Ablaufplan des Moduls Genetik 2

Ablaufplan Vorlesung und Praktikum Genetik 2
Stand: 13.10.15
Woche 1 (30.11.-04.12.15)
Montag
Dienstag
Mittwoch
Donnerstag
Freitag
Vorbesprechung Versuch 2
(Ziebart)
9:00-10:00
10:00-11:00
Parasitismus: Trypanosoma
als Modell
(Zellkultur, Tet-System,
GFP,
Fluoreszenzmikroskopie,
Durchflusszytometrie)
(Boshart)
Regulation
der Transkription
(Parniske)
Vorbesprechung Versuche
1, 3 und 4
(Brachmann)
Gene Silencing
(Parniske)
Versuch 1.1:
Auswertung der
Transformationsplatten
Versuch 3.1:
Ansetzen von Ü/N-Kulturen
11:00-12:00
"Deciphering the function of
trypanosome epigenome in
gene regulation and
immune evasion"
(Nicolai Siegel, Uni
Würzburg)
Vorbesprechung Versuch 2
(Ziebart)
Allgemeine Kurseinführung
und Sicherheitsbelehrung
(Brachmann)
Versuch 4.1:
Hefetransformation
Vorbesprechung Versuch 1,
DNA-Isolierung
(Brachmann)
12:00-13:00
Vorbesprechung Versuch 1
(Brachmann)
13:00-14:00
Versuch 4.1:
Ausplattieren der
Hefetransformanten
Versuch 3.1:
Verdünnung der Kulturen
Vorbesprechung Versuch 2
(Ziebart)
Versuch 1.2:
Plasmidisolation
Einrichten der Arbeitsplätze
Versuch 1.2:
Gelelektrophorese der
isolierten Plasmide
14:00-15:00
Versuch 1.1:
E. coli-Transformation
Versuch 2:
Einweisung in steriles
Arbeiten
Versuch 2.2:
Auswertung der
Trypanosoma-Kulturen
nach 24 h
(Auszählen und
Fluoreszenzmikroskopie)
15:00-16:00
Versuch 1.1:
Ausplattieren der E. coliTransformanten
Versuch 2.1:
Auszählen der TrypanosomaZellen
16:00-17:00
Versuch 2.1:
Verdünnung und Induktion
der Trypanosoma-Zellen
Versuch 2.1:
Induktion der TrypanosomaZellen
Versuch 1.2:
Ansetzen von Ü/N-Kulturen
1 Komplementation einer Auxotrophiemutante und Isolierung des mutierten Gens
2 Regulierte Genexpression und RNAi in Trypanosoma brucei
Versuche:
3 Herstellung von Taq DNA-Polymerase
4 Übertragung eines transkriptionellen Regulationssystems aus Lotus japonicus in Hefe und Tabak
Versuch 2.2 und 2.3:
Auswertung der
Trypanosoma-Kulturen
nach 48 h
(Auszählen, Fluoreszenzmikroskopie und
Durchflusszytometrie),
Abschlussbesprechung
Versuch 1.2:
Auswertung der
Gelelektrophorese
Versuch 3.1:
Induktion der E. coliKulturen
Ablaufplan Vorlesung und Praktikum Genetik 2
Stand: 13.10.15
Woche 2 (07.-11.12.15)
Montag
Dienstag
Mittwoch
Donnerstag
Freitag
Splicing
(Parniske)
Chromatin Restructuring
(Parniske)
Transcription Factors
(Parniske)
9:00-10:00
10:00-11:00
Vorbesprechung Versuch 3
(Ott)
11:00-12:00
Vorbesprechung Versuch 1
(Brachmann)
Vorbesprechung Versuch 3
(Ott)
Vorbesprechung Versuch 1
Restriktionsanalyse
(Brachmann)
DNA-Sequenzierung und
Sequenzanalyse
(Brachmann)
12:00-13:00
13:00-14:00
Versuch 3.1:
Zellaufschluß
Versuch 1.3:
Ansetzen von
Restriktionsreaktionen
Versuch 1.3:
Gelelektrophorese der
Restriktionsansätze
Versuch 3.2:
Gelelektrophorese der TestPCR
Versuch 3.1:
SDSPAGE der Proteinfraktionen
Versuch 1.3 und 1.4:
Auswertung der
Restriktionsansätze und der
Sequenzierungsreaktionen;
Bestimmung der potentiell
mutierten Gene
14:00-15:00
Versuch 1.4:
Ansetzen von Sequenzierungsreaktionen
Versuch 3.2:
Test-PCR zur Bestimmung
der Polymeraseaktivität
Versuch 4.1:
Vereinzelungsausstriche der
Hefetransformanten
15:00-16:00
Versuch 3.1:
Aufreinigung von Taq DNAPolymerase und Dialyse
Versuch 1.3:
Auswertung der
Gelelektrophorese
Versuch 3.1 und 3.2:
Auswertung der
Gelelektrophoresen;
Bestimmung der
spezifischen Aktivität der
Taq-Polymerase;
Abschlussbesprechung
16:00-17:00
Versuch 3.1:
Coomassiefärbung der SDSGele
Versuch 1.5:
Amplifikation von
Genen
1 Komplementation einer Auxotrophiemutante und Isolierung des mutierten Gens
2 Regulierte Genexpression und RNAi in Trypanosoma brucei
Versuche:
3 Herstellung von Taq DNA-Polymerase
4 Übertragung eines transkriptionellen Regulationssystems aus Lotus japonicus in Hefe und Tabak
PCRE. coli-
Ablaufplan Vorlesung und Praktikum Genetik 2
Stand: 13.10.15
Woche 3 (14.-18.12.15)
Montag
Dienstag
Mittwoch
Donnerstag
Praktikumsvorbesprechung
(Katzer)
Praktikumsvorbesprechung
(Katzer)
Versuch 4.1:
OD600-Messung und
Überimpfen der
Hefekulturen
Versuch 4.2:
Ansetzen der Färbung zur
Bestimmung der
β-Glucuronidaseaktivität
Tutorium zum Praktikum
(Brachmann)
Tutorium zum Praktikum
(Brachmann)
Freitag
9:00-10:00
Tutorium zur Vorlesung
(Parniske)
Symbiose
(Parniske)
10:00-11:00
11:00-12:00
Praktikumsvorbesprechung
(Katzer)
12:00-13:00
Versuch 4.2:
Ernte der
Agrobakterienkulturen
13:00-14:00
Versuch 1.5:
Aufreinigung der PCRProdukte
CRISPR/Cas und
Gentechnologie
(Parniske)
Versuch 1.5:
Gelelektrophorese der PCRProdukte
Versuch 1.6:
Auswertung der
Sequenzierungsreaktionen,
Abschlussbesprechung
Kursraum aufräumen
14:00-15:00
Versuch 4.2:
Transformation von
Tabakpflanzen
15:00-16:00
Versuch 1.5:
Auswertung der
Gelelektrophorese
Versuch 4.1:
Bestimmung und
Auswertung der βGalaktosidaseaktivität
Versuch 1.6:
Ansetzen von
Sequenzierungsreaktionen
Gemeinsame
Abschlussbesprechung
16:00-17:00
Versuch 4.1:
Ansetzen von
Übernachtkulturen
Versuch 4.2:
Bestimmung der βGlucuronidaseaktivität;
Auswertung und
Abschlussbesprechung
Zeit für Dokumentation,
Auswertung, Fragen, etc.
1 Komplementation einer Auxotrophiemutante und Isolierung des mutierten Gens
2 Regulierte Genexpression und RNAi in Trypanosoma brucei
Versuche:
3 Herstellung von Taq DNA-Polymerase
4 Übertragung eines transkriptionellen Regulationssystems aus Lotus japonicus in Hefe und Tabak
"CRISPR/Cas-assisted
genome engineering:
strategies and apllications"
(Sebastian Bultmann,
AG Leonhardt)

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