üŁĮºÀºÀƝ †ƉīÏÀĻŃĿ
>_VH`#”ç‘ß"ƕŨ!QDK`
H2A.Z M>^<EbX#ďƇŪĈ
Structural analysis of the H2A.Z nucleosomes
involved in chromatin dynamics
į Ŷ ř
²Ž
ĸđ
Naoki
HORIKOSHI
ơęaå³Ĭ§Éõ ďƇĬĤÀĻŃ
2014 Ó 2 ā
Ĭ § ĝ ” " â ƣ 4 Ɛ x å ³ $ @ N X DNA  ï 5 4 ĺ Č Ĭ Ĥ $ Ƙ º ! @ N X DNA $ ĸ Û 6 ø V : > _ Y b K ] # Ŏ Ŝ
Č"ŋ54ĬĤ
µĖĬ¿4."$ŎŜŽŤ#ƞ"
Ɛxå³
ĕĽ"½ŎŜ"xƎ54âŨ
4ĕĽ!Ɛxå³#xƎ"
$ DNA # ŧ Ŧ 7 $ . ƀ Œ 0 ŏ ó !
# , , ! DNA v Ÿ ĕ Ò
" Ţ 6 5 ! 5 % ! 2 ! ĺ Č Ĭ Ĥ # @ N X DNA $ > _ V H ` ď Ƈ 7
Ø è Ŏ Ŝ Č ‰ "  ŋ 5 4 . 5 2 # DNA v Ÿ $ ) > _
V H ` ď Ƈ i " Ţ 6 5 4 â Ũ 4 # . " > _ V H ` $ DNA 7
ì38ŎŜČ"ŋ4ڒ!G:LWI>"¸”4
" 1 , , ! DNA v Ÿ 7 ĕ Ľ " ‘ ß 4 ĺ Č
ĬĤ"$>_VH`#”ç‘ß
Ɛxå³#ŋĴĪ1'Œ
ê"âŨgŸē!Ũō4
> _ V H ` # Ā Ê Ē Ş ™ y $ 4 ŀ ƥ # Q D K ` (H2A H2B H3 H4)
2 Ž ¾ 2 ! 4 Q D K ` 8 Ɨ z " 146 ´ ° È # DNA Ñ u M >
^<EbX¦%54ŠĶĦ#ďƇz4M>^<EbX
\`=b
D N A " 1 ƈ ő M > ^ < E b X ¢ · ƨ Ĕ " ì 3 ij , 5 4 " 1 ƨ Ĕ # > _ V H ` ď Ƈ Ø è 5 4 ƨ Ĕ > _ V H ` ď Ƈ $ D N A # Y H
]–QDK`#ŗů݁ƦQDK`O\9`K"1¹Đä7
uh53QDK`C[U_`0>_VH`\ZJ\`?ŧ¡z!
" 1 G : L W I > " ¸ ” 4 D N A # Y H ] – 0 Q D K ` ŗ ů Ý 
Ʀ#>_VH`ďƇ(#ÙƢ"ƛ$5,"¹#ĻŃ
!5
ƃÓ>_VH`”ç‘ß"4QDK`O\9`K#ƕŨ
ä
"ý2"!3ĺČĬĤ#@NXĒŞ‘ß#ƕŨ«¾Ĝ
ķ54
QDK`O\9`K$ƅÒ®#QDK`N`9^\I>!Ɛx¾
¿ ¬ 4 Q D K ` # q ŀ 4 Ī ¬ Q K # Q D K ` O \ 9 ` K $ H2A H2B H3 " ³ ¤ 5 4 H4 # O \ 9 ` K $ ) # Ĭ
Ĥ ŀ " ũ 5 ! H 2 A O \ 9 ` K $ 5 ? ] b S " º
5Ɛx¾#ƀŒŧŦà"¹Đ!ĒŞ7Ă4
³¤
54QDK`O\9`K
>_VH`"ž3Ƃ,54M>
^<EbX^T]#ďƇ¹Đä0”ĵäŻ#Ə
Ĭ4ƨĔ>_VH
`#^T]$M>^<EbXƚ#Ĺo{ĭ#¹Đä
Öż5
#őĉ>_VH`#”ĵ!äŻ
º¸–4ñÆ54#1
!QDK`O\9`K"14>_VH`G:LW>D#‘ßĒď
Ɛx
¾#ĒŞĴĪ"ƕŨ!ڒ7ĉ4Ř254 Q
DK`O\9`K7£-M>^<EbXďƇ!
#å³$˜Ž$!
55
#1">_VH`ƨĔďƇ0”ç‘ß"ƛ64#$*8
ý2"!!
H 2 A . Z $ H 2 A O \ 9 ` K # & ũ 5 Ɠ ė 2 Q K , Ô  ¿ 5 4 ƃ Ó # @ N W > D Ļ Ń # ő ĉ H2A.Z # Ë ¬ $ ƀ Œ
ĝ Ĵ ! Ɛ x ¾ # ƀ Œ ƙ ¼ ģ ƃ ƒ " ¹ ũ 2 5 D N A ô „ Ƒ y !
"/Ɵł
4 ³ ¤ 5 4 5 2 # m Å $ , , ! DNA v Ÿ Ő
ž " H2A.Z … 4 7 ľ 4 , H2A.Z " $ 2 # isoform H2A.Z.1 1 ' H2A.Z.2 ¿ ¬ 4 V ; D " 4 Ɛ x
¾ ļ ¶ Å Ƨ " H2A.Z.1 V ; D # Ĭ ¿ " â ƣ # Ɛ x ¾ 4 1
ý 2 " 5 # $ H 2 A . Z . 2 H 2 A . Z . 1 # Ē Ş 7 Ĺ ť ! ū ó 4 5 2 ƫ # H 2 A . Z # i s o f o r m $ 5 5 ħ ń Ē Ş 7 Ă
4 7 æ ¥ 4 H 2 A . Z . 1 H 2 A . Z . 2 # Ē Ş 0 ď Ƈ " ƛ 4ĻŃ$ńÝ5352#M>^<EbXďƇ"4ĥá"
$ąý2"!!
# 1 ! ś þ 7 ſ , Ć ŷ ù $ H 2 A . Z . 1 H 2 A . Z . 2 7 £ - M >
^ < E b X # ń z ď Ƈ 7 Ū ý 5 2 # ď Ƈ ĵ ĥ á 7 ý 2 " 4 H 2 A . Z . 1 H 2 A . Z . 2 # Ē Ş # ī Ū 7 Ġ . 4 7 ķ ĵ 4 # .
" H2A.Z.1 1 ' H2A.Z.2 7 £ - M > ^ < E b X 7 ű Ƨ Ň ‰ ‹ ď è 5 2 7 ĭ X ŕ ő ÿ ď Ƈ Ū Ĉ " 1 4 ń z ď Ƈ Ū Ĉ 0 M > ^ < E b X
#ďƇÁÄä"#Ĭ–ÀĵŪĈ7Ţ4,ĬŎŜ"4
H2A.Z.1 1 ' H2A.Z.2 # ” ç Ū Ĉ 7 Ŏ Ŝ Ĭ Ĥ À ĵ é ě " 1 3 Ţ Č ‰ " 4 H2A.Z.1 H2A.Z.2 # ” ç # Ə 7 ý 2 " 4 5
2 # ő ĉ 2 > _ V H ` ” ç ‘ ß " 4 H 2 A . Z 7 £ - M > ^ < E b X #
Ē Ş 1 ' H2A.Z.1 1 ' H2A.Z.2 7 £ - M > ^ < E b X # Ē Ş ĵ ä Ż
ŘÆ4Ćŷù$pŅďè53wf" Ņ#ŨŊ
Ćŷù#Ű}7Ů
ņcŅ$ĆĻŃ#śþ"ųŎ"ŮƄ53ĆĻŃ7ƊŢ
æŖ×ŲŽƖ"4źĨ"Źŷ4
ņnŅ$Ćŷù"4ÅƧĭM>^<EbX#ňŦúěĢ
ğ ď Ƈ # Ū Ĉ " Ů Ƅ 5 4 Q K H2A.Z.1 1 ' H2A.Z.2 7 £ M > ^ < E b X 7 ‹ ď è 4 " Q D K ` H2B H3.1 H4 1 '
H2A.Z.1 4 $ H2A.Z.2 7 \ A ` R L ` K F ` P > Ż ƨ Ō Õ " ň Ŧ
ňŦ QDK`7ĭQDK` 8 Ɨz7űƧ҉‹ďè
5272"ƨŌÕňŦ4ʼn7Ľń4#èĉ"1”
ĵ ‡ ÷ l ě " 1 4 H2A.Z.1 4 $ H2A.Z.2 7 £ - M > ^ < E b X # Ģ ğ ď
Ƈ"#å³7Þ4"è“4”ĵ‡÷lě$g˜Ž!ň
ŦÕ#B`S]$Ž¾Û#Ŭġ7Ţ
#
M>^<
EbX#ĢğďƇŪĈ#»!tªĽńéě7ĭM>
^ < E b X ň Ŧ ʼn $ M > ^ < E b X 7 Ø è ! Q D K ` 0 DNA
7M>^<EbX7£-ݎ*+ˆ"ŽƠ4
3
#M>^<EbXŵŦëţ#Ľń
Ćŷù#jŨ!èĉ#°Ķ!
4
Ćéě"14M>^<EbXŵŦě$×ŲŽƖ"4
¹#ĻŃ"¹#źĨ
ăÜ54ƕŨ!ëţ44
ņ d Ņ $ H2A.Z.1 1 ' H2A.Z.2 7 £ - M > ^ < E b X # X ŕ ő ÿ ď
Ƈ Ū Ĉ " ŷ 4 5 , H 2 A . Z . 1 H 2 A . Z . 2 # ď Ƈ ĵ ! ĥ á $ 527£-M>^<EbX#ďƇŪĈ
ńÝ54.ý2"!
! Ć Ņ $ ‹ ď è H2A.Z.1 4 $ H2A.Z.2 7 £ - M
>^<EbX#őÿ–7ŢX ŕőÿďƇŪĈ"1›¾ŽŪŞńz
ď Ƈ 7 Ě Ä 4 " è “ 4 H 2 A . Z . 1 H 2 A . Z . 2 1 ' H 2 A 7 £ M > ^ < E b X # ď Ƈ Ę Ɓ # ő ĉ H 2 A . Z . 1 H 2 A . Z . 2 1 ' H 2 A # L 1 l o o p
¦ % 5 4 Ƥ ¯ # ď Ƈ Š IJ ! 4 7 Ĵ ũ 4 2 " H2A #
L1 loop Ƥ ¯ Ę Ɓ H2A.Z.1 1 ' H2A.Z.2 # L1 loop Ƥ ¯ $ ƌ ” ä ƨ / ý 2 " 4 5 2 # ő ĉ $ H2A.Z.1 H2A.Z.2 7 £ M>^<EbX#ńzďƇ"4Ə7.ľ/#4#ď
2
Ƈ Ð IJ Ŏ Ŝ Č ‰ " 4 H2A.Z.1 H2A.Z.2 # Ē Ş Ð IJ # › « 4 Ÿ
Ş ä " / ū œ 3 × Ų Ž Ɩ " ƕ Ũ ! Ɖ Ì 7 ò | 4 ņ © Ņ $ H2A.Z.1 1 ' H2A.Z.2 7 £ - M > ^ < E b X # ď Ƈ Á Ä ä
" Ů Ƅ 4 Ŏ Ŝ Č ‰ " H2A.Z $ ƀ Œ ĝ Ĵ ! Ɛ x ¾ #
ƀ Œ ƙ ¼ ģ ƃ ƒ " Ë ¬ 4 ³ ¤ 5 4 2 H2A.Z 7 £ - M
> ^ < E b X H 2 A $ IJ ! 4 ĥ á ĵ ! ä Ż 7 Ă 4 Ř 2 5 Ć Ņ $ ű Ƨ Ň ‰ ‹ ď è H2A.Z.1 1 ' H2A.Z.2 7 £ - M > ^
<EbX#ďƇÁÄä7´ŚäűƧ"1Ű}4´ŚäűƧ#ő
ĉ H2A.Z.1 1 ' H2A.Z.2 7 £ - M > ^ < E b X $ H2A 7 £ - M > ^ <
EbX13/gÁÄ!äŻ7Ă47Ĵũ42"gÁÄ!
ä Ż 7 ľ H2A.Z.1 1 ' H2A.Z.2 7 £ - M > ^ < E b X # Ĭ Ŏ Ŝ Č ‰ # Á Ä ä 7 H2A.Z.1 1 ' H2A.Z.2 # Ŏ Ŝ ‰ ” ç Ɔ Õ 7 Fluorescence
recovery after photobleaching ě " 1 ŵ ) 4 Ď ŭ 4 # ő
ĉ H2A Ę Ɓ H2A.Z.1 $ Ŏ Ŝ Č ‰ # ” ç ü 7 ý 2 " 4 # ő ĉ $ H2A.Z.1 7 £ - M > ^ < E b X # g Á Ä ! ä Ż Ĭ
Ŏ Ŝ ‰ / œ ï 5 4 Ř 2 5 4 ş ¥ Ġ " H2A.Z.1 Ę Ɓ
H2A.Z.2 # Ŏ Ŝ Č ‰ ” ç $ Ƌ H2A # ” ç * + ¢ Ɔ Õ 4 ũ 5 4 # $ H2A.Z.1 H2A.Z.2 $ Ŏ Ŝ Č ‰ #
” ç " Ə 7 Ă 4 7 ľ 3 ¸ IJ z Ū Ĉ # ő ĉ H2A.Z.1 H 2 A . Z . 2 5 5 # 3 8 ı ķ # 9 W N Ɣ 5 2 # Ŏ Ŝ Č ‰ ” ç # Ə # c
û7í47ý2"4
ņpŅ$Ćŷù"Þ25őĉ7Ŕî>_VH`#”ç‘ß"
4 H 2 A . Z 7 £ - M > ^ < E b X # Ē Ş Ŏ Ŝ Č ‰ " 4 H 2 A . Z . 1 H2A.Z.2 # Ē Ş Ð IJ " Ř Æ 4 w e Ć ŷ ù $ H2A.Z.1 1 ' H2A.Z.2 7 £ - M > ^ < E b X # ń z
ďƇ7Ūý52#”ĵäŻ"#•îĵ!ŪĈ7Ţ4Ć
Ļ Ń " 1 H2A.Z.1 1 ' H2A.Z.2 7 £ - M > ^ < E b X H2A 7 £ - M
>^<EbXĘƁgÁÄ!äŻ7Ă42"ŎŜȉ"
H2A.Z.1 H2A.Z.2 IJ ! 4 ” ç 7 ľ 7  . ý 2 " 4 52#ĻŃèĉ$QDK`O\9`K"14>_VH`”ç‘ßĒď7
īŪ4eº¸}‚#4/#3×ŲŽƖ#ĴÌ"ºźĨ4
/#4Ř254we13Ćŷù$š·ƩīÀƪ#Àyŷù
˜Ž"}‚#4/#Ŵ.4
2014 Ó 1 ā
Çċ¨
ƩjċƪüŁĮºÀöð
üŁĮºÀöð
üŁĮºÀöð
ºƜºÀöð
š·ƩÀţƪ±ĩºÀ šÀš·ƩkκÀƪ š·ƩīÀƪrƒºÀ š·ƩīÀƪ—ĞƍºÀ
3
ŝč­ sã
ĊĮ ƕ€
ÍƖ ~Ţ
Ąć Ã