EDV-Anwendungen in der Organischen Chemie Chemische Fachinformation: Literatur und Datenbanken • Chemische Literatur • Chemische Fachzeitschriften • Wissenschaftlicher Literaturservice - Datenbanken • Aspekte der Literaturrecherche • Die SULB • Internetsuchmaschinen • Datenbanken (Reaxys) und SciFinder Literatur: • „Organikum“, Kapitel B OC-EDV, SS 2014, Prof. Dr. A. Speicher 1 Wie entsteht „Chemische Literatur“ ? Chemische Forschung: Hochschulen, Institute, Industrie... Experiment: Stoffe, Reaktionen, Methoden, Studien, Theorien, Themen... Originalarbeit Protokollheft Laborjournal Abschlussarbeit Doktorarbeit Primärliteratur Patentschrift Übersichtsartikel (Review) Publikation in Fachzeitschrift „Handbücher“ peer-reviewed Monographie Lehrbuch OC-EDV, SS 2014, Prof. Dr. A. Speicher 2 Wichtige Fachzeitschriften für Organische Chemie: Zugang Einschränkung Campus Acta Chemica Scandinavica (bis 1999) Acta Chem. Scand. Angewandte Chemie (International Edition) Angew. Chem. (Int. Ed.) Australian Journal of Chemistry Aust. J. Chem. Beilstein Journal of Organic Chemistry Beilstein J. Org. Chem Canadian Journal of Chemistry Can. J. Chem. Chemische Berichte (bis 1997) European Journal of Inorganic Chemistry Chem. Ber. Chemical Communications Chem. Commun. Chemistry A European Journal Chem. Eur. J. Chemistry Letters Chem. Lett. European Journal of Organic Chemistry Liebigs Annalen der Chemie (bis 1997) Eur. J. Org. Chem. Liebigs. Ann. Chem. Helvetica Chimica Acta Helv. Chim. Acta Heterocycles Journal of the American Chemical Society J. Am. Chem. Soc. “JACS” Journal of the Chemical Society: diverse der Royal Society of Chemistry (RSC) J. Chem. Soc. … Organic & Biomolecular Chemistry Org. Biomol. Chem. Journal of Heterocyclic Chemistry J. Heterocycl. Chem. Journal of Organic Chemistry J. Org. Chem. “JOC” OC-EDV, SS 2014, Prof. Dr. A. Speicher älter 1 Jahr frei bis 1988 älter 3 Jahre älter 1 Jahr 3 J. Organomet. Chem. Journal für praktische Chemie (bis 2000) Advanced Synthesis and Catalysis J. Prakt. Chem. Adv. Synth. Calal. Organic Letters Org. Lett. Organometallics Organometallics Synlett Synlett 1989-2007 Synthesis Synthesis 1969-2007 Synthetic Communications Synth. Commun. älter 18 Mon. Tetrahedron Tetrahedron befristet Tetrahedron: Asymmetry Tetrahedron: Asym. befristet Tetrahedron Letters Tertrahedron Lett., “THL” befristet Accounts of Chemical Research Acc. Chem. Res. Chemical Reviews Chem. Rev. Chemical Society Reviews Chem. Soc. Rev. Journal of Organometallic Chemistry Review-Zeitschriften: IP-kontrolliert; VPN • Publikationssprache: Klare Tendenz zu Englisch! • Finanzierung? http://www.nationallizenzen.de/ • open-source? OC-EDV, SS 2014, Prof. Dr. A. Speicher 4 Zeitschriften - Abkürzungen: • Lehrbücher, z. B. Organikum • Chemical Abstracts Service: http://www.cas.org/content/references/corejournals Artikel in Zeitschriften werden „zitiert“ (zahlreiche Varianten und Konventionen): A. Speicher*, K. Hollemeyer, E. Heinzle Zitat: Autoren Titel Rapid detection of multiple chlorinated bis(bibenzyls) in bryophyte crude extracts using laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry Rapid Commun. Mass Spectrom. 2001, 15(2), 124-127. Zeitschrift, abgekürzt ! Jahr Jahrgang Heft Seitenangabe Der „Digital Object Identifier“ (DOI): http://dx.doi.org/ 10.1002/1097-0231(20010130)15:2<124::AID-RCM203>3.0.CO;2-5 OC-EDV, SS 2014, Prof. Dr. A. Speicher 5 Wie lese ich den ganzen Artikel ? Online-Zugang zur Zeitschrift: kostenlos oder kostenpflichtig ?? Homepage der Zeitschrift suchen oder: http://rzblx1.uni-regensburg.de/ezeit/search.phtml?bibid=SULB alphabetische Liste: http://ezb.uni-regensburg.de/fl.phtml?notation=&bibid=SULB&colors=7 Bereichsbibliothek Chemie ?? andere an UDS ?? UB ?? http://www.ntbib.uni-saarland.de/ Anschauen und / oder kopieren Online-Fernleihe über SULB oder "Subito" ( http://www.subito-doc.de ) Der „Artikel“: OC-EDV, SS 2014, Prof. Dr. A. Speicher 6 Suchen Sie folgende Artikel: A. Speicher, M. Groh, M. Hennrich, A.-M. Huynh Eur. J. Org. Chem. 2010, 6760-6778. A. Speicher,* T. Backes, K. Hesidens, J. Kolz Beilstein J. Org. Chem. 2009, 5, No. 71. J. Deska, S. Hähn, U. Kazmaier, Org. Lett. 2011, 13, 3210-3213. H. Müller, M. Paul, D. Hartmann, V. Huch, D. Blaesius, A. Koeberle, O. Werz, J. Jauch Angew. Chem. Int. Ed. 49, 2045-2049 (2010) Daniel Poeckel, Lars Tausch, Nicole Kather, Johann Jauch, and Oliver Werz Mol. Pharmacol. 70, 1071-1078 (2006) Gajdzik, J.; Lenz, J.; Natter, H.; Kohring, G.-W.; Giffhorn, F.; Wenz, G.; Hempelmann, R. ECS Trans. 2010, 25, (28), 13-20. DOI: 10.1016/j.tetlet.2013.09.085 OC-EDV, SS 2014, Prof. Dr. A. Speicher 7 Umfang chemischer Literatur (alle Chemiebereiche): Zeitschriften mit „chemischem Inhalt“: Originalarbeiten insgesamt: Zuwachs pro Jahr: ca. 8000 ca. 16 Mio (Stand: 2005) ca. 500.000 Artikel Wissenschaftlicher Literaturservice - Datenbanken Forschung light pen and computer to draw a chemical structure (1976) Courtesy Chemical Abstracts Service Originalarbeit Literaturservice Problem OC-EDV, SS 2014, Prof. Dr. A. Speicher 8 Literaturservice: CAS, Beilstein, Gmelin Originalarbeit Chemical Abstracts Service (CAS) „alles“ „Beilstein-Institut“ „Gmelin-Institut“ Organische Verbindungen Polymere Anorganische Verbindungen Metallorganika Abstract mit Suchkriterien Printversion, Indexbände Bibliothek Datenbank Intranet, Internet, WWW • • • Suchsprache Client-Software Web-Interface Problem, Anfrage OC-EDV, SS 2014, Prof. Dr. A. Speicher 9 Literaturservice: Zugang an der UdS P r i n t v e r s i o n e n (Bereichsbibliothek) Referate / Register Beilstein-Handbuch Gmelin-Handbuch Datenbank: CAS Datenbank: Beilstein Datenbank: Gmelin http://www.cas.org/ www.reaxys.com OC-EDV, SS 2014, Prof. Dr. A. Speicher 10 Aspekte der Literaturrecherche Abstract mit Suchkriterien Jedes referierte Journal wird „abstrahiert“: • durchlesen • Vergabe einer Zitate-Nummer • Titel • Autoren aufnehmen • Abstract schreiben oder übernehmen • Keywords zu „Themen“ • Aufnahme der enthaltenen chemischen Verbindungen mit Registry-Nr. • chemische Formeln • Eigenschaften • Reaktionen • Daten zur Anwendung, z. B. Pharmazie • … OC-EDV, SS 2014, Prof. Dr. A. Speicher 11 z. B. Chemical Abstracts (CAS): Abstract im Referateheft OC-EDV, SS 2014, Prof. Dr. A. Speicher 12 Wie suche ich bei Referatediensten ?? Datenbank (online) Printversion z. B. CA-Bände „Rohdatenbank“: Suchsprache für Suchfelder Suchmaschine Client-basierend / Web-basierend (WWW) Thema Subject Index BI (Basic Index) Eingabefeld (mit Hilfe) Direkteingabe Autor Author Index AU Eingabefeld (mit Hilfe) Direkteingabe Substanzname Substance Index CN Eingabefeld (mit Hilfe) Direkteingabe Summenformel Formula Index MF Eingabefeld (mit Hilfe) -- Strukturformel Atomkoordinaten Struktur-Editor/Plug-In Reaktionen -- (über Darstellung/ „P“ Reaktionen) Struktur-Editor/Plug-In OC-EDV, SS 2014, Prof. Dr. A. Speicher (evtl. Plug-In) (evtl. Plug-In) 13 Themen- und Stichwortsuche • • • • • • • • • Verbindungsklassen Sachbezeichnungen Physikalische und chemische Phänomene Reaktionen Chemische Techniken Industrielle Techniken und Vorrichtungen Wissenschaftliche Bezeichnungen Biologische und medizinische Terminologie usw.... im Titel im Abstract im Volltext Suche nach Autoren Autoren, Erfinder, Patentinhaber, Firmen, Gesellschaften, Institutionen • Schreibweisen • mehrere Vornamen • Abkürzungen OC-EDV, SS 2014, Prof. Dr. A. Speicher 14 Suche nach Substanzname • • • • • • IUPAC-Namen "halbsystematischer Namen" Trivialnamen Name in der Originalarbeit englische/deutsche Bezeichnung datenbankspezifische Nomenklatur im Titel im Abstract im Volltext Suche nach der Summenformel Hill-System: Verbindungen mit Kohlenstoff: CxHyA..B..C... Übrige Verbindungen: A..B..C... Beispiele: ClNa, CHN, CaH2O2 OC-EDV, SS 2014, Prof. Dr. A. Speicher 15 Suche mit Strukturformel Strukturformeleditor in Zugangssoftware enthalten oder als „Plug-In“ Chemical Abstracts: SciFinder Structure Editor Beilstein/Gmelin: REAXYS Structure Editor (Auswahl) Reaktionssuche – Reaktionsdatenbank COOH OC-EDV, SS 2014, Prof. Dr. A. Speicher COOCH3 16 SULB: Saarländische Universitäts- und Landesbibliothek http://www.sulb.uni-saarland.de/ Literatur- und Büchersuche: Saarländischer Virtueller Katalog Zugang zu Datenbanken • SULB-Homepage • In der Menüleiste „Literatursuche“ anwählen. • Linke Leiste: „Datenbanken“ anwählen • DBIS: Datenbank Infosystem • OLC (Online Contents) – Aufsatzdatenbank (Nur Sbr-Campus; über 15 Mio. Aufsatztitel aus mehr als 14.000 Zeitschriften. Für diese Datenbank werden seit dem Erscheinungsjahr 1993 Inhaltsverzeichnisse von Zeitschriften aller Fachrichtungen mit besonderem Schwerpunkt auf Naturwissenschaften erfasst. Die Zugangsberechtigung ist kostenlos und wird über die IP-Adresse abgeprüft.) • ingenta: Platform über die auf elektronische Zeitschriften führender wissenschaftlicher, akademischer und unternehmerischer Verlage einheitlich zugriffen werden kann. • IBZ (Internationale Bibliographie der Zeitschriftenliteratur) auf dem CD-ROM-Server der SULB (nur Sbr-Campus!) (Über 2 Millionen Zeitschriftenaufsätze aus mehr als 6.000 Zeitschriften (1983 - 2002). Jährlich kommen über 120.000 Eintragungen mit systematischer Sacherschließung hinzu.) . OC-EDV, SS 2014, Prof. Dr. A. Speicher 17 Internetsuchmaschinen • Einführung: Was gibt’s im „Internet“? • Web of Knowledge, Web of Science, Medline Science Citation Index • ScienceDirect, SCOPUS, Google Scholar • Patentrecherchen • Chemie / Organische Synthese • Chemikalien • Spektrendatenbanken OC-EDV, SS 2014, Prof. Dr. A. Speicher 18 Was gibt’s im Internet? - Datenbanken - Suchmaschinen Web of Science http://www.fiz-chemie.de/ http://isiknowledge.com/WOS Science Direct Medline Reaktionsdatenbank Current Synthetic Methodology Current Contents Solid Phase Organic Reactions Diverse Arbeitsgebiete http://www.ovid.com seit 2014: http://scienceresearch.com OC-EDV, SS 2014, Prof. Dr. A. Speicher 19 Web of Knowledge ISI Web of KnowledgeSM http://apps.isiknowledge.com http://isiknowledge.com/WOS http://isiknowledge.com/Medline Web of Science® MEDLINE® (1945-present) (1950-present) Science Citation Index „Speicher A“ ab 1990 Volltext verfügbar ? PubMed http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed OC-EDV, SS 2014, Prof. Dr. A. Speicher 20 ScienceDirect, SCOPUS, Google Scholar Science Direct www.sciencedirect.com/ „isoplagiochin“: article title complete document abstract + Autor = „Speicher“ http://www.scopus.com http://scholar.google.com „taxol“: Basic Search – Advanced Search article title + Autor = „Nicolaou“ Patentrecherchen http://www.depatisnet.de „Gehard Wenz - Drug delivery with Nanoparticles“ OC-EDV, SS 2014, Prof. Dr. A. Speicher 21 Chemie / Organische Synthese • http://www.orgsyn.org • http://www.namensreaktionen.de/ • http://www.chemgapedia.de http://onlinelibrary.wiley.com/book/10.1002/047084289X http://www.roempp.com/prod/ Chemikalien • • • • • http://www.zchl.uni-sb.de/ http://www.sigmaaldrich.com http://www.chemexper.com/ http://www.emolecules.com/ !! http://www.chemie.de OC-EDV, SS 2014, Prof. Dr. A. Speicher 22 Registrierung SciFinder Liebe Teilnehmer an OC-EDV, die Universität des Saarlandes verfügt aus dem Campusnetz heraus nahezu beliebig viele parallele Zugänge zur Datenbank SciFinder. Der Zugang ist Browserbasierend und benötigt Java. Dazu muss sich jeder Nutzer persönlich registrieren. Um einen reibungslosen Ablauf zu gewährleisten, bitte ich um eine Vorabregistrierung. Diese ist nur innerhalb des Campusnetzes möglich, verwenden Sie die E-Mail-Adresse mit ihrer Studentenkennung. Anleitung zur Registrierung: auch über sie Seite der SULB http://rzblx10.uni-regensburg.de/dbinfo/detail.php?bib_id=sulb_sb&colors=&ocolors= &lett=fs&titel_id=192 Direkter Link zur Registrierung https://origin-scifinder.cas.org/registration/index.html?corpKey= 1B7EB120X86F350ABX16967C0F20CD6846D8 Sie erhalten eine Bestätigungsmail zur Registrierung. Ihr Login sollte dann auch getestet werden. Beginn der Recherche bei SciFinder: https://scifinder.cas.org/ OC-EDV, SS 2014, Prof. Dr. A. Speicher 23
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