Chemische Fachinformation - Universität des Saarlandes

EDV-Anwendungen in der Organischen Chemie
Chemische Fachinformation:
Literatur und Datenbanken
• Chemische Literatur
• Chemische Fachzeitschriften
• Wissenschaftlicher Literaturservice - Datenbanken
• Aspekte der Literaturrecherche
• Die SULB
• Internetsuchmaschinen
• Datenbanken (Reaxys) und SciFinder
Literatur:
• „Organikum“, Kapitel B
OC-EDV, SS 2014, Prof. Dr. A. Speicher
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Wie entsteht „Chemische Literatur“ ?
Chemische Forschung: Hochschulen, Institute, Industrie...
Experiment: Stoffe, Reaktionen, Methoden, Studien, Theorien, Themen...
Originalarbeit
Protokollheft
Laborjournal
Abschlussarbeit
Doktorarbeit
Primärliteratur
Patentschrift
Übersichtsartikel
(Review)
Publikation in
Fachzeitschrift
„Handbücher“
peer-reviewed
Monographie
Lehrbuch
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Wichtige
Fachzeitschriften
für Organische Chemie:
Zugang
Einschränkung
Campus
Acta Chemica Scandinavica (bis 1999)
Acta Chem. Scand.
Angewandte Chemie (International Edition)
Angew. Chem. (Int. Ed.)
Australian Journal of Chemistry
Aust. J. Chem.
Beilstein Journal of Organic Chemistry
Beilstein J. Org. Chem
Canadian Journal of Chemistry
Can. J. Chem.





Chemische Berichte (bis 1997)
 European Journal of Inorganic Chemistry
Chem. Ber.

Chemical Communications
Chem. Commun.
Chemistry A European Journal
Chem. Eur. J.
Chemistry Letters
Chem. Lett.



European Journal of Organic Chemistry
Liebigs Annalen der Chemie (bis 1997)
Eur. J. Org. Chem.
Liebigs. Ann. Chem.

Helvetica Chimica Acta
Helv. Chim. Acta



Heterocycles
Journal of the American Chemical Society
J. Am. Chem. Soc. “JACS”
Journal of the Chemical Society: diverse der
Royal Society of Chemistry (RSC)
J. Chem. Soc.
…

Organic & Biomolecular Chemistry
Org. Biomol. Chem.
Journal of Heterocyclic Chemistry
J. Heterocycl. Chem.
Journal of Organic Chemistry
J. Org. Chem. “JOC”



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älter 1 Jahr
frei bis 1988
älter 3 Jahre
älter 1 Jahr
3
J. Organomet. Chem.

Journal für praktische Chemie (bis 2000)
Advanced Synthesis and Catalysis
J. Prakt. Chem.
Adv. Synth. Calal.

Organic Letters
Org. Lett.

Organometallics
Organometallics

Synlett
Synlett

1989-2007
Synthesis
Synthesis

1969-2007
Synthetic Communications
Synth. Commun.

älter 18 Mon.
Tetrahedron
Tetrahedron

befristet
Tetrahedron: Asymmetry
Tetrahedron: Asym.

befristet
Tetrahedron Letters
Tertrahedron Lett., “THL”

befristet
Accounts of Chemical Research
Acc. Chem. Res.

Chemical Reviews
Chem. Rev.

Chemical Society Reviews
Chem. Soc. Rev.

Journal of Organometallic Chemistry
Review-Zeitschriften:
 IP-kontrolliert; VPN
• Publikationssprache: Klare Tendenz zu Englisch!
• Finanzierung?
http://www.nationallizenzen.de/
• open-source?
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Zeitschriften - Abkürzungen:
• Lehrbücher, z. B. Organikum
• Chemical Abstracts Service:  http://www.cas.org/content/references/corejournals
Artikel in Zeitschriften werden „zitiert“ (zahlreiche Varianten und Konventionen):
A. Speicher*, K. Hollemeyer, E. Heinzle
Zitat:
Autoren
Titel
Rapid detection of multiple chlorinated bis(bibenzyls) in bryophyte crude
extracts using laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry
Rapid Commun. Mass Spectrom. 2001, 15(2), 124-127.
Zeitschrift, abgekürzt !
Jahr
Jahrgang
Heft
Seitenangabe
Der „Digital Object Identifier“ (DOI): http://dx.doi.org/
10.1002/1097-0231(20010130)15:2<124::AID-RCM203>3.0.CO;2-5
OC-EDV, SS 2014, Prof. Dr. A. Speicher
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Wie lese ich den ganzen Artikel ?
Online-Zugang zur Zeitschrift: kostenlos oder kostenpflichtig ??
Homepage der Zeitschrift suchen oder:
http://rzblx1.uni-regensburg.de/ezeit/search.phtml?bibid=SULB
alphabetische Liste:
http://ezb.uni-regensburg.de/fl.phtml?notation=&bibid=SULB&colors=7
Bereichsbibliothek Chemie ?? andere an UDS ?? UB ??
http://www.ntbib.uni-saarland.de/
 Anschauen und / oder kopieren
Online-Fernleihe über SULB oder "Subito" ( http://www.subito-doc.de )
Der „Artikel“:
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Suchen Sie folgende Artikel:
A. Speicher, M. Groh, M. Hennrich, A.-M. Huynh
Eur. J. Org. Chem. 2010, 6760-6778.
A. Speicher,* T. Backes, K. Hesidens, J. Kolz
Beilstein J. Org. Chem. 2009, 5, No. 71.
J. Deska, S. Hähn, U. Kazmaier,
Org. Lett. 2011, 13, 3210-3213.
H. Müller, M. Paul, D. Hartmann, V. Huch, D. Blaesius, A. Koeberle, O. Werz, J. Jauch
Angew. Chem. Int. Ed. 49, 2045-2049 (2010)
Daniel Poeckel, Lars Tausch, Nicole Kather, Johann Jauch, and Oliver Werz
Mol. Pharmacol. 70, 1071-1078 (2006)
Gajdzik, J.; Lenz, J.; Natter, H.; Kohring, G.-W.; Giffhorn, F.; Wenz, G.;
Hempelmann, R. ECS Trans. 2010, 25, (28), 13-20.
DOI: 10.1016/j.tetlet.2013.09.085
OC-EDV, SS 2014, Prof. Dr. A. Speicher
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Umfang chemischer Literatur (alle Chemiebereiche):
Zeitschriften mit „chemischem Inhalt“:
Originalarbeiten insgesamt:
Zuwachs pro Jahr:
ca. 8000
ca. 16 Mio (Stand: 2005)
ca. 500.000 Artikel
Wissenschaftlicher Literaturservice - Datenbanken
Forschung
light pen and computer to draw
a chemical structure (1976)
Courtesy Chemical Abstracts
Service
Originalarbeit
Literaturservice
Problem
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Literaturservice: CAS, Beilstein, Gmelin
Originalarbeit
Chemical Abstracts
Service (CAS)
„alles“
„Beilstein-Institut“
„Gmelin-Institut“
Organische Verbindungen
Polymere
Anorganische Verbindungen
Metallorganika
Abstract mit Suchkriterien
Printversion, Indexbände
Bibliothek
Datenbank
Intranet, Internet, WWW
•
•
•
Suchsprache
Client-Software
Web-Interface
Problem, Anfrage
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Literaturservice: Zugang an der UdS
P r i n t v e r s i o n e n (Bereichsbibliothek)
Referate / Register
Beilstein-Handbuch
Gmelin-Handbuch
Datenbank: CAS
Datenbank: Beilstein
Datenbank: Gmelin
http://www.cas.org/
www.reaxys.com
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Aspekte der Literaturrecherche
Abstract mit Suchkriterien
Jedes referierte Journal wird „abstrahiert“:
• durchlesen
• Vergabe einer Zitate-Nummer
• Titel
• Autoren aufnehmen
• Abstract schreiben oder übernehmen
• Keywords zu „Themen“
• Aufnahme der enthaltenen chemischen
Verbindungen mit Registry-Nr.
• chemische Formeln
• Eigenschaften
• Reaktionen
• Daten zur Anwendung, z. B. Pharmazie
• …
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z. B. Chemical Abstracts (CAS): Abstract im Referateheft
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12
Wie suche ich bei Referatediensten ??
Datenbank (online)
Printversion
z. B. CA-Bände
„Rohdatenbank“:
Suchsprache
für Suchfelder
Suchmaschine
Client-basierend /
Web-basierend
(WWW)
Thema
Subject Index
BI (Basic Index)
Eingabefeld (mit Hilfe)
Direkteingabe
Autor
Author Index
AU
Eingabefeld (mit Hilfe)
Direkteingabe
Substanzname
Substance Index
CN
Eingabefeld (mit Hilfe)
Direkteingabe
Summenformel Formula Index
MF
Eingabefeld (mit Hilfe)
--
Strukturformel
Atomkoordinaten Struktur-Editor/Plug-In
Reaktionen
--
(über Darstellung/
„P“
Reaktionen)
Struktur-Editor/Plug-In
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(evtl. Plug-In)
(evtl. Plug-In)
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Themen- und Stichwortsuche
•
•
•
•
•
•
•
•
•
Verbindungsklassen
Sachbezeichnungen
Physikalische und chemische Phänomene
Reaktionen
Chemische Techniken
Industrielle Techniken und Vorrichtungen
Wissenschaftliche Bezeichnungen
Biologische und medizinische Terminologie
usw....
 im Titel
 im Abstract
 im Volltext
Suche nach Autoren
Autoren, Erfinder, Patentinhaber, Firmen, Gesellschaften, Institutionen
• Schreibweisen
• mehrere Vornamen
• Abkürzungen
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Suche nach Substanzname
•
•
•
•
•
•
IUPAC-Namen
"halbsystematischer Namen"
Trivialnamen
Name in der Originalarbeit
englische/deutsche Bezeichnung
datenbankspezifische Nomenklatur
 im Titel
 im Abstract
 im Volltext
Suche nach der Summenformel
Hill-System:
Verbindungen mit Kohlenstoff:
CxHyA..B..C...
Übrige Verbindungen: A..B..C...
Beispiele: ClNa, CHN, CaH2O2
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Suche mit Strukturformel
Strukturformeleditor in Zugangssoftware enthalten oder als „Plug-In“
Chemical Abstracts:
SciFinder  Structure Editor
Beilstein/Gmelin:
REAXYS  Structure Editor (Auswahl)
Reaktionssuche – Reaktionsdatenbank
COOH
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COOCH3
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SULB: Saarländische Universitäts- und Landesbibliothek
http://www.sulb.uni-saarland.de/
Literatur- und Büchersuche: Saarländischer Virtueller Katalog
Zugang zu Datenbanken
• SULB-Homepage
• In der Menüleiste „Literatursuche“ anwählen.
• Linke Leiste: „Datenbanken“ anwählen
• DBIS: Datenbank Infosystem
• OLC (Online Contents) – Aufsatzdatenbank
(Nur Sbr-Campus; über 15 Mio. Aufsatztitel aus mehr als 14.000 Zeitschriften.
Für diese Datenbank werden seit dem Erscheinungsjahr 1993 Inhaltsverzeichnisse von
Zeitschriften aller Fachrichtungen mit besonderem Schwerpunkt auf Naturwissenschaften
erfasst. Die Zugangsberechtigung ist kostenlos und wird über die IP-Adresse abgeprüft.)
• ingenta: Platform über die auf elektronische Zeitschriften führender wissenschaftlicher,
akademischer und unternehmerischer Verlage einheitlich zugriffen werden kann.
• IBZ (Internationale Bibliographie der Zeitschriftenliteratur)
auf dem CD-ROM-Server der SULB (nur Sbr-Campus!) (Über 2 Millionen
Zeitschriftenaufsätze aus mehr als 6.000 Zeitschriften (1983 - 2002). Jährlich kommen
über 120.000 Eintragungen mit systematischer Sacherschließung hinzu.) .
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Internetsuchmaschinen
• Einführung: Was gibt’s im „Internet“?
• Web of Knowledge, Web of Science, Medline
Science Citation Index
• ScienceDirect, SCOPUS, Google Scholar
• Patentrecherchen
• Chemie / Organische Synthese
• Chemikalien
• Spektrendatenbanken
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Was gibt’s im Internet? - Datenbanken - Suchmaschinen
Web of Science
http://www.fiz-chemie.de/
http://isiknowledge.com/WOS
Science Direct
Medline
Reaktionsdatenbank
Current Synthetic Methodology
Current Contents
Solid Phase Organic Reactions
Diverse Arbeitsgebiete
http://www.ovid.com
seit 2014:
http://scienceresearch.com
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Web of Knowledge
ISI Web of KnowledgeSM
http://apps.isiknowledge.com
http://isiknowledge.com/WOS
http://isiknowledge.com/Medline
Web of Science®
MEDLINE®
(1945-present)
(1950-present)
Science Citation Index
„Speicher A“ ab 1990
Volltext verfügbar ?
PubMed
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed
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ScienceDirect, SCOPUS, Google Scholar
Science Direct
www.sciencedirect.com/
„isoplagiochin“:
article title
complete document
abstract
+ Autor = „Speicher“
http://www.scopus.com
http://scholar.google.com
„taxol“:
Basic Search – Advanced Search article title
+ Autor = „Nicolaou“
Patentrecherchen
http://www.depatisnet.de
„Gehard Wenz - Drug delivery with Nanoparticles“
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Chemie / Organische Synthese
• http://www.orgsyn.org
• http://www.namensreaktionen.de/
• http://www.chemgapedia.de
http://onlinelibrary.wiley.com/book/10.1002/047084289X
http://www.roempp.com/prod/
Chemikalien
•
•
•
•
•
http://www.zchl.uni-sb.de/
http://www.sigmaaldrich.com
http://www.chemexper.com/
http://www.emolecules.com/ !!
http://www.chemie.de
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&lett=fs&titel_id=192
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