pBR322 DNAの切断フラグメントの塩基数と切断部位

pBR322 DNAの切断フラグメントの塩基数と切断部位
切断数：酵素名の下に記入
Fragment
Size
Locations
AatⅡ
1
4,361
（4,289−4,288）
AccⅢ
1
4,361
（1,665−1,664）
AseⅠ
1
4,361
（3,539−3,538）
AvaⅠ
1
4,361
（1,426−1,425）
BalⅠ
1
4,361
（1,447−1,446）
Enzyme
4,361
（ 376− 375）
BsmⅠ
1
4,361
（1,360−1,359）
ClaⅠ
1
4,361
（
Eco RⅠ
1
4,361
（4.360−4,359）
Eco RⅤ
1
4,361
（ 188− 187）
Hin dⅢ
1
4,361
（
NdeⅠ
1
4,361
（2,297−2,296）
NheⅠ
1
4,361
（ 230− 229）
NruⅠ
1
4,361
（ 975− 974）
PstⅠ
1
4,361
（3,612−3,611）
PvuⅠ
1
4,361
（3,737−3,736）
PvuⅡ
1
4,361
（2,067−2,066）
SalⅠ
1
4,361
（ 652− 651）
ScaⅠ
1
4,361
（3,847−3,846）
SphⅠ
1
4,361
（ 567− 566）
SspⅠ
1
4,361
（4,171−4,170）
StyⅠ
1
4,361
（1,370−1,369）
Tth 111Ⅰ
1
4,361
（2,221−2,220）
AccⅠ
2
2,768
1,593
（2,246− 652）
（ 653−2,245）
Eco T38Ⅰ
2
4,347
14
（ 490− 475）
（ 476− 489）
Hin cⅡ
2
3,254
1,107
（ 654−3,907）
（3,908− 653）
Alw 44Ⅰ
3
2,617
1,246
498
（4,034−2,289）
（2,788−4,033）
（2,290−2,787）
BglⅠ
3
2,317
1,810
234
（1,170−3,486）
（3,487− 935）
（ 936−1,169）
DraⅠ
3
3,650
692
19
（3,944−3,232）
（3,252−3,943）
（3,233−3,251）
RsaⅠ
3
2,116
1,565
680
（ 166−2,281）
（2,282−3,846）
（3,847− 165）
Eco O109Ⅰ
4
2,861
915
543
42
（1,482−4,342）
（ 525−1,439）
（4,343− 524）
（1,440−1,481）
FspⅠ
4
2,132
1,096
1,035
98
（1,457−3,588）
（ 263−1,358）
（3,589− 262）
（1,359−1,456）
NaeⅠ
4
3,479
368
354
160
（1,286− 403）
（ 404− 771）
（ 932−1,285）
（ 772− 931）
NarⅠ
4
3,569
657
114
21
（1,207− 414）
（ 550−1,206）
（ 436− 549）
（ 415− 435）
25−
30−
Locations
AcyⅠ
6
2,697
657
490
382
114
21
（1,207−3,903）
（ 550−1,206）
（4,286− 414）
（3,904−4,285）
（ 436− 549）
（ 415− 435）
Eco RⅡ
6
1,857
1,058
929
383
121
13
（2,634− 129）
（1,442−2,499）
（ 130−1,058）
（1,059−1,441）
（2,500−2,620）
（2,621−2,633）
TaqⅠ
7
1,444
1,305
475
368
315
313
141
（2,574−4,017）
（1,269−2,573）
（ 653−1,127）
（4,018− 24）
（ 25− 339）
（ 340− 652）
（1,128−1,268）
AvaⅡ
8
1,744
1,434
303
279
249
222
88
42
（1,761−3,504）
（3,727− 799）
（1,137−1,439）
（1,482−1,760）
（ 888−1,136）
（3,505−3,726）
（ 800− 887）
（1,440−1,481）
DdeⅠ
8
1,653
540
540
465
426
409
166
162
（4,290−1,581）
（3,324−3,863）
（1,744−2,283）
（2,284−2,748）
（3,864−4,289）
（2,749−3,157）
（3,158−3,323）
（1,582−1,743）
BanⅠ
9
2,025
1,123
439
294
218
114
84
43
21
（1,290−3,314）
（3,315− 76）
（ 767−1,205）
（ 120− 413）
（ 549− 766）
（ 435− 548）
（1,206−1,289）
（ 77− 119）
（ 414− 434）
Bsp 1286Ⅰ
10
1,161
824
604
587
498
291
195
102
85
14
（2,792−3,952）
（1,470−2,293）
（4,038− 280）
（ 592−1,178）
（2,294−2,791）
（1,179−1,469）
（ 281− 475）
（ 490− 591）
（3,953−4,037）
（ 476− 489）
1,632
517
504
396
344
298
221
220
154
75
（3,362− 632）
（2,845−3,361）
（1,526−2,029）
（2,449−2,844）
（2,030−2,373）
（1,007−1,304）
（1,305−1,525）
（ 633− 852）
（ 853−1,006）
（2,374−2,448）
724
699
696
632
364
351
328
306
226
35
（ 536−1,259）
（2,155−2,853）
（2,854−3,549）
（3,901− 171）
（ 172− 535）
（3,550−3,900）
（1,486−1,813）
（1,814−2,119）
（1,260−1,485）
（2,120−2,154）
HaeⅡ
11
1,876
620
439
430
370
227
181
83
60
54
21
（2,722− 236）
（1,732−2,351）
（1,210−1,648）
（ 780−1,209）
（2,352−2,721）
（ 553− 779）
（ 237− 417）
（1,649−1,731）
（ 439− 498）
（ 499− 552）
（ 418− 438）
MboⅡ
11
791
755
751
592
493
271
254
196
109
78
71
（2,345−3,135）
（3,207−3,961）
（1,594−2,344）
（1,002−1,593）
（4,345− 476）
（ 731−1,001）
（ 477− 730）
（4,149−4,344）
（4,040−4,148）
（3,962−4,039）
（3,136−3,206）
1,171
854
659
649
287
186
181
（2,162−3,332）
（ 147−1,000）
（3,801− 98）
（1,046−1,694）
（3,514−3,800）
（1,835−2,020）
（3,333−3,513）
Enzyme
Enzyme
Fragment
Size
Locations
141
78
62
48
45
（2,021−2,161）
（1,757−1,834）
（1,695−1,756）
（ 99− 146）
（1,001−1,045）
1,461
616
352
279
275
249
222
191
187
179
124
88
79
42
17
（1,948−3,408）
（3,727−4,342）
（ 173− 524）
（1,482−1,760）
（ 525− 799）
（ 888−1,136）
（3,505−3,726）
（4,343− 172）
（1,761−1,947）
（1,261−1,439）
（1,137−1,260）
（ 800− 887）
（3,409−3,487）
（1,440−1,481）
（3,488−3,504）
696
592
525
364
351
347
328
306
218
199
184
121
42
40
35
13
（2,854−3,549）
（3,901− 131）
（ 536−1,060）
（ 172− 535）
（3,550−3,900）
（2,155−2,501）
（1,486−1,813）
（1,814−2,119）
（2,636−2,853）
（1,061−1,259）
（1,260−1,443）
（2,502−2,622）
（1,444−1,485）
（ 132− 171）
（2,120−2,154）
（2,623−2,635）
AluⅠ
17
908
659
656
521
403
281
257
226
100
90
63
57
49
46
19
15
11
（1,091−1,998）
（3,719− 16）
（ 32− 687）
（3,035−3,555）
（ 688−1,090）
（2,135−2,415）
（2,778−3,034）
（2,416−2,641）
（3,556−3,655）
（2,642−2,731）
（3,656−3,718）
（1,999−2,055）
（2,067−2,115）
（2,732−2,777）
（2,116−2,134）
（ 17− 31）
（2,056−2,066）
DpnⅠ
22
1,372
665
359
341
317
272
258
207
105
91
78
75
46
36
31
27
18
17
15
12
11
8
（1,670−3,041）
（4,047− 350）
（ 469− 827）
（3,331−3,671）
（1,146−1,462）
（ 828−1,099）
（3,736−3,993）
（1,463−1,669）
（3,226−3,330）
（ 378− 468）
（3,136−3,213）
（3,042−3,116）
（3,690−3,735）
（4,011−4,046）
（1,100−1,130）
（ 351− 377）
（3,672−3,689）
（3,994−4,010）
（1,131−1,145）
（3,214−3,225）
（3,117−3,127）
（3,128−3,135）
HaeⅢ
22
587
540
502
458
434
267
234
213
192
184
124
123
104
89
80
64
57
51
21
18
11
8
（3,757−4,343）
（1,949−2,488）
（1,447−1,948）
（2,952−3,409）
（2,518−2,951）
（3,490−3,756）
（ 598− 831）
（1,050−1,262）
（4,344− 174）
（1,263−1,446）
（ 402− 525）
（ 175− 297）
（ 298− 401）
（ 832− 920）
（3,410−3,489）
（ 534− 597）
（ 993−1,049）
（ 942− 992）
（ 921− 941）
（2,500−2,517）
（2,489−2,499）
（ 526− 533）
NdeⅡ
22
1,372
665
359
341
317
272
258
207
105
91
78
（1,668−3,039）
（4,045− 348）
（ 467− 825）
（3,329−3,669）
（1,144−1,460）
（ 826−1,097）
（3,734−3,991）
（1,461−1,667）
（3,224−3,328）
（ 376− 466）
（3,134−3,211）
Sau 96Ⅰ
15
Enzyme
29）
Hin fⅠ
10
NciⅠ
10
FokⅠ
12
Locations
75
46
36
31
27
18
17
15
12
11
8
（3,040−3,114）
（3,688−3,733）
（4,009−4,044）
（1,098−1,128）
（ 349− 375）
（3,670−3,687）
（3,992−4,008）
（1,129−1,143）
（3,212−3,223）
（3,115−3,125）
（3,126−3,133）
1,372
665
359
341
317
272
258
207
105
91
78
75
46
36
31
27
18
17
15
12
11
8
（1,668−3,039）
（4,045− 348）
（ 467− 825）
（3,329−3,669）
（1,144−1,460）
（ 826−1,097）
（3,734−3,991）
（1,461−1,667）
（3,224−3,328）
（ 376− 466）
（3,134−3,211）
（3,040−3,114）
（3,688−3,733）
（4,009−4,044）
（1,098−1,128）
（ 349− 375）
（3,670−3,687）
（3,992−4,008）
（1,129−1,143）
（ 321−3,223）
（3,115−3,125）
（3,126−3,133）
AccⅡ
23
581
493
452
370
356
341
332
330
145
129
129
122
115
103
97
69
66
61
27
26
10
5
2
（2,521−3,101）
（3,432−3,924）
（4,257− 347）
（1,636−2,005）
（ 348− 703）
（2,180−2,520）
（3,925−4,256）
（3,102−3,431）
（1,246−1,390）
（ 819− 947）
（1,107−1,235）
（1,417−1,538）
（ 704− 818）
（2,077−2,179）
（1,539−1,635）
（2,006−2,074）
（1,041−1,106）
（ 980−1,040）
（ 948− 974）
（1,391−1,416）
（1,236−1,245）
（ 975− 979）
（2,075−2,076）
MspⅠ
26
622
527
404
307
242
238
217
201
190
180
160
160
147
147
123
110
90
76
67
34
34
26
26
15
9
9
（3,901− 161）
（2,154−2,680）
（3,044−3,447）
（1,813−2,119）
（3,659−3,900）
（1,021−1,258）
（ 171− 387）
（1,285−1,485）
（2,854−3,043）
（1,486−1,665）
（ 771− 930）
（ 535− 694）
（1,666−1,812）
（2,681−2,827）
（ 412− 534）
（3,549−3,658）
（ 931−1,020）
（ 695− 770）
（3,482−3,548）
（2,120−2,153）
（3,448−3,481）
（2,828−2,853）
（1,259−1,284）
（ 388− 402）
（ 162− 170）
（ 403− 411）
Sau 3AⅠ
22
24）
Scr FⅠ
16
Fragment
Size
Appendix
Bam HⅠ
1
Fragment
Size
601
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