Mark Schubert St. Gallen, 13.05.2015 List of publications: Articles in peer reviewed journals: (24) Schubert, M., Fey, A., Ihssen, J., Civardi, C., Schwarze, F. W. M. R. and Mourad, S. (2015): Prediction and optimization of the laccase‐mediated synthesis of the antimicrobial compound iodine (I2). Journal of Biotechnology. 193: 134‐136. (23) Ihssen, J., Schubert, M., Thöny‐Meyer, L. and Richter, M. (2014). Laccase catalyzed synthesis of iodinated phenolic compounds with antifungal activity. PLoS ONE. 9(3): e89924. (22) Schubert, M., Stührk, C., Fuhr, M. J. and Schwarze, F. W. M. R. (2014). Imaging hyphal growth of Physisporinus vitreus in Norway spruce wood by means of confocal laser scanning microscopy (CLSM). Holzforschung. 68: 727‐730. (21) Schubert, M., Stührk, C., Fuhr, M. J. and Schwarze, F. W. M. R. (2013). Agrobacterium‐ mediated transformation of the white‐rot fungus Physisporinus vitreus. Journal of Microbiological Methods. 95: 251‐252 (20) Fuhr, M. J., Schubert, M., Stührk, C., Schwarze, F. W. M. R. and Herrmann, H. J. (2013). Penetration capacity of the wood decay fungus Phsisporinus vitreus. Complex Adaptive Systems Modeling. 1: 6. (19) Schubert, M. and Muffler, A., Mourad, S. (2012). The use of a radial basis neural network and genetic algorithm for improving the efficiency of laccase‐mediated dye decolourization. Journal of Biotechnology 161: 429‐436. (18) Schubert, M., Engels, J., Thöny‐Meyer, L., Schwarze, F. W. M. R. and Ihssen, J. (2012). Protection of wood from microorganisms by laccase catalysed iodination. Applied and Environmental Microbiology 78: 7276‐7282. (17) Schwarze, F. W. M. R., Jauss, F., Spencer, C., Hallam, C. and Schubert, M. (2012). Evaluation of an antagonistic Trichoderma strain for reducing the rate of wood decomposition by the white rot fungus Phellinus noxius. Biological Control 61: 160‐168. (16) Fuhr, M. J., Stührk, C., Schubert, M., Schwarze, F. W. M. R. and Herrmann, H. J. (2012). Modelling the effect of environmental factors on the hyphal growth of the basidiomycete Physisporinus vitreus. Journal of Basic Microbiology 52: 523‐530. (15) Schwarze, F. W. M. R. and Schubert, M. (2011). Physisporinus vitreus: a versatile white‐ rot fungus for engineering value added wood products. Applied Microbiology and Biotechnology 92: 431‐440. Page 1 / 6 Mark Schubert St. Gallen, 13.05.2015 (14) Schubert, M., Volkmer, T., Lehringer, C. and Schwarze, F. W. M. R. (2011). Resistance of bioincised wood treated with wood preservatives to blue‐stain and wood‐decay fungi. International Biodeterioration and Biodegradation 65: 108‐115. (13) Ihssen, J., Schubert, M., Schwarze, F. W. M. R. and Thöny‐Meyer, L. (2011). Efficient production of Al(OH)3‐immobilized laccase with a Heterobasidion annosum strain selected by microplate screening. Journal of Applied Microbiology 110: 924‐934. (12) Schubert, M., and Schwarze, F. M. W. R. (2011). Evaluation of the interspecific competitive ability of the bioincising fungus Physisporinus vitreus. Journal of Basic Microbiology 51: 80‐88. (11) Fuhr, M. J., Schubert, M., Schwarze, F. W. M. R. and Herrmann, H. J. (2011). Modelling the hyphal growth of the wood decay fungus Physisporinus vitreus. Fungal Biology 115: 919‐932. (10) Fuhr, M. J., Stührk, C., Muench, B., Schwarze, F. W. M. R. and Schubert, M. (2011). Automated quantification of the impact of the wood‐decay fungus Physisporinus vitreus on the cell wall structure of Norway spruce by tomographic microscopy. Wood Science and Technology 46: 69‐779. (9) Schubert, M., Mourad, S. and Schwarze, F. W. M. R. (2011). Automated image processing for quantification of blue‐stain discoloration of Norway spruce wood. Wood Science and Technology 34: 331‐337. (8) Schubert, M., Mourad, S. and Schwarze, F. W. M. R. (2010). Radial basis function neural networks for modeling growth rates of the basidiomycetes Physisporinus vitreus and Neolentinus lepideus. Applied Microbiology and Biotechnology 85: 703‐712. (7) Schubert, M., Mourad, S. and Schwarze, F. W. M. R. (2010). Statistical approach to determine the effect of combined environmental parameters on conidial development of Trichoderma atroviride (T‐15603.1). Journal of Basic Microbiology 50: 570‐580. (6) Schubert, M., Dengler, V., Mourad, S. and Schwarze, F. W. M. R. (2009). Determination of optimal growth parameters for the bioincising fungus Physisporinus vitreus by means of response surface methodology. Journal of Applied Microbiology 106: 1734‐ 1742. (5) Schubert, M., Mourad, S., Fink, S. and Schwarze, F. W. M. R. (2009). Ecophysiological responses of the biocontrol agent Trichoderma atroviride (T‐15603.1) to combined environmental parameters. Biological Control 49: 84‐90. (4) Schubert, M., Fink, S. and Schwarze, F. W. M. R. (2008). Evaluation of Trichoderma spp. as a biocontrol agent against wood decay fungi in urban trees. Biological Control 45: 111‐123. Page 2 / 6 Mark Schubert St. Gallen, 13.05.2015 (3) Schubert, M., Fink, S. and Schwarze, F. W. M. R. (2008). In vitro screening of an antagonistic Trichoderma strain against wood decay fungi. Arboricultural Journal 31: 227‐248. (2) Schubert, M., Fink, S. and Schwarze, F. W. M. R. (2008). Field experiments to evaluate the application of Trichoderma strain (T‐15603.1) for biological control of wood decay fungi in trees. Arboricultural Journal 31: 249–268. (1) Schwarze, F. W. M. R., Grüner, J., Schubert, M. and Fink, S. (2007). Defence reactions and fungal colonisation in Fraxinus excelsior and Tilia platyphyllos after stem wounding. Arboricultural Journal 30: 61‐82. Professional journals: (10) Schubert, M. und Ihssen, J. (2013). Enzymatische Holz‐Iodierung für einen effektiven Schutz vor Mikroorganismen. Holztechnologie 54(2): 11‐15. (9) Schubert, M. und Ihssen, J. (2012). Enzymatische Holz‐Funktionalisierung mit bioaktiven Molekülen für einen effektiven Holzschutz. Bulletin Holzforschung Schweiz 20: 13‐15. (8) Schubert, M. und Schwarze, F. W. M. R. (2012). Bioincising – Einfluss erhöhter Permeabilität des Holzes auf die biologische Wirksamkeit diverser Holzschutzmittel. Holztechnologie 53(2): 12‐17. (7) Stührk, C., Fuhr, M. Herrmann, H. J., Schwarze, F. W. M. R. und Schubert, M. (2011). Visualisierung und Modellierung des Bioincising Pilzes Physisporinus vitreus. Bulletin Holzforschung Schweiz 19: 13‐16. (6) Lehringer, C., Schubert, M., Arnold, M., Militz, H., Richter, K., und Schwarze, F. W. M. R. (2011). Verbesserte Permeabilität des Fichtenholz mit dem Weissfäulepilz Physisporinus vitreus – ein Statusbericht. Holztechnologie 52(5): 41‐45. (5) Lehringer, C., Schwarze, F. W. M. R., Schubert, M., Arnold, M. und Richter, K. (2010). Bioincising – verbesserte Permeabilität des Holzes durch Pilzbehandlung. Bulletin Holzforschung Schweiz 18: 5‐7. (4) Schubert, M. und Schwarze, F. W. M. R. (2009). Response Surface Analyse (RSM) der Wirkung kombinierter Parameter auf das Wachstum von Physisporinus vitreus. Holztechnologie 50(4): 38‐42. (3) Schubert, M., Dengler, V. und Schwarze, F. W. M. R. (2008). Response Surface Analyse (RSM) der Wirkung kombinierter Parameter Temperatur, Wasseraktivität (aw) und pH‐ Page 3 / 6 Mark Schubert St. Gallen, 13.05.2015 Wert auf das Wachstum von Physisporinus vitreus. Bulletin Holzforschung Schweiz 16: 10‐12. (2) Schubert, M., Heller, T., Fink, S. und Schwarze, F. W. M. R. (2007). Studien zum Einsatz von Trichoderma‐Arten für die Biologische Kontrolle Holz zersetzender Pilze an Bäumen. AFZ Der Wald 60: 197‐201. (1) Schubert, M., Heller, T., Fink, S. und Schwarze, F. W. M. R. (2007). Biologische Wundbehandlung mit Trichoderma‐Arten zur Regulation Holz zersetzender Pilze an Bäumen. Pro Baum Supplement Stadt und Grün 56: 8‐12. Refereed conference proceedings and presentations: (18) Schubert, M. (2013). Fungal laccases as a tool for wood functionalization. Proceedings IRG Annual Meeting IRG/WP 13‐20533. Stockholm, Sweden. Invited paper. (17) Schubert, M. and Ihssen, J. (2012). Laccase‐catalysed iodination for efficient wood protection against microorganisms. Poster presentation. II International Conference on Antimicrobial Research (ICAR). Lisbon, Portugal. (16) Ihssen, J., Schubert, M. and Richter, M. (2012). Iodination of wood and phenolic compounds by laccase catalysis. Poster presentation. 13th Swiss Japanese Conference on Biotechnology and Bioprocess Engineering. Walzenhausen, Switzerland. (15) Ihssen, J., Schubert, M., Thöny‐Meyer, L. and Schwarze, F. W. M. R. (2012). Protection of wood against microorganisms by enzymatic functionalization. ACHEMA Technology Transfer Days. Frankfurt am Main, Germany. (14) Ihssen, J., Schubert, M., Schwarze, F. W. M. R. and Thöny‐Meyer, L. (2011). Efficient production of Al(OH)3‐immobilised laccase with a Heterobasidion annosum strain selected by microplate screening. 1st European Congress of Applied Biotechnology. Berlin, Germany. (13) Stührk, C., Fuhr, M. J., Schubert, M. and Schwarze, F. W. M. R. (2010). Analyzing hyphal growth of the bioincising fungus Physisporinus vitreus with light‐, confocal laser scanning‐ and, Synchrotron X‐ray tomographic microscopy. Proceedings IRG Annual Meeting IRG/WP 10‐20438. Biarritz, France. (12) Schubert, M. und Schwarze, F. W. M. R. (2010). Bioincising ‐ Biotechnologische Verfahren zur Verbesserung von Holzeigenschaften. Osnabrücker Baumpflegetage. Osnabrück. Tagungsband 27. Page 4 / 6 Mark Schubert St. Gallen, 13.05.2015 (11) Fuhr, M. J., Stührk, C., Schwarze, F. W. M. R., Schubert, M. and Herrmann, H. J. (2010). Modelling hyphal growth of the bioincising fungus Physisporinus vitreus. Proceedings IRG Annual Meeting IRG/WP 10‐710. Biarritz, France. (10) Lehringer, C., Arnold, M., Richter, K., Schubert, M., Schwarze, F. W. M. R. and Militz, H. (2009). Bioincised wood as substrate for surface modifications. Proceedings of the European Conference on Wood Modification F. Englund, C. A. S. Hill, H. Militz and B. K. Segerholm (eds.). Stockholm: 197‐200. (9) Schwarze, F. W. M. R. and Schubert, M. (2009). Enhanced uptake of wood modification agents in `bioincised´wood. Proceedings IRG Annual Meeting IRG/WP 09‐40445. Beijing, China. (8) Schubert, M. (2009). Holz zersetzende Pilze – Vom Schädling zum Nützling. Baumforum Süd. Stuttgart‐Hohenheim, Germany. Invited talk. (7) Schubert, M., Heller, T., Schwarze, F. W. M. R. und Fink, S. (2007). Möglichkeiten und Grenzen der biologischen Hemmung Holz abbauender Pilze an Bäumen. Jahrbuch der Baumpflege. D. Dujesiefken and P. Kockerbeck (eds.). Braunschweig: 180‐191. (6) Schubert, M. (2006). Bedeutende Holz zersetzende Pilze an Bäumen – Möglichkeiten der Prävention. Erfurter Baumforum. Erfurt, Germany. Invited talk. (5) Schubert, M., Schwarze, F. W. M. R. und Fink, S. (2006). Konventionelle und molekulargenetische Identifikation von Trichoderma‐Arten für die biologische Kontrolle von phytopathogenen Pilzen an Bäumen. Jahrbuch der Baumpflege. D. Dujesiefken and P. Kockerbeck (eds.). Braunschweig: 214‐218. (4) Schubert, M. (2005). Bedeutende holzzerstörende Pilze in der Baumkontrolle. Berliner Baumforum. Berlin, Germany. Invited talk. (3) Schubert, M., Schwarze, F. W. M. R. und Fink, S. (2005). Wundflächenbehandlung nach Schnittmaßnahmen an Bäumen mit Antagonisten. Osnabrücker Baumpflegetage. Osnabrück. Tagungsband 23. (2) Schwarze, F. W. M. R. und Schubert, M. (2003). Studien zum potentiellen Einsatz von Trichoderma‐Arten als Biologische Kontrolle gegen Holz zersetzende Pilze an Stadtbäumen. Osnabrücker Baumpflegetage. Osnabrück. Tagungsband 21. (1) Schwarze, F. W. M. R., Grüner, J., Schubert, M. und Fink, S. (2002). Abwehrreaktionen und Pilzinfektion in Fraxinus excelsior und Tilia platyphyllos nach Stammverletzungen ‐ eine differenzierte Betrachtung des CODIT ‐ Modells. Osnabrücker Baumpflegetage. Osnabrück. Tagungsband 20. Page 5 / 6 Mark Schubert St. Gallen, 13.05.2015 Research reports: (8) Schubert, M. (2013). Integration des Enzyms Laccase in die industrielle Produktion enzymgebundener Holzfaserdämmstoffplatten. Wissenschaftlicher Schlussbericht, KTI‐ Projektnummer 8593.1 LSPP. S. 61. (7) Schubert, M. (2013). Enzymatische Holz‐Oberflächen‐Funktionalisierung zur Verbesserung der Verklebungsgüte. Wissenschaftlicher Schlussbericht, WHFF‐Projekt Nr. 2011.18. S. 38. (6) Schubert, M. und Lehringer, C. (2011). Bioincising von Nadelholz mit Physisporinus vitreus – Optimierung von Holzbehandlungs‐ und Veredelungsprozessen. Wissenschaftlicher Schlussbericht, KTI‐Projektnummer 8593.1 LSPP. S. 78. (5) Schubert, M., Mourad, S. and Schwarze, F. W. M. R. (2010). Determination of optimal growth parameters for Physisporinus vitreus by response surface methodology. EMPA Activities 2009/2010: 38‐39. (4) Schubert, M. und Ihssen, J. (2010). Behandlung von Nadelholz mit Laccase zur Verbesserung der Widerstandsfähigkeit gegenüber holzverfärbenden Pilzen. Wissenschaftlicher Schlussbericht, WHFF‐Projekt Nr. 2009.03. S. 47. (3) Schubert, M. und Schwarze, F. W. M. R. (2009). RSM Analyse der Wirkung kombinierter Parameter auf das Wachstum von Pilzen. In: Zukunft Holz ‐ Statusbericht zum aktuellen Stand der Verwendung von Holz und Holzprodukten im Bauwesen und Evaluierung künftiger Entwicklungspotentiale. Schwaner, K. und Bosch, G. (Hrsg.). Institut für Holzbau, Hochschule Biberach. 2009: 1045‐1050. (2) Schubert, M. (2006). In vitro und ad planta Studien zum Einsatz von Trichoderma‐Arten für die Biologische Kontrolle Holz abbauender Pilze an Bäumen. Dissertationsschrift. Albert‐Ludwigs‐Universität Freiburg. S. 184. (1) Schubert, M. (2002). Einfluss der Barrierezone von Esche (Fraxinus excelsior L.) und Linde (Tilia platyphyllos Scop.) auf die Aggressivität Holz zersetzender Pilze. Diplomarbeit. Albert‐Ludwigs‐Universität Freiburg. S. 98. Patents: (1) Ihssen, J. and Schubert, M. (2012). Wood protection against microorganisms by laccase‐catalysed iodination. EP 2666360 A1. Page 6 / 6
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