こちら（PDF）

Cytoscape/BiNGO
インストール法
Cytoscapeのインストール（1）
Javaのインストール（1）
Cytoscapeの
トップページ
http://www.c
ytoscape.org/
へ。
Downloadを
クリック
Cytoscapeのインストール（2）
Javaのインストール（2）
まずjavaをインス
トールする必要が
あります。
ここをクリック。
Cytoscapeのインストール（3）
Javaのインストール（3）
Acceptにチェック
を入れてから・・
Windows64ビット
をクリック
Cytoscapeのインストール（4）
Javaのインストール（4）
“実行”をクリック
Cytoscapeのインストール（5）
Javaのインストール（5）
特にアンインス
トールはせず
“× ”をクリック
インストールを
クリック
終了したら“閉じる”
をクリック
Cytoscapeのインストール（6）
‐ Cytoscapeのインストール（1）
再度Internet Explorerを起動
し、 Cytoscape
のトップページ
http://www.cyt
oscape.org/へ。
Downloadを
クリック
Cytoscapeのインストール（7）
‐ Cytoscapeのインストール（2）
ここをクリック
Cytoscapeのインストール（8）
‐ Cytoscapeのインストール（3）
“実行”を選択
Cytoscapeのインストール（9）
‐ Cytoscapeのインストール（4）
“Next”をクリック
“I accept・・”に
チェック
“Next”をクリック
“Next”をクリック
Cytoscapeのインストール（10）
‐ Cytoscapeのインストール（5）
“Next”をクリック
“Finish”をクリック。これで
Cytoscapeのインストールが完了
BiNGOのインストール（0）
BiNGO(http://www.psb.ugent.be/cbd/papers/BiNGO/Home.html)は、Cytoscapeのプラグイン
である。ある遺伝子セット中に、ある特定の機能を持った遺伝子の割合がバックグラウンド
に比べて有意に高まっているかを、超幾何検定によって判別（いわゆるgene functional enrichment analysis）できる。
HPは
こんな感じ
BiNGOのインストール（1）
インストールはCytoscape内
からできます。
まず、Cytoscapeを起動する
スタートメニューの
“すべてのプログラム”
の中から”Cytoscape”
をクリック
BiNGOのインストール（2）
Cytoscapeを起動
した際に
警告が出たら、
“アクセスを許可
する”をクリック
BiNGOのインストール（3）
Cytoscapeが起動したら、Apps → App Manegerをクリック
BiNGOのインストール（4）
“Install Apps”タブの中に様々な項目が表示される。
“BiNGO”をクリック → “Install”をクリック
BiNGOのインストール（5）
Installの進行中はこのように表示される
終わったら”Close”
BiNGOのインストール（6）
Apps → App Manegerの下にBiNGOが表示される。
BiNGOをクリック
BiNGOのインストール（7）
BiNGOが開いたら
正しく動作している

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