Servicio de secuenciación de librerías de NGS

Servicio de secuenciación de librerías de NGS
El Instituto de Medicina Genómica pone a su disposición el servicio de secuenciación de librerías de DNA
mediante Next Generation Sequencing empleando diferentes plataformas.
Nuestra dilatada experiencia nos permite garantizarle los más rigurosos criterios de calidad y los mínimos
plazos de entrega de resultados.
Trabajamos con todos los tipos de librerías aptas para secuenciar en las
plataformas MiSeq y NextSeq 500
Workflow
Recepción de librerías en nuestro
laboratorio:
•Cada librería debe estar cuantificada,
indicándose la concentración a la que
se desea realizar el ensayo. Si tiene
dudas acerca de la concentración
a la que debería secuenciar
su librería, le sugerimos que
contacte previamente con nuestro
departamento técnico para recibir
asesoramiento.
•El envío deberá realizarse refrigerado
o en nieve carbónica.
•Además de la librería, es necesario
que nos remita toda la información
necesaria para la identificación de las
muestras incluidas en cada librería:
nombre, index, Sample Sheet con las
condiciones de run del ensayo, así
como la información de las muestras
incluidas en cada librería.
Secuenciación de la librería:
Análisis de datos e interpretación:
•Nuestros técnicos emplearán la
plataforma de secuenciación elegida.
•En el caso de los runs de MiSeq,
el servicio incluye el análisis con
cualquier workflow incluido en el
MiSeq Reporter.
•Junto con cada librería, emplearemos
un control positivo consistente en
un 1% de una librería del fago PhiX
con el fin de garantizar la calidad del
proceso.
•En el caso de los runs de NextSeq
500, los resultados pueden ser
enviados mediante BaseSpace de
Illumina para su posterior análisis
con cualquier workflow disponible en
esta plataforma.
•Este servicio no incluye análisis
bioinformáticos especializados pero,
si lo desea, podemos estudiar su
caso y proporcinarle un presupuesto
a medida de sus necesidades.
•Sus resultados son almacenados en la nube bajo un protocolo de seguridad securedFTP.
•Cada solicitante dispone de una clave de seguridad personal (usuario y contraseña) mediante las que puede acceder
a su carpeta y descargar, desde cualquier ordenador conectado a Internet, en cualquier momento y cuantas veces
quiera, todos sus resultados. Nuestro departamento de informática le proporcionará la asistencia necesaria para
garantizar esta conexión.
Le ofrecemos las siguientes modalidades de secuenciación
Plataforma MiSeq
Referencia
Parámetros
Millones de lecturas (PF)
Volumen de información
Precio
(sin IVA, 21%)
Plazo de entrega
NG2050
50 ciclos
Kit v 2.0.
12-15 millones
750-850 Mb
1.150 €
10 días
NG2300
300 ciclos
Kit v 2.0.
12-15 millones
4.5-5.1 Gb
1.450 €
10 días
NG3600
600 ciclos
Kit v 3.0.
22-25 millones
13.2-15 Gb
2.150 €
10 días
Millones de lecturas (PF)
Volumen de información
Precio
(sin IVA, 21%)
Plazo de entrega
Plataforma NextSeq 500
Referencia
Parámetros
NSH2300
High output 300 ciclos 400 millones
Kit v 2.0.
100-120 Gb
5.595 €
10 días
NSH2150
High output 150 ciclos 400 millones
Kit v 2.0.
50-60 Gb
3.350 €
10 días
NSH2075
High output 75 ciclos
Kit v 2.0.
400 millones
25-30 Gb
1.995 €
10 días
NSM2300
Mid output 300 ciclos
Kit v 2.0.
130 millones
32.5-39 Gb
2.450 €
10 días
NSM2150
Mid output 150 ciclos
Kit v 2.0.
130 millones
16.3-19.5 Gb
1.450 €
10 días
En caso de que desee utilizar alguna opción de carrera diferente a las propuestas en la tabla anterior, le rogamos que
contacte con nuestro departamento técnico para que podamos asesorarle acerca de las condiciones del servicio y los precios.
Atención técnica de 9:00 a 19:00 horas ininterrumpidamente
Instituto de Medicina Genómica, S.L.
c/ Agustín Escardino 9
Parc Científic de la Universitat de València
46980 Paterna (Valencia - España)
[email protected]
Tel.: +34 963 212 340
Fax: +34 963 212 341
www.imegen.es

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