip Systeme noch werden?
Wie funktionieren Biosensoren?
Was steht zwischen Dir und dem Einsatz der Bioelektronik?
Wie sind Mikrochips für die eigenen Versuche zu nutzen?
Antworten in der ILV Bioelektronik
donnerstags am FGBVT, Z 20, 17h c. t. Einführung am 21.4. 2016; Details unter ISIS. Wahlpflichtliste A – BVT Veranstaltungen
Systembiotechnologie
Zeit: Mittwochs, 17 ct – 19 Uhr, Start 27.4.2016
Ort: Ackerstr. 76, Seminarraum ACK268
Anmeldung und weitere Information: Prof. Dr. Peter Götz (goetz@beuth‐hochschule.de)
Ingenieurwissenschaftliche
Methoden zur quantitativen
Beschreibung biologischer
Systeme
Wahlpflichtliste A – BVT Veranstaltungen
Industrielle anaerobe Bioprozesse – Bioenergie, Biogas, Biosolvents (6LP)
Zeit: 29.8. bis 2.9.2016 jeweils 10.00 bis 16.00 Uhr
Ort: Ackerstr. 76, ACK Z20
Anmeldung: Quispos und auf ISIS2 (bis 30.6.2016) Mindestteilnehmerzahl 10
Weitere Information: Dr. Ing. Stefan Junne (stefan.junne@tu‐berlin.de) This image cannot currently be
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Fakultät III Prozesswissenschaften Fachgebiet für Mess‐ und Regelungstechnik
Regelungstechnisches Praktikum Biotechnologie
Prof. R. King / F. Neddermeyer ([email protected])
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• 3 LP (7 Tage am Fachgebiet)
• Portfolioprüfung (Protokoll, Aussprache)
• Voraussetzung: Grundlagen der Regelungstechnik für BT
und Chemieing. oder GMRT (6 LP ?)
• Freitag 29.4.2016 um 16:00 im ER 103
Vorbesprechung zur Terminfindung
Vorlesung
Regulation der Genexpression
Veranstaltungsnummer: 0335 L 123 Block 05.09.-16.09.2016, HS TIB 21c, 12-16h
Dozent: Dr. Henry Fechner
Informationen auf ISIS2
INHALTE
•
Genexpression und Regulation der Transkription
•
Prinzipien der Genregulation / Transkriptionsfaktoren
•
Chromatinstruktur und Transkriptionsregulation
•
Posttranskriptionale Regulation der Genexpression – RNA Interferenz
•
Transmembranrezeptoren
•
Transmembranrezeptoren mit Tyrosinspezifischer Proteinkinase-Aktivität
•
G-Protein gekoppelte Rezeptoren
•
Nukleäre Rezeptoren
•
Second Messenger
•
Regulation des Zellzyklus
•
Regulierbare Genexpressionssysteme
Praktikum
Betreuer: Dr. Henry Fechner
Ziel: Entwicklung einer Gentherapie für die Behandlung der Herzinsuffizienz
Praktikumsinhalt:
1. RNA Interferenz als molekulares Werkzeug
Veranstaltungsnummer: 0335 L 120
‐ Zellkultur
Block 19.09.-23.09.2016, 9-18h
Praktikumsraum 423, 325
‐ Transfektion von Zellen mit Plasmiden
2. Gentherapie und Genexpression
Veranstaltungsnummer: 0335 L 122 ‐ Anwendung des Tet‐On Genexpressionssystems Block 26.09.-30.09.2016, 9-18h
Praktikumsraum 423, 325
‐ Luciferase‐Indikatorgenexpressionssysteme
‐ Anwenden von shRNA und amiRs
gegen Phospholamban
‐ Herstellung und Testung von Adeno‐
Assoziierten Virus (AAV)‐Vektoren
Einschreibung 01.07‐15.7.2015 auf ISIS 2; 16 Teilnehmer je Praktikum.
Prüfungsausschuss Master
• PA‐Vorsitzender: Jens Kurreck (Stellvertreter: Peter Neubauer)
– Alle E‐mails an:
• [email protected]‐berlin.de
– Das Sekretariat ist derzeit nicht besetzt und das Fachgebiet hat zur Zeit nur einen Assistenten. Bitte planen Sie etwas Zeit für die Antworten ein.
• Sprechstunden: mittwochs 9.30 bis 10.00 Uhr
– Keine Anmeldung
– Sprechstunde am 23.4. fällt aus, weitere Abweichungen werden durch Aushang am Sekretariat (TIB 17A, R. 322) bekanntgegeben
PR Zelldifferenzierung humaner Stammzellen
02.7. bis 07.07. 09.7. bis 14. 07.
SE Vertiefung Med. Biotechnologie
20.06. bis 01. 07. 10:00 bis 17:00
Moderne Techniken in der in in vitro Diagnostik
18.4. ‐ 11. 7. TIB 825
Montags 17‐18:30
PR 14.7. 9:30 ‐ 13:30
Forensische Genetik
15.7. 16:00 Vorbesprechung
18.7. bis 22. 7. 13:30 bis 18:30 in TIB 582
VL SE Membranproteine
DI. 18:00 bis 20:00
Thielalle 63
Applied and Molecular Microbiology
Courses for Master Students
SoSe 2016
Prof. Dr.-Ing. Vera Meyer
IBioT, Department Applied and Molecular Microbiology
Lehre FG AMM SoSe 2016
VL Angewandte und Molekulare Mikrobiologie (0335 L 058)
(2 SWS)
Block:
04.07. bis 08.07.2016
Zeit:
10.00 bis 16.00 Uhr
Ort:
Seminarraum 401, (TIB; Geb. 17a)
Vorbesprechung: 27.06.2016 17.00 bis 18.00 TIB 401
Diese Lehrveranstaltung wird von Vera Meyer gehalten.
Lehre FG AMM SoSe 2016
VL Angewandte und Molekulare Mikrobiologie (0335 L 058)
(2 SWS)
1) Systems biology in applied microbiology
-> an omics view on microbial fermentation (bacteria, yeast, fil. fungi)
-> genomics, transcriptomics, proteomics, metabolomics
-> complexity of biological networks
-> databases and data evaluation
Weight : 560 t
Speed : 900 km/h
Passengers : 850
3,000,000 components
Genes : 3002
Proteins : ~ 3000
Metabolites: ~ 800 - 1000
7,000 components
Lehre FG AMM SoSe 2016
VL Angewandte und Molekulare Mikrobiologie (0335 L 058)
(2 SWS)
2) Synthetic biology in applied microbiology
-> minimal genomes, synthetic life, ethical considerations
-> standardization, modularisation, designing biological systems
Computers
Cells
Integrated Circuits
AND
OR
Logic Gates
NOT
Standardized parts
Lehre FG AMM SoSe 2016
SE Systembiologie der Mikroorganismen (0335 L056)
(2 SWS)
Block:
11.07. bis 22.07.2016
Zeit:
10.00 bis 15.00 Uhr
Ort:
Seminarraum 401 (TIB, Geb. 17a)
Termin zur Vorbesprechung und Platzverteilung wird über ISIS/per
Aushang bekannt gegeben!
Diese Lehrveranstaltung wird von Herrn Dipl.-Ing. Paul Schäpe gehalten.
Lehre FG AMM SoSe 2016
SE Systembiologie der Mikroorganismen (0335 L056)
(2 SWS)
-> microbial genome databases
-> evaluation of transcriptomic data
-> gene co-expression networks
-> R, Bioconductor, Cytoscape
-> FetGOAT, TFBSF, …
-> focus: Aspergillus niger
Lehre FG AMM SoSe 2016
PR Praxis der angewandten und molekularen Mikrobiologie (0335L057)
(3 SWS)
Block:
25.07. bis 29.07.2016
Zeit:
10.00 bis 17.00 Uhr
Ort:
Praktikumsraum 494 (TIB, Geb. 17a)
Termin zur Vorbesprechung und Platzverteilung wird über ISIS/per Aushang
bekannt gegeben!
Diese Lehrveranstaltung wird von Herrn Dr. Sascha Jung gehalten.
Lehre FG AMM SoSe 2016
PR Praxis der angewandten und molekularen Mikrobiologie (0335 L057)
(3 SWS)
-> topic: functional genomics of Aspergillus niger
-> methods:
-> Gibson cloning, PCR, Southern Blot
-> chemiluminescence detection, fluorescence microscopy
Functional studies
Deletion of
GOI
Overexpression
of GOI
GFP reporter to study
localisation of GOI
Lehre FG AMM SoSe 2016
Peer-to-Peer teaching in der Mikrobiologie (10 LP)
Wahlfach für Biotechnologen im Masterstudiengang bzw.
Bachelorstudiengang (5./6. Semester).
Anmeldung via E-Mail bis spätestens 22.4.16: [email protected]
Peer-to-Peer teaching II in der Mikrobiologie (6 LP)
Wahlfach für Biotechnologen im Masterstudiengang bzw.
Bachelorstudiengang (5./6. Semester).
Anmeldung via E-Mail bis spätestens 22.4.16 : [email protected]
Lehre FG AMM SoSe 2016
Genetik in der Biotechnologie (0335 L 044)
(1 SWS, Wahlfach)
Zeit:
Ort:
Beginn:
Donnerstag: 17.00 bis 18.00 Uhr
Hörsaal TIB 21 004
28.04.2016
Diese Lehrveranstaltung wird von Frau Prof. Dr. Christine Lang gehalten.
Anmeldung via E-Mail [email protected]
Other recommended courses
Synthetic Biology, IGEM
Prof. Ned Budisa (Fakultät II)
http://igem.biocat.tu-berlin.de/index.php
Other recommended courses
Astrobiologie (VL)
Prof. Schulze-Makuch (Fakultät II)
Other recommended courses
Astrobiologie (VL)
Prof. Schulze-Makuch (Fakultät II)
Last but not least: DTG Life-Science-Network
DTG: Deutsche Technion Gesellschaft
Technion: Israel Institute of Technology Haifa
• Life Science Network of the DTG offers the possibility for Master or PhD
students to join one of the participating Institutes for a 4 – 6 weeks research stay.
• Each of the German universities accepts up to five Technion students per year,
while each German university can send up to five students to the Technion.
• Each student is supported by a grant of 1000 € by the DTG
German Life—Science Network:
TUB, TU Hamburg-Harburg, TU München, TU Dresden, Uni Hanover
Contact TUB:
Vera Meyer
DTG
Marianne Krüger‐Jungnickel
TU Hochhaus TEL1515
Ernst‐Reuter‐Platz 7
D‐10587 Berlin
[email protected]
FG Bioanalytik
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
FG Bioanalytik – Angebotene Module
SS
Sommer Semester
• Advanced Bioanalytics (max. 18 LP)
•
•
•
•
Vorlesung + Seminar: 6 LP
Forschungsemester: 6 LP (ca. 120 h)
Forschungsemester: 12 LP (ca. 240 h)
in Planung: Praktikum NMR (B): 6 LP
WS Winter Semester
• Modern Mass Spectrometry (6 LP)
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
SS
Advanced Bioanalytics Vorlesung
Analyse von Biomolekülen (insb. Proteine)
strukturell
funktionell
quantitativ
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
SS
Advanced Bioanalytics Vorlesung
Analyse von Biomolekülen (insb. Proteine)
strukturell
•
•
•
•
•
•
funktionell
quantitativ
Massenspektrometrie
Biostatistik
Next‐Generation‐Sequencing
Kristallstrukturanalyse
Kernspinresonanzsprektroskopie
Elektronenmikroskopie
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
SS
Advanced Bioanalytics Vorlesung
Analyse von Biomolekülen (insb. Proteine)
strukturell
•
•
•
•
•
•
funktionell
quantitativ
Massenspektrometrie
Biostatistik
Next‐Generation‐Sequencing
Kristallstrukturanalyse
Kernspinresonanzsprektroskopie
Elektronenmikroskopie
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
SS
Advanced Bioanalytics Seminar
Schwierigkeit / Komplexität
Seminar zur Datenanalyse
• Big Data Handling
• Graphische Darstellung
• Statistik
• Methodenspezifisches
t
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
SS
Advanced Bioanalytics Seminar
Schwierigkeit / Komplexität
Seminar zur Datenanalyse
• Big Data Handling
• Graphische Darstellung
• Statistik
• Methodenspezifisches
t
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
Laptop bitte
mitbringen!
SS
Advanced Bioanalytics VL + Se
Mo 08‐10 Uhr
10‐12 Uhr
12‐14 Uhr
14‐16 Uhr
16‐18 Uhr
Di
Mi Vorlesung
Do
Seminar
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
Fr
SS
Advanced Bioanalytics VL + Se
Mo 08‐10 Uhr
10‐12 Uhr
12‐14 Uhr
14‐16 Uhr
16‐18 Uhr
Di
Mi Vorlesung
Do
Seminar
Fr
Ausnahme:
1. Vorlesung am Do 21.04. ‐‐ 8.30 Uhr
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
SS
Advanced Bioanalytics ‐ Registrierung
Registrierung via ISIS
Passwort: HSA‐BS3
Wichtig:
Fragebogen ausfüllen + Foto
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
SS
Advanced Bioanalytics ‐ Forschungssemester
• Mitarbeit in einem aktuellen Forschungsprojekt
• kein Skript ‐‐> Versuchsplanung im Team
• Leider nur sehr begrenzte Teilnehmerzahl
• Wir wollen:
• Engagement und Zuverlässigkeit
• Lust auf wissenschaftliches Arbeiten
Wir bieten:
• Team‐ und Laborerfahrung
• 6 LP (ca. 120 h)
• 12 LP (ca. 240 h)
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
SS
Advanced Bioanalytics ‐ Forschungssemester
E. Coli
E. Coli
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
SS
Advanced Bioanalytics ‐ Forschungssemester
E. Coli
E. Coli
Zellaufschluss / Probenvorbereitung
other methods...
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
SS
Advanced Bioanalytics ‐ Forschungssemester
E. Coli
E. Coli
Zellaufschluss / Probenvorbereitung
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
SS
Advanced Bioanalytics ‐ Forschungssemester
E. Coli
E. Coli
Zellaufschluss / Probenvorbereitung
x 100
x 100
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
SS
Advanced Bioanalytics ‐ Forschungssemester
E. Coli
E. Coli
Zellaufschluss / Probenvorbereitung
x 100
x 100
+ Maschinenlernen
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
SS
Advanced Bioanalytics ‐ Forschungssemester
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
WS
Modern Mass Spectrometry
• MMS will take place in WiSe
• Advanced Bioanalytics required
• Two blocks:
• soft skills
• mass spectrometry
Our goal:
• Give you practical skills that will prepare you for your thesis and beyond
• Make you a (budding) expert in mass spectrometry
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
WS
Modern Mass Spectrometry
Soft skills:
• How to read a paper?
• How to write a paper (thesis)?
• How to give a talk?
Presentations:
• Each student needs to give a talk about a recently published paper from the mass spectrometry field
• prepare a written summary (extended abstract) of the paper
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
WS
Modern Mass Spectrometry
Topics for the mass spectrometry part:
• Peptide and protein identification
• Quantitative proteomics ‐ disease vs. healthy proteomes
• Advanced acquisition techniques:
• Selected reaction monitoring
• Data independent acquisition
• 3D proteomics ‐ gain information about 3D structure of proteins
• …. Many more!
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
Functional Genomics in Environmental Biotechnology
Bakterien und Archaeen
relevant für die Umwelt- und Geomikrobiologie
Genomik, Physiologie, Biochemie und Metabolismus
Themen
• Umweltbiotechnologie (Bodensanierung, Plastik,
Chemikalienabschätzung, Methanbildung, …)
• Geomikrobiologie (Biomining, Aquifere, Böden,
Meeressedimente)
• Evolution
Methoden
• Bioinformatische Tools & Datenbanken
• Sequenzierung und Annotation mikrobieller Genome
• Proteomik
• Verwendung stabiler Isotope (13C, 15N, 2H)
• Single-Cell Methoden
Functional Genomics in Environmental Biotechnology
Vorlesung mit Seminar
Fachlicher Ergänzungsbereich - 0335 L 146 (freie Wahl)
Dozent:
PD Dr. Lorenz Adrian
Kontakt: [email protected]
Termine:
ab 25.04.2016
Montags 8:15 – 9:45 Uhr (n.V.)
Raum:
Abschluss:
LPs:
Info:
Gustav-Meyer-Allee, TIB21-004
Portfolioprüfung; Vortrag eines eigenen Projektes
3, Liste A
ISIS2 (ohne Passwort einschreiben)
Kurs unter Fachgebiet Angewandte Biochemie