第15回日本蛋白質科学会年会ワークショップ

ワークショップ / WorkShop
1WA
A 会場（1 階ホール）/ Room A（1F Hall）
6 月 24 日 ( 水 ) / June 24 (Wed.)　16:00 ～ 18:30
Day 1 (June 24)
WorkShop
量子構造生物学の現状と将来
Current status and future of quantum structural biology
文部科学省光・量子融合連携研究開発プログラム
「中性子と放射光の連携利用によるタンパク質反応プロセスの解明」共催
タンパク質は「大きさ」と「精巧さ」という二面性を持つため、その直接的な理解は困難であり、既存の化学的常識
に基づいた議論に終始している。こうした現状を打破するためには、X 線と中性子線を連携利用する結晶構造解析に
計算科学を融合・発展させて、「大きさ」と「精巧さ」という二面性を両立させた新しい研究スタイルが求められる。
このような「量子構造生物学」なる新分野の確立に向けた取り組みの現状と将来像を議論する。
We usually discuss the nature of proteins on the basis on the pre-existing common knowledge obtained by chemistry,
because of difficulties in its direct understanding. Therefore, we need to develop a new field of “quantum structural
biology”, in which X-ray and neutron crystallography are combined with computational science to understand huge
but delicate aspects of protein molecules.
オーガナイザー：竹田一旗（京都大）、黒木良太（原子力機構）、三木邦夫（京都大）
Organizers: Kazuki Takeda (Kyoto Univ.), Ryota Kuroki (JAEA), Kunio Miki (Kyoto Univ.)
[16:00]
Opening Remarks
三木邦夫 (Kunio Miki)
京都大学 (Kyoto Univ.)
[[[99996]]]
1WA-1
[16:05]
京大・院理 (Grad. Sch. of Sci., Kyoto Univ. )
[16:35]
原子力機構・量子ビーム (QuBS, JAEA)
[17:05]
京大・原子炉 (Research Reactor Inst., Kyoto Univ.)
[17:20]
[[[20337]]]
高分解能 X 線結晶構造解析によるチトクロム酸化酵素の酸素還元・プロトンポンプ機構の解明
High-resolution crystal structural analyses of cytochrome c oxidase to elucidate coupling
mechanism of dioxygen reduction and proton pump
○月原冨武 1 (Tomitake Tsukihara)、島田敦広 1 (Atsuhiro Shimada)、島田悟 1 (Satoru Shimada)、
武村秀平 1 (Shuhei Takemura)、馬場淳平 1 (Junpei Baba)、村本和優 1 (Kazumasa Muramoto)、
山下栄樹 2 (Eiki Yamashita)、伊藤−新澤恭子 1 (Kyoko Shinzawa-Itoh)、吉川信也 1 (Shinya Yoshikawa)
1
[[[20278]]]
1WA-5
中性子線結晶構造解析のためのタンパク質の重水素化
Protein deuterization for neutron crystallography
○喜田昭子 (Akiko Kita)、森本幸生 (Yukio Morimoto)
[[[20046]]]
1WA-4
電子伝達タンパク質の高分解能中性子結晶構造解析
High-resolution neutron crystal structural studies of electron transfer proteins
○玉田太郎 (Taro Tamada)
[[[20156]]]
1WA-3
タンパク質の超高分解能結晶構造解析の現状
Current status for ultra-high resolution protein crystallography
○竹田一旗 (Kazuki Takeda)
[[[20281]]]
1WA-2
はじめに
[17:40]
兵庫県立大・生命 (Dept. of Life Sci., Univ. of Hyogo,)、2阪大・蛋白研 (IPR, Osaka Univ.)
創薬に期待されるタンパク質の活性部位の構造情報
Active site structural information to perform structure based drug design
○山縣ゆり子 (Yuriko Yamagata)
熊本大・薬 (Grad. Sch. of Pharmceut. Sci. Kumamoto Univ.)
（36）
[18:00]
タンパク質の量子化学計算の現状
Current status of quantum-chemical calculations for proteins
○田中成典 (Shigenori Tanaka)
神戸大・シス情・計算 (Grad. Sch. Sys. Inform., Kobe Univ. )
1WC1
C 会場（4 階会議室 2）/ Room C（4F Conference room 2）
6 月 24 日 ( 水 ) / June 24 (Wed.)　13:00 ～ 15:30
SACLA が切り拓く構造生命科学研究
Recent progress in structural life science at SACLA
Ｘ線自由電子レーザー（XFEL）の利用により，これまでには見ることができなかった生体分子の現象やそれら複合
体の構造の可視化を可能にするための技術が確立されつつある。そこで本ワークショップでは，日本の XFEL 施設で
ある SACLA を利用し、構造生命科学の分野に新たな息吹を吹き込もうとしている研究者 6 名に最新の話題を紹介し
て頂き討論を行う。
Recent availability of intense, femtosecond X-ray pulses from X-ray free-electron lasers (XFELs) has opened a new
era in structural life science. We will discuss current hot topics for groundbreaking research with XFEL at SACLA.
オーガナイザー：中津亨（京都大）、菅原道泰（理研）
Organizers: Toru Nakatsu (Kyoto Univ.), Michihiro Sugahara (RIKEN)
[13:00]
Opening Remarks
中津亨 (Toru Nakatsu)
京都大 (Kyoto Univ.)
[[[99995]]]
1WC1-1
[13:06]
[13:30]
[13:54]
[[[20283]]]
SACLA を用いた SFX 解析による膜蛋白質構造解析
Membrane protein SFX-analysis by using X-ray free electron laser in SACLA
○西澤知宏 (Tomohiro Nishizawa)
東大・理・生科 (Dept. of Biol. Sci. Grad. Sch. of Sci., Univ. of Tokyo)
[[[20272]]]
シリアルフェムト秒結晶構造解析のための汎用的タンパク質キャリヤ「グリースマトリックス」
理研 SPring-8 センター (RIKEN SPring-8 Center)
1WC1-4
高輝度セ (JASRI)、2理研・SPring-8 (RIKEN SPring-8 Center)
Grease matrix as a versatile carrier of proteins for serial femtosecond crystallography
○菅原道泰 (Michihiro Sugahara)
[[[20139]]]
1WC1-3
連続フェムト秒結晶構造解析プラットフォーム DAPHNIS
DAPHNIS, an Experimental Platform for Serial Femtosecond Crystallography
○登野健介 1,2 (Kensuke Tono)
1
[[[20011]]]
1WC1-2
はじめに
[14:18]
X 線自由電子レーザーを用いたチトクロム酸化酵素の 1.9 Å 無損構造解析
Determination of damage-free crystal structure of bovine heart cytochrome c oxidase
using an XFEL
○平田邦生 1 (Kunio Hirata)、伊藤 - 新澤恭子 2 (Kyoko Shinzawa-Itoh)、吾郷日出夫 1 (Hideo Ago)
1
2
理化学研究所・放射光科学総合研究センター (RIKEN/SPring-8 Center)、
兵庫県立大・院生命理学 (Department of Life Science, University of Hyogo)
（37）
WorkShop
[[[20088]]]
Day 1 (June 24)
1WA-6
1WC1-5
[14:42]
Ｘ線自由電子レーザーによる生きた細胞のナノイメージング
Live Cell Nano-imaging by using X-ray free-electron laser
○西野吉則 1 (Yoshinori Nishino)、木村隆志 1 (Takashi Kimura)、吉田力矢 1 (Rikiya Yoshida)、
于健 1 (Jian Yu)、城地保昌 2 (Yasumasa Joti)、別所義隆 3 (Yoshitaka Bessho)
1
Day 1 (June 24)
WorkShop
[[[20093]]]
3
1WC1-6
[15:06]
北大・電子研 (Res. Inst. Elect. Sci., Hokkaido Univ.)、2高輝度光科学研究センター (Japan Synchrotron Radiat. Res. Inst./SPring 8)、
台湾中央研究院物理研究所 (Inst. Phys., Academia Sinica)
低温コヒーレントＸ線回折イメージングによる細胞内小器官の構造研究
Structural studies of cellular organella by using coherent X-ray diffraction imaging at
cryogenic temperature
○中迫雅由 1,2 (Masayoshi Nakasako)、関口優希 1,2 (Yuki Sekiguchi)、小林周 1,2 (Amane Kobayashi)、
苙口友隆 1,2 (Tomotaka Oroguchi)、乾弥生 3 (Yayoi Inui)、松永幸大 3 (Sachihiro Matsunaga)、
市川雄一 4 (Yuichi Ichikawa)、胡桃坂仁志 4 (Hitoschi Kurumizaka)、清水光弘 5 (Mitsuhiro Shimizu)、
高山裕貴 2 (Yuki Takayama)、山本雅貴 2 (Masaki Yamamoto)
慶應大・理工 (Fac. Sci. & Tech., Keio Univ.)、2理研・RSC (RIKEN RSC)、
東京理科大・理工 (Fac. Sci. & Tech. Tokyo Univ. Sci.)、4早稲田大・先進理工 (Schl. Adv. Sci. & Eng., Waseda Univ.)、
5
明星大・理工 (Schl. Sci. & Eng. Meisei Univ.)
1
[[[20339]]]
3
1WC2
C 会場（4 階会議室 2）/ Room C（4F Conference room 2）
6 月 24 日 ( 水 ) / June 24 (Wed.)　16:00 ～ 18:30
脂質関連タンパク質の生理機能と機能性脂質生産への応用
Physiological function of lipid-related proteins and their application for
functional lipid production
さまざまな脂質とタンパク質との相互作用が細胞の構造維持や環境適応などに関わっている。また、生物で重要な機
能性脂質は多様な酵素により生合成され代謝されている。ここでは、細胞の油滴形成、動物および植物における脂質
メディエーター産生酵素、微生物の脂肪酸変換と低温耐性機構に関わるタンパク質の生理機能やその応用について紹
介する。
The interaction of the various lipids with proteins is concerned with structure preservation and environmental
adaptation of a cell. Functional lipids which play important roles in organisms are synthesized and metabolized by
various enzymes. In this workshop, we introduce current topics on physiological function and application of proteins
related with the formation of lipid particles, production of lipid signaling molecules in animals and plants, microbial
conversion of lipids, and mechanism of cold adaptation in bacteria.
オーガナイザー：田中保（徳島大）、櫻谷英治（徳島大）
Organizers: Tamotsu Tanaka (Tokushima Univ.), Eiji Sakuradani (Tokushima Univ.)
1WC2-1
[16:00]
Regulation of lipid droplet functions by lipid droplet-binding proteins
倉元謙太 1,2 (Kenta Kuramoto)、○大隅隆 1 (Takashi Osumi)
1
[[[20024]]]
1WC2-2
[[[20263]]]
脂肪滴結合タンパク質による脂肪滴機能の調節
[16:25]
兵庫県立大・生命理学 (Grad. Sch. of Life Sci., Univ. of Hyogo)、2ノースウェスタン大・医 (Northwestern Med Sch.)
ホスホリパーゼ A/ アシルトランスフェラーゼ（PLA/AT）ファミリーの生理機能解析
Physiological analysis of the phospholipase A/acyltransferase (PLA/AT) family
○上田夏生 (Natsuo Ueda)
香川大・医・生化学 (Dept. of Biochem., Kagawa Univ. Sch. of Med.)
（38）
植物に見出されたスフィンゴリン脂質特異的ホスホリパーゼ D の性質
Identification of a sphingophospholipid-specific phospholipase D in plants
○田中保 1 (Tamotsu Tanaka)、松岡久嗣 1 (Hisatsugu Matsuoka)、伊藤葵 1 (Aoi Itoh)、
木村朱里 1 (Akari Kimura)、藤原美奈 1 (Mina Fujihara)、喜田孝史 1 (Takashi Kida)、
今井博之 2 (Hiroyuki Imai)、徳村彰 3 (Akira Tokumura)
徳島大・ヘルスバイオ・衛生薬学 (Inst. Health Biosci., Univ. of Tokushima Grad. Sch.)、
甲南大・自然科学 (Dept. of Biol., Grad. Sch. Natural Sci., Konan Univ.)、
3
安田女子大・薬 (Facul. of Pharm., Yasuda Womens Univ.)
1
[[[20091]]]
2
1WC2-4
[17:15]
エイコサペンタエン酸含有リン脂質の細菌細胞膜における機能とその生合成酵素群の特性
Physiological roles of EPA-containing phospholipids in bacterial cell membrane and
characteristics of enzymes for their synthesis
○栗原達夫 (Tatsuo Kurihara)、川本純 (Jun Kawamoto)
京大・化研 (Inst. Chem. Res., Kyoto Univ.)
[[[20289]]]
1WC2-5
[17:40]
腸内細菌の脂肪酸代謝酵素群の生理機能と機能性脂質生産への応用
Characterization of the enzymes involved in gut microbial fatty acid metabolisms and
its application to functional lipid production
○小川順 (Jun Ogawa)、岸野重信 (Shigenobu Kishino)、竹内道樹 (Michiki Takeuchi)
京大院農・応用生命 (Div. Appl. Life Sci., Grad. Sch. Agric., Kyoto Univ.)
[[[20340]]]
1WC2-6
[18:05]
脂肪酸不飽和化酵素の構造と機能
Structure and function of fatty acid desaturase
○櫻谷英治 1 (Eiji Sakuradani)、小川順 2 (Jun Ogawa)
1
[[[20209]]]
2
1WD
徳大院・ソシオテクノ (Inst. Technol. Sci., Tokushima Univ.)、
京大院農・応用生命 (Div. Appl. Life Sci., Grad. Sch. Agricul., Kyoto Univ.)
D 会場（4 階会議室 3 ＋ 4）/ Room D（4F Conference room 3+4）
6 月 24 日 ( 水 ) / June 24 (Wed.)　16:00 ～ 18:30
蛋白質とアミノ酸のキラルサイエンス
Chiral Science of Proteins and Amino Acids
生体を構成するアミノ酸として、哺乳類にも様々な D- アミノ酸が遊離型として、また蛋白質を構成するアミノ酸残基
として存在して、多様な生理機能を発揮していることが明らかにされてきた。遊離型 D- セリンは、NMDA 受容体の
コアアゴニストとして作用し、蛋白質中の D- アミノ酸残基についても老化や病態との関連が示唆されている。本ワー
クショップでは蛋白質とアミノ酸のキラルサイエンスの研究フロンティアを紹介する。
D-amino acids have been shown to be present widely in organisms, as free or conjugated form with protein, even in
mammals, playing important roles in human pathophysiology. Latest cutting-edge research achievements in chiral
science of proteins and amino acids will be demonstrated to expand the new field of protein science.
オーガナイザー：福井清（徳島大）、藤井紀子（京都大）
Organizers: Kiyoshi Fukui (Univ. of Tokushima), Noriko Fujii (Kyoto Univ.)
[16:00]
[[[99994]]]
はじめに
Opening Remarks
福井清 1 (Kiyoshi Fukui)、藤井紀子 2 (Noriko Fujii)
1
徳島大 (Univ. of Tokushima)、2京都大 (Kyoto Univ.)
（39）
WorkShop
[16:50]
Day 1 (June 24)
1WC2-3
1WD-1
[16:05]
Day 1 (June 24)
WorkShop
徳島大学疾患酵素学研究センター (Institute for Enzyme Research, Tokushima University)
[[[20111]]]
1WD-2
D- アミノ酸とその代謝酵素システムによる脳機能制御に関する疾患酵素学研究
Translational enzymology on the regulation of brain function mediated by
D-amino acid and its metabolic enzyme system
○福井清 (Kiyoshi Fukui)、チャンディエム (Diem Tran)、トリンフアン (Huong Trinh)、
曽我部浩史 (Hirofumi Sogabe)、赤穂尭永 (Takanaga Ako)、宍戸裕二 (Yuji Shishido)、
頼田和子 (Kazuko Yorita)
[16:25]
神経興奮性キラルアミノ酸を利用する創薬シーズ・診断マーカー探索のための
高感度二次元 HPLC 一斉分析
Simultaneous 2D-HPLC determination of neuro-active chiral amino acids for drug discovery
and diagnosis
○三次百合香 1 (Yurika Miyoshi)、笹部潤平 2 (Jumpei Sasabe)、米永弥生 1 (Yayoi Yonenaga)、
中根舞子 3 (Maiko Nakane)、三田真史 3 (Masashi Mita)、金野柳一 4 (Ryuichi Konno)、
相磯貞和 2 (Sadakazu Aiso)、浜瀬健司 1 (Kenji Hamase)
1
[[[20063]]]
4
1WD-3
[16:50]
[17:15]
[17:40]
[[[20306]]]
水晶体タンパク質模擬ペプチド中の Asp 異性化に関わる側鎖の立体配座の NMR 研究
Staggered side-chain conformers prerequisite to transformation from L-α- to
D-β-aspartate in lens crystallin fragment by NMR
○岡村恵美子 (Emiko Okamura)
姫路獨協大・薬 (Faculty of Pharm. Sci., Himeji Dokkyo Univ.)
[[[20026]]]
1WD-6
LC-MS/MS による蛋白質中の Asp 異性体の迅速解析
A rapid analysis of Asp isomers in proteins by LC-MS/MS
○藤井紀子 (Noriko Fujii)
京大・原子炉・放射線生命 (Dept. Rad. Life Sci., RRI, Kyoto Univ.)
[[[20020]]]
1WD-5
アミノ酸トランスポーターと D- アミノ酸輸送
Amino acid transporters and D-amino acids
○永森收志 (Shushi Nagamori)、金井好克 (Yoshikatsu Kanai)
阪大院・医・生体システム薬理 (Bio-system Pharmacol., Grad. Sch. of Med., Osaka Univ.)
[[[20224]]]
1WD-4
九大・薬 (Grad. Sch. Pharmaceut. Sci., Kyushu Univ.)、2慶應大・医 (Keio Univ. Sch. Med.)、3資生堂 (Shiseido Co., Ltd.)、
国際医療福祉大・薬 (Dep. Pharmaceut. Sci., International Univ. Health and Welfare)
[18:05]
神経疾患に関わるペプチド中のアミノ酸残基の構造的変化と生理活性への関わり
Physiological functions of the neuronal disease related peptides bearing structurally
altered amino acid residues.
○定金豊 (Yutaka Sadakane)
鈴鹿医療大・薬 (Suzuka Univ. Med. Sci.)
（40）
1WE
E 会場（5 階小ホール）/ Room E（5F Small hall）
6 月 24 日 ( 水 ) / June 24 (Wed.)　16:00 ～ 18:30
新学術領域研究「細胞死を起点とする生体制御ネットワークの解明」共催
これまで細胞死は、細胞の一生の最終過程であり、その死骸は単に捨て去られる存在であると考えられてきた。とこ
ろが近年、この死細胞が実は情報の発信源となり、免疫応答、炎症、修復、再生、線維化といった生体応答の起点となっ
ていることが明らかになりつつある。本ワークショップでは若手研究者が、細胞死とそれを起点とする生体応答機構
について最新の知見を発表する。
It is well known that cell death is thought to be the terminal step in the lives of cells, therefore, cell corpses should
be removed swiftly. However, recent studies have shown that dying cells release factors that are critically involved
in various biological responses. We have referred to these factors as “dying code”. In this workshop, young scientists
will make presentations about their recent findings focusing on tissue homeostasis regulated by cell death.
オーガナイザー：田中正人（東京薬科大）、中野裕康（東邦大）
Organizers: Masato Tanaka (Tokyo Univ. of Pharm. and Life Sci. ), Hiroyasu Nakano (Toho Univ.)
1WE-1
[16:00]
京大・医・医化学 (Dept. of Med. Chem., Grad. Sch. of Med., Kyoto Univ.)
[[[20240]]]
1WE-2
[16:25]
1
[16:50]
東大・薬・遺伝 (Dept. Genet., Grad. Sch. Pharma. Sci., Univ. of Tokyo)、2さきがけ・科技団 (PRESTO, JST)
ネクローシス制御機構解明を目指したケミカルバイオロジー研究：
蛍光 turn-ON 型アフィニティーラベル化法の開発
Chemical Biology Research for Elucidating Molecular Mechanisms of Necrosis:
Development of Turn-ON Fluorescent Affinity Labeling
○どど孝介 1,2 (Kosuke Dodo)
理研 (RIKEN)、2ERATO-JST
1
[[[20127]]]
1WE-4
細胞死のライブイメージング
Live-imaging analysis of cell death
○山口良文 1,2 (Yoshifumi Yamaguchi)
[[[20336]]]
1WE-3
アポトーシス時のリン脂質のスクランブル機構
Molecular mechanisms of phospholipid scrambling during apoptotsis
○鈴木淳 (Jun Suzuki)、長田重一 (Shigekazu Nagata)
[17:15]
CD169 マクロファージによる生体恒常性維持と疾患制御
Regulation of Homeostasis and Disease Progression by CD169 Macrophage
○浅野謙一 1 (Kenichi Asano)、唐澤一徳 2 (Kazunori Karasawa)、久保木恵理佳 1 (Erika Kuboki)、
宇敷美貴子 1 (Mikiko Ushiki)、田中正人 1 (Masato Tanaka)
東薬大・生命・免疫制御 (Lab. of Immune Reg.,Tokyo Univ. of Pharm.& Life Sci.)、
東京女子医科大学腎臓内科 (Dept. Nephrol., Tokyo Women's Med. Univ.)
1
[[[20280]]]
2
1WE-5
[[[20165]]]
[17:40]
膵分泌性トリプシンインヒビター；SPINK1 の異常がもたらすオートファジー不全、
ネクロプトーシスと慢性膵炎発症メカニズムの解明
Insufficient levels of SPINK induces impaired autophagy and necroptosis resulting to
chronic pancreatitis
○大村谷昌樹 (Masaki Ohmuraya)
熊大・生命資源 (IRDA, Kumamoto Univ.)
（41）
WorkShop
Homeostatic regulation by cell death
Day 1 (June 24)
細胞死を起点とする生体制御ネットワーク
1WE-6
[18:05]
Day 1 (June 24)
WorkShop
インターロイキン（IL）-11 を介した生体の恒常性維持機構の解析
A crucial role for IL-11 in intestinal homeostasis
○仁科隆史 1 (Takashi Nishina)、出口裕 1 (Yutaka Deguchi)、大塚正人 2 (Masato Ohtsuka)、
中村衣里 3 (Eri Nakamura)、小島裕子 4 (Yuko Kojima)、多田昇弘 3 (Norihiro Tada)、
中野裕康 1 (Hiroyasu Nakano)
東邦大・医・生化学 (Dept. of Biochem., Toho Univ. Sch. of Med.)、
東海大・総合医・ゲノム多様性解析 (Dept. of Mol. Life Sci., Div. of Basic Med. Sci. and Mol. Med., Tokai Univ. Sch. of Med.)、
3
順天堂大・老人性疾患病態・治療研究センター (Lab. of Genome Res., Res. Inst. for Dis. of Old Age, Juntendo Univ. Grad. Sch. of
Med.)、4順天堂大・研究基盤センター (Biomed. Res. Center, Juntendo Univ. Grad. Sch. of Med. )
1
[[[20184]]]
2
1WF1
F 会場（5 階会議室 6）/ Room F（5F Conference room 6）
6 月 24 日 ( 水 ) / June 24 (Wed.)　13:00 ～ 15:30
化学修飾の蛋白質科学と医療への展開
Chemical modification on protein science and medical application.
蛋白質科学および分析技術の発展に伴い、様々な蛋白質の化学修飾が同定されている。それら微小な構造変化は疾患
の要因となる一方、抗体医薬や生物製剤の品質管理において重要であるなど医療への関わりが大きいが、それらを完
全に把握し制御することは難しい。本ワークショップでは、化学修飾による蛋白質の構造および機能変化や、医療へ
の応用について紹介するとともに、今後の課題について議論したい。
The tiny structural changes of proteins induced by the chemical modifications are recognized as a risk for a several
disorders. In addition, the reduction of unintended chemical modifications is an important issue for biological
medicines. However, it is difficult to control and fully comprehend the chemical modifications of proteins. In this
workshop, the impacts of chemical modifications on the protein structure, biological function and medical application
will be discussed.
オーガナイザー：内山進（大阪大）、赤澤陽子（産総研）
Organizers: Susumu Uchiyama (Osaka Univ.), Yoko Akazawa (AIST)
[13:00]
はじめに
Opening Remarks
[[[99993]]]
1WF1-1
[13:05]
Production of DNA mimic proteins via lysine pyrrolation
○内田浩二 (Koji Uchida)
名大・院・生命農 (Grad. Sch. Bioagric. Sci., Nagoya Univ.)
[[[20218]]]
1WF1-2
[13:30]
[[[20098]]]
毛髪タンパク質の脱イミノ化反応と医薬探索への応用
Protein Deimination in Hair Follicle and its Application for Drug Discovery
○木澤謙司 (Kenji Kizawa)
花王（株）生物科学研究所 (Biological Science Research Laboratory, Kao Corporation)
[[[20007]]]
1WF1-3
リジンピロール化による DNA 様タンパク質の生成
[13:55]
パーキンソン病関連分子 DJ-1 のシステイン酸化体の検出法開発から早期診断への応用展開
Development of oxidized DJ-1 detection system and application for diagnosis of
Parkinson's disease at early-stage
○斎藤芳郎 (Yoshiro Saito)
同志社大・生命医・医生命システム (Dept. of Med. Life Sys., Fac. of Life Med. Sci., Doshisha Univ.)
（42）
[14:20]
第一三共・バイオ基盤研 (New Modality Research Laboratories, R&D Division, Daiichi Sankyo Co., Ltd.)
[14:45]
The mechanism of heat-induced irreversible denaturation and medical application of
single domain VHH antibody
○赤澤陽子 (Yoko Akazawa)、萩原義久 (Yoshihisa Hagihara)
産総研 (AIST)
[[[20068]]]
1WF1-6
ラクダ科動物由来シングルドメイン VHH 抗体の耐熱性と抗体医薬への応用
[15:05]
PEG 化抗体医薬品の物性について
Physico-chemical properties of PEGylated therapeutic antibody fragment
○古木健一朗 (Kenichiro Furuki)、山口秀人 (Hideto Yamaguchi)、木本梨絵 (Rie Kimoto)、
東海林秀樹 (Hideki Shoji)
アステラス製薬・バイオ技術研 (Biotechnology Labs, Astellas Pharma Inc.)
[[[20036]]]
1WF2
F 会場（5 階会議室 6）/ Room F（5F Conference room 6）
6 月 24 日 ( 水 ) / June 24 (Wed.)　16:00 ～ 18:30
バイオインパクトマテリアル：その生体衝撃性の仕組みと応用性
Bioimpact Materials: Mechanism and application of its bioimpact property
本ワークショップでは、生体に作用し、細胞の構造や機能に劇的な影響を及ぼす様々なペプチド性 / 蛋白性の毒素や
酵素といった生体衝撃性物質（バイオインパクトマテリアル：BIM）について、その構造情報に基づいた生体衝撃性
の分子作用機構に迫る研究、またその成果を応用した、有用物質の生産と活用を目指す研究など、BIM に関する興味
深い最近の取り組みを紹介する。
This workshop introduces the researches of interest to clarify the molecular mechanism of bioimpact action of
bioimpact materials (BIM) such as peptidic/proteinous toxins or enzymes dramatically affecting the target cell
structure and function on the basis of their detailed structural information, and also the researches to aim at production
and application of useful materials by applying the results of basic investigations on BIM.
オーガナイザー：堀口安彦（大阪大）、長宗秀明（徳島大）
Organizers: Yasuhiko Horiguchi (Osaka Univ.), Hideaki Nagamune (Tokushima Univ.)
[16:00]
Opening Remarks
長宗秀明 (Hideaki Nagamune)
徳島大 (Univ. of Tokushima)
[[[99992]]]
1WF2-1
[[[20319]]]
はじめに
[16:05]
ボツリヌス神経毒素複合体の体内侵入機序とワクチン輸送体としての応用
Invasion mechanism of botulinum neurotoxin complex and its application to delivery
system for vaccines
○油谷雅広 (Masahiro Yutani)、松村拓大 (Takuhiro Matsumura)、菅原庸 (Yo Sugawara)、
阿松翔 (Sho Amatsu)、藤永由佳子 (Yukako Fujinaga)
阪大・微研・感染細胞生物学 (Lab. Infect. Cell Biol., RIMD, Osaka Univ.)
（43）
WorkShop
[[[20194]]]
1WF1-5
抗体医薬品の化学修飾
Chemical Modifications in Therapeutic Antibodies
○天野正人 (Masato Amano)
Day 1 (June 24)
1WF1-4
1WF2-2
[16:35]
細菌毒素の機能性ドメインを用いた新規再生医療用複合材料
Day 1 (June 24)
WorkShop
Novel composite materials for regenerative medicine based on functional domains derived
from a bacterial toxin
○松下治 1 (Osamu Matsushita)、内田健太郎 2 (Kentaro Uchida)、西望 3 (Nozomu Nishi)、
小出隆規 4 (Takaki Koide)、Sakon Joshua5
岡山大・院医歯薬・病原細菌 (Dept. Bacteriol., Okayama Univ. Grad. Sch. Med. Dent. Pham. Sci.)、
北里大・医・整形外科 (Dept. Orthop. Surg., Kitasato Univ. Sch. Med.)、
3
香川大・総合生命科学研究セ (Life Sci. Res. Center, Kagawa Univ.)、
4
早稲田大・先進理工 (Fac. Sci. Eng., Waseda Univ.)、5Dept. Chem. Biochem., Univ. Arkansas
1
[[[20297]]]
2
1WF2-3
[17:05]
The study on proteinaceous toxins from the marine animals
○永井宏史 (Hiroshi Nagai)
東京海洋大・環境 (Dept. Ocean Sci., Tokyo Univ. Mar. Sci. Tech.)
[[[20144]]]
1WF2-4
[17:35]
国循セ・研・心臓生理 (Natl. Cerebral Cardiovasc. Ctr. Res. Inst.)
[18:05]
筑波大・数理物質・化学 (Grad. Sch. Pure and Appl. Sci., Univ. of Tsukuba)
[18:35]
[[[99991]]]
哺乳類由来の神経毒の化学生物学研究
Bioorganic Studies on Neurotoxic Venoms from Mammarian Origin
○北将樹 (Masaki Kita)
[[[20002]]]
ヘビ毒由来プロテアーゼの立体構造と作用機構
Structure and function of snake venom proteinases
○武田壮一 (Soichi Takeda)
[[[20031]]]
1WF2-5
海洋生物のタンパク質毒素の科学
おわりに
Closing Remarks
堀口安彦 (Yasuhiko Horiguchi)
大阪大 (Osaka Univ.)
（44）
2WA1
A 会場（1 階ホール）/ Room A（1F Hall）
6 月 25 日 ( 木 ) / June 25 (Thu.）　13:00 ～ 15:30
巨大生物マシンの構築原理と機能発現
The complicated chemical reactions and molecular transportations in the living organisms, are performed by the
huge biologcal machines constructed by multi-molecules. This workshop will focus on the functions and assembly
mechanisums of such huge biomachines.The future progresses will also be discussed.
オーガナイザー：栗栖源嗣（大阪大）、姚閔（北海道大）
Organizers: Genji Kurisu (Osaka Univ.), Min Yao (Hokkaido Univ.)
[13:00]
はじめに
Opening Remarks
[[[99990]]]
2WA1-1
[13:03]
黄色ブドウ球菌が赤血球を破壊する毒素の作用原理
Molecular mechanism of pore forming toxin from Staphylococcus aureus
○田中良和 1,2 (Yoshikazu Tanaka)、山下大智 2 (Daichi Yamashita)、菅原宇希 2 (Takaki Sugawara)、
金子淳 3 (Jun Kaneko)、神尾好是 4 (Yoshiyuki Kamio)、姚閔 1,2 (Min Yao)
北大院・先端生命 (Fac. of Adv. Life Sci., Hokkaido Univ.)、2北大院・生命科学 (Grad. Schl. of Life Sci., Hokkaido Univ.)、
東北大院・農 (Grad. Schl. of Agr. Sci., Tohoku Univ.)、4尚絅学院大 (Shokei Gakuin Univ.)
1
[[[20070]]]
3
2WA1-2
[13:25]
Gene products which materialize the formation of phage virion
○有坂文雄 1 (Fumio Arisaka)、金丸周司 2 (Shuji Kanamaru)
日大・生物資源・応生 (Biores. Sci., Nihon Univ.)、2東工大・生命理工 (Grad. Sch, of Biosci. Bioeng., Tokyo Inst. Tech.)
1
[[[20234]]]
2WA1-3
[13:50]
理研・構造生物 (RIKEN Struc. Biol. Lab.)
[14:15]
[[[20078]]]
集光アンテナタンパク質と反応中心の複合体（LH1-RC）の結晶構造
Crystal Structure of Complex between Light-harvesting Antenna Protein and Reaction
Center (LH1-RC)
○三木邦夫 (Kunio Miki)
京大・院理・化学 (Dept. of Chem., Grad. Sch. Sci., Kyoto Univ.)
[[[20136]]]
2WA1-5
転写・翻訳における巨大複合体の構造と機能
Structures and functions of large complexes in transcription and translation
○横山茂之 (Shigeyuki Yokoyama)
[[[20343]]]
2WA1-4
バクテリオファージの構造形成を支える蛋白質
[14:40]
光化学系 I- フェレドキシンの電子伝達複合体構造から読み解く電子伝達の動的メカニズム
Structural basis for the dynamic electron transfer between photosystem I and ferredoxin
○河合寿子 1 (Hisako Kawai)、武藤梨沙 1,2 (Risa Mutoh)、ピエールセティフ 3 (Sétif Pierre)、
ノヴァチクマーク 4 (Marc Nowaczyk)、レグナーマティアス 4 (Matthias Rögner)、
池上貴久 5 (Takahisa Ikegami)、田中秀明 1,2 (Hideaki Tanaka)、栗栖源嗣 1,2 (Genji Kurisu)
1
5
阪大・蛋白研 (IPR, Osaka Univ.)、2JST-CREST、3CEA Saclay、4Ruhr-University Bochum、
横市大・生命医科学 (Grad. Sch. of Medical Life Science, Yokohama City Univ.)
（45）
WorkShop
生体内で起こる複雑な化学反応や分子運動は、複数の分子により構築された巨大生物マシンが正確に機能する事によっ
て行われている。本ワークショップでは巨大生物マシンの構築原理に焦点を当て、その解明に取り組む先生方に最新
の研究成果をご発表いただく。また、より複雑な生命マシンの構築原理と機能発現の解析に関する最近の研究の動向
と今後の課題についても議論する。
Day 2 (June 25)
Assembly and function mechanism of the huge biological machines
2WA1-6
[15:05]
ミドリムシ光センシング装置の一分子から器官まで
Molecular photosensing system of Euglena ~from molecules to organelles~
○岩崎憲治 1 (Kenji Iwasaki)、宮崎直幸 1,2 (Naoyuki Miyazaki)、伊関峰生 3 (Mineo Iseki)、
長谷川浩司 4 (Koji Hasegawa)、成田哲博 5 (Akihiro Narita)、松永茂 6 (Shigeru Matsunaga)、
建部益美 6 (Masumi Tatebe)、朴三用 7 (Sam-Yong Park)、渡辺正勝 8 (Masakatsu Watanabe)
Day 2 (June 25)
WorkShop
阪大・蛋白研 (IPR, Osaka Univ.)、2生理研 (NIPS)、3東邦大・薬学 (Pharm. Toho Univ. )、
アドバンスソフト (AdvanceSoft Corp.)、5名大・理・構造セ (Struct. Biol. Res. Center, Grad. Sch. of Sci., Nagoya Univ.)、
6
浜ホト ( 株 ) (Hamamatsu Photonics K.K.)、7横浜市大・生命医科学 (Grad. Sch. of Med. Life Sci., Yokohama City Univ.)、
8
光産業創成大学院大 (Grad. Sch. for the Creation of New Photonics Industries )
1
[[[20161]]]
4
2WA2
A 会場（1 階ホール）/ Room A（1F Hall）
6 月 25 日 ( 木 ) / June 25 (Thu.）　16:00 ～ 18:30
蛋白質科学における中性子利用の現状と展望
Progress and Prospects of Neutron Beam Utilization in Protein Science
日本国内では、パルス中性子源である J-PARC が順調に稼働しており、蛋白質の構造とダイナミクスの研究は新たな
展開を迎えている。中性子に関する最新の研究の成果をまとめるとともに、蛋白質科学における中性子利用における
今後の展望について議論を深めたい。
The spallation neutron source, J-PARC, is applied to structural and molecular dynamics studies for protein science.
This workshop will be talked and discussed about recent progress and future prospects for neutron beam utilization in
protein science.
オーガナイザー：玉田太郎（原子力機構）、海野昌喜（茨城大）
Organizers: Taro Tamada (JAEA), Masaki Unno (Ibaraki Univ.)
[16:00]
はじめに
Opening Remarks
[[[99989]]]
2WA2-1
[16:05]
Importance of amide-imidic acid tautomerization visualized by neutron structural analysis:
inverting cellulase as an example
○五十嵐圭日子 (Kiyohiko Igarashi)
東大・農生科・生材 (Dept. of Biomat. Sci., Grad. Sch. of Agric. Life Sci., Univ. of Tokyo)
[[[20342]]]
2WA2-2
[16:35]
原子力機構・量子ビーム (JAEA, QuBS)、2JST・さきがけ (JST, PRESTO)
1
[17:05]
[[[20061]]]
FPPS －ビスホスホネート複合体におけるプロトン化状態と水和構造
Protonation state and hydration in human farnesyl pyrophosphate synthase bound to
bisphosphonate
○横山武司 (Takeshi Yokoyama)
富山大・薬 (Fac. of Pharm. Sci. Univ. of Toyama)
[[[20216]]]
2WA2-4
中性子非弾性散乱による蛋白質ダイナミクスの解析
Protein dynamics studied by inelastic neutron scattering
○中川洋 1,2 (Hiroshi Nakagawa)
[[[20075]]]
2WA2-3
中性子構造解析で見えたアミド－イミド酸互変位の重要性：立体反転型セルラーゼを例に
[17:35]
中性子小角散乱だから見える溶液中のタンパク質の構造
Observable protein structure in solution using small-angle NEUTRON scattering
○杉山正明 (Masaaki Sugiyama)
京大・原子炉 (KURRI)
（46）
中性子で見えてきたビリン還元酵素 PcyA の構造的特徴
Neutron Structure of a Billin Reductase, PcyA
○海野昌喜 1,2 (Masaki Unno)、須藤久美子 1,2,3 (Kumiko Suto-Ishikawa)、
日下勝弘 2 (Katsuhiro Kusaka)、玉田太郎 3 (Taro Tamada)、萩原義徳 4 (Yoshinori Hagiwara)、
杉島正一 5 (Masakazu Sugishima)、和田啓 6 (Kei Wada)、山田太郎 2 (Taro Yamada)、
石原真樹子 2 (Makiko Ishihara)、福山恵一 7,8 (Keiichi Fukuyama)
茨大・院理工・応用粒子 (Inst. Appl. Beam. Sci., Grad. Scho. Sci. Eng., Ibaraki Univ.)、
茨大・フロンティア (iFRC, Ibaraki Univ.)、3原子力機構・量子ビーム (Quant. Beam. Sci. Direct., JAEA)、
4
久留米高専・生物応化 (Dep. Biochem. Appl. Cgem. Kurume Nat. Coll. Tech.)、
5
久留米大・医 (Dep. Med. Biochem., Kurume Univ. Sch. Med.)、6宮崎大・TT 推進機構 (Org. Pomot. TT., Univ. Miyazaki)、
7
阪大・院工 (Grad. Sch. Engin., Osaka Univ.)、8阪大・院理 (Grad. Sch. Sci., Osaka Univ.)
1
[[[20221]]]
2
2WB
B 会場（4 階大会議室）/ Room B（4F Main conference room）
6 月 25 日 ( 木 ) / June 25 (Thu.）　16:00 ～ 18:30
微生物による組換え蛋白質発現
Bacterial production of recombinant proteins
平成 20 年 6 月から公開を始めた蛋白質科学会アーカイブは、蛋白質研究者が実験技術ノウハウを紹介するウェブベー
スのプロトコル集で、現在までに 85 種類のプロトコル、総説が公開され、WEB ページ閲覧数は年間に 45 万件、原
稿 PDF のダウンロード数は年間 50 万件を超える。
本年度のワークショップでは、微生物による蛋白質発現についての最近の実験技術の進歩と実際に実験を行う際のコ
ツについて専門家の皆様にご講演頂く。
PSSJ Archives is the web-based site of protocols for protein research, started from June of 2008. So far, 85 protocols
and articles are stored in the site and their PDFs have been downloaded more than 500,000 times per year in total.
In this workshop, we focused on the protein expression utilizing microorganism. The experts of these methods will
introduce the recent topics of recombinant protein expression and useful tips for the experiments.
オーガナイザー：岩谷奈央子（名古屋大）、萩原義久（産総研）
Organizers: Naoko Iwaya (Nagoya Univ. ), Yoshihisa Hagihara (AIST)
2WB-1
[16:00]
異種組換え蛋白質発現
Expression of recombinant proteins in methylotrophic yeast Pichia pastoris using
a disposable culture-bag
○村木三智郎 (Michiro Muraki)
産総研・バイオメディカル (Biomed. Res. Inst., AIST)
[[[20006]]]
2WB-2
[16:25]
大関（株）総合研究所 (General Research Laboratory, Ozeki Corp.)
[[[20029]]]
[16:50]
[[[20051]]]
酵母発現系を用いた安定同位体標識試料の調製法
Preparation of isotopically-labeled recombinant proteins by using yeast expression systems
○杉木俊彦 (Toshihiko Sugiki)
大阪大学蛋白質研究所 (Institute for Protein Research, Osaka University)
[[[20311]]]
2WB-4
麹菌による蛋白質大量生産システムの開発
Efficient protein expression system in filamentous fungi, Aspergillus species
○幸田明生 (Akio Koda)、坪井宏和 (Hirokazu Tsuboi)、峰時俊貴 (Toshitaka Minetoki)、
坊垣隆之 (Takayuki Bogaki)
2WB-3
ディスポーザブルカルチャーバッグを利用したメタノール資化性酵母 Pichia pastoris による
[17:15]
大腸菌染色体からワンコピー発現系の蛋白質科学への応用
Application of the expression system using chromosome engineering for protein science.
○上垣浩一 (Koichi Uegaki)
産総研 (AIST)
（47）
WorkShop
[18:05]
Day 2 (June 25)
2WA2-5
2WB-5
[17:40]
ヒゲタ醤油・研 (Higeta Shoyu, R & D)
[[[20089]]]
Day 2 (June 25)
WorkShop
2WB-6
Brevibacillus 発現システムによるタンパク質の効率的分泌生産
Brevibacillus Expression System for Efficient Production of Secretory Proteins
○花方寛 (Hiroshi Hanagata)
[18:05]
膜蛋白質の大量調製に向けた出芽酵母（S. cerevisiae ）の利用；GPCR を例に
Practical use of S. cerevisiae for large-scale production of integral membrane proteins;
the case of G-protein coupled receptors
○白石充典 (Mitsunori Shiroishi)
九大・薬 (Grad. Sch. of Pharmaceu. Sci., Kyushu Univ.)
[[[20177]]]
2WC1
C 会場（4 階会議室 2）/ Room C（4F Conference room 2）
6 月 25 日 ( 木 ) / June 25 (Thu.）　13:00 ～ 15:30
プリオン生物学の新展開
New development of prion biology
近年、プリオン病のカテゴリーが大きく変わりつつある。アルツハイマー病やパーキンソン病などの多くの神経変性
疾患も、プリオンライクなメカニズムで発症すると考えられるようになってきた。また、プリオンタンパク質のダイ
ナミクスやフォールディング現象も解明されつつある。さらに、プリオンの構造やダイナミクスに基づいて早期診断
や早期治療も始まりつつある。単なる構造解析に留まらない、大きく変わりつつあるプリオン生物学の現況について
考察し、タンパク質科学の未来を考える。
It is considered that many neurodegenerative diseases, such as Alzheimer's or Parkinson's disease, are caused by
the prion-like mechanism. Dynamics and folding mechanism of a prion protein have been gradually uncovered,
and moreover, a therapeutic agent for prion diseases, such as a medical chaperone, which is designed based on the
structural & dynamical information of a prin protein, is now in development. We will discuss the current status of the
prion biology and image the future of protein science.
オーガナイザー：桑田一夫（岐阜大）
Organizer: Kazuo Kuwata (Gifu Univ.)
2WC1-1
[13:00]
構造生物学的手法を用いた異種間プリオン蛋白質の相互作用解析
Structural Characterization of Two Distinct Yeast Prion Protein Interaction
○志田俊信 1,2 (Toshinobu Shida)、鎌足雄司 3 (Yuji Kamatari)、山口芳樹 4 (Yoshiki Yamagushi )、
桑田一夫 5 (Kazuo Kuwata)、田中元雅 1,2 (Motomasa Tanaka)
東工大・生命理工 (School of Biosci. & Biotech. Tokyo Inst. Tech )、2理研・BSI (BSI RIKEN)、
岐阜大・生命科学総合研究支援センター (Life Sci. Res. Cent. Gifu Univ. )、4理研・糖鎖構造生物 (Struc. Glycobio RIKEN)、
5
岐阜大・連合創薬 (CEID Gifu Univ.)
1
[[[20251]]]
3
2WC1-2
[13:23]
Competing pathway of solubility-limited formation of protein aggregates
○宗正智 (Masatomo So)、後藤祐児 (Yuji Goto)
阪大・蛋白研 (Inst. Protein Res., Osaka Univ.)
[[[20180]]]
2WC1-3
[13:46]
[[[20096]]]
プリオン蛋白質のモルテングロビュール状態とミスフォールディング
Molten globule state and misfolding of a prion protein
○山口圭一 1 (Kei-ichi Yamaguchi)、本田諒 2 (Ryo P. Honda)、桑田一夫 1,2 (Kazuo Kuwata)
岐阜大・連合創薬 (Unit. Grad. Sch. of Drug Dis. and Med. Inf. Sci., Gifu Univ.)、2岐阜大・医 (Grad. Sch. of Med., Gifu Univ.)
1
[[[20158]]]
2WC1-4
溶解度依存的な競争的蛋白質凝集形成機構
[14:09]
Novel molecular mechanism for accumulation of abnormal prion protein
- Inhibition of Sortilin-mediated PrP degradation
○内山圭司 (Keiji Uchiyama)、坂口末廣 (Suehiro Sakaguchi)
徳島大・酵素センター (Inst. for Enz. Res., Univ. of Tokushima)
（48）
[14:32]
神戸大・理・化学 (Dept. Chem. Grad. Sch. Sci., Kobe Univ.)
[14:55]
The conformational properties of prion strains are transmitted to recombinant prion
protein fibrils in real-time quaking induced conversion
○新竜一郎 (Ryuichiro Atarashi)
長大・医・感染分子 (Department of Molecular Microbiology and Immunology Nagasaki University Graduate School of
Biomedical Sciences)
[[[20128]]]
2WC1-7
異常型プリオンタンパク試験管内増幅技術によるプリオン株現象の分子機構の解析
[15:18]
プリオン異常化機構の解明と診断及び治療
Elucidation of the pathogenic conversion mechanism of a prion protein,
diagnosis and treatent
○桑田一夫 (Kazuo Kuwata)
岐阜大学大学院連合創薬医療情報研究科 (U. Grad. Sch. Drug Discov. Med. Inf. Sci., Gifu Univ.)
[[[20134]]]
2WC2
C 会場（4 階会議室 2）/ Room C（4F Conference room 2）
6 月 25 日 ( 木 ) / June 25 (Thu.）　16:00 ～ 18:30
高感度免疫測定法による蛋白質の超微量定量および医学応用
Ultra-sensitive immunoassay of protein and medical apprication
免疫測定法はペプチドやタンパク質を特異的かつ高感度に定量する方法として広く普及して来た。殊に医学における
貢献は大きい。そして、その追求された検出感度は分子レベルにまで達して来ている。本ワークショップでは、超高
感度測定に至る原理や方法とその臨床応用について、最近の知見を紹介したい。
Immunoassay methods have come to be a widely prevalent method of determining specific quantities of miniscule
amounts of peptides or proteins. Above all, immunoassay methods have made great contributions to the advancement
of medical science. And they have now reached the sensitivity to detect at a molecular level. This workshop will
explain the theory and techniques of ultra-sensitive immunoassay, as well as introduce recent findings in regards to
their clinical application.
オーガナイザー：橋田誠一（徳島文理大）、片上秀喜（帝京大学ちば総合医療センター）
Organizers: Seiichi Hashida (Tokushima Bunri Univ.), Hideki Katakami (Teikyo Univ. Chiba Med. Cnt.)
2WC2-1
[16:00]
Ultra-sensitive immunoassay of protein and medical apprication
○橋田誠一 (Seiichi Hashida)
徳島文理大・健康研・生活習慣病 (Inst. for Health Sci. Tokushima Bunri Univ.)
[[[20009]]]
2WC2-2
[16:30]
[[[20189]]]
デジタルバイオアッセイ
Digital Bioassay
○野地博行 (Hiroyuki Noji)
東大・工 (Grad Sch. of Eng., Univ. Tokyo.)
[[[20341]]]
2WC2-3
高感度免疫測定法による蛋白質の超微量定量および医学応用
[17:00]
デジタル単一分子カウント技術を用いた低濃度バイオマーカーの定量分析
Quantitative analysis of low abundant biomarker by the digital Single Molecule Count
technology
○福浦正義 (Masayoshi Fukuura)、瀬口武史 (Takeshi Seguchi)、山本有希子 (Yukiko Yamamoto)
プライムテック株式会社 (Primetech corp.)
（49）
WorkShop
[[[20204]]]
2WC1-6
アミロイド線維核の生成メカニズムの解明
Investigation of molecular mechanism for the formation of amyloidogenic nuclei
○茶谷絵理 (Eri Chatani)
Day 2 (June 25)
2WC1-5
2WC2-4
[17:30]
ヒト視床下部・下垂体ホルモンにたいする超高感度測定からみえてくるもの
Developments and clinical applications of ultrasensitive EIAs for human hypothalamic and
pituitary hormones
○片上秀喜 1 (Hideki Katakami)、橋田誠一 2 (Seiichi Hashida)
1
帝京大学ちば総合医療センター・内科・臨床研究部 (Div. of Clin. Research Sciences, Dept of Medicine,
Teikyo Univ. Chiba Medical Center)、
2
徳島文理大学・健康科学研究所 (Tokushimabunri Univ. Inst. for Health Sciences)
[[[20249]]]
Day 2 (June 25)
WorkShop
2WC2-5
[18:00]
潜在性Ｂ型肝炎における超高感度 HBs 抗原測定の臨床的意義
Clinical evaluation of super high-sensitive detection of hepatitis B virus surface antigen in
occult hepatitis B infection
○田中靖人 (Yasuhito Tanaka)
名市大・医・病態医科 (Departments of Virology & Liver unit, Nagoya City University Graduate School of Medical Sciences)
[[[20005]]]
2WD
D 会場（4 階会議室 3 ＋ 4）/ Room D（4F Conference room 3+4）
6 月 25 日 ( 木 ) / June 25 (Thu.）　16:00 ～ 18:30
酵素・蛋白質研究、ケミカルバイオロジーの医療応用への展開
Medical application and development of the studies on enzyme, protein and
chemical biology
本ワークショップでは、細胞機能障害によって発症する様々な疾病を念頭に、その治療戦略に関与する酵素と蛋白質
研究、さらに生命科学と化学が融合したケミカルバイオロジー研究を中心に演題を選んだ。細胞膜でのクラスリン依
存性エンドサイトーシス、ミトコンドリアでのエネルギー代謝、リソゾームでの代謝産物の分解といった細胞機能に
対する治療戦略を紹介すると共に、化学合成によるタンパク質製剤調製への挑戦について紹介したい。
This workshop introduces several topics of medical application studies on enzyme, protein and chemical biology for
the treatment of cellular dysfunction. The topics are clathrin-dependent endocytosis in plasma membrane, treatment
of disorder of energy metabolism in mitochondria, treatment of catabolic enzyme disorder in lysosome and chemical
synthesis and protein drug manufacturing.
オーガナイザー：木戸博（徳島大）、伊藤孝司（徳島大）
Organizers: Hiroshi Kido (Tokushima Univ.), Kohji Itoh (Tokushima Univ.)
[16:00]
はじめに
Opening Remarks
[[[99988]]]
2WD-1
[16:05]
Protein-protein interactions in clathrin-mediated endocytosis
○嶋田睦 1,2 (Atsushi Shimada)、山口淳子 1 (Atsuko Yamaguchi)、神田大輔 1 (Daisuke Kohda)
九大・生医研 (Med. Inst. Bioreg., Kyushu Univ. )、2理研・構造生物 (RIKEN Struct. Biol. Lab. )
1
[[[20199]]]
2WD-2
[[[20231]]]
クラスリン依存性エンドサイトーシスにおけるタンパク質－タンパク質相互作用
[16:35]
化学合成によるタンパク質製剤調製への挑戦
Attempt to prepare protein therapeutics using protein chemical synthesis
○大高章 (Akira Otaka)、佐藤浩平 (Kohei Sato)、重永章 (Akira Shigenaga)
徳大・ヘルスバイオサイエンス (Inst. Health Bio. Sci., Tokushima Univ.)
（50）
新規組換えリソソーム酵素の創製とリソソーム病治療への応用
Development of novel recombinant lysosomal enzymes and application for lysosomal
disease therapy
○伊藤孝司 1,2,3,4,5 (Kohji Itoh)、西岡宗一郎 1 (So-ichiro Nishioka)、東哲也 1 (Tetsuya Higashi)、
辻大輔 1 (Daisuke Tsuji)、真板宣夫 2 (Nobuo Maita)、小林功 3 (Isao Kobayashi)、
瀬筒秀樹 3 (Hideki Sezutsu)、湯本史明 4 (Fumiaki Yumoto)、原園景 5 (Akira Harazono)、
石井明子 5 (Akiko Ishii)、川崎ナナ 5 (Nana Kawasaki)
徳島大院・医歯薬研・創薬生命工学 (Inst. Health Biosci., Grad. Sch.,Tokushima Univ.)、
徳島大・疾患酵素研セ (Inst. Enzymol. X-ray Crystal. Lab., Tokushima Univ.)、
3
生物研・組換えセ・組換えカイコ (Centr. Transgen., Tg.Silkworm Lab. NIAS)、
4
高エネ研・構造生物研セ (Centr. Struct. Biol., KEK.)、5国立衛研・生物薬品 (Div. Bio. Chem. Biologic., NIHS.)
1
[[[20333]]]
2
2WD-4
[17:35]
ミトコンドリアの機能異常による多彩な疾患とヘム生合成に着目した診断と治療
A wide variety of diseases caused by mitochondrial malfunctions and diagnostic and
therapeutic approaches focusing on heme biosynthesis
○中島元夫 (Motowo Nakajima)、田中徹 (Tohru Tanaka)
SBI ファーマ (SBI Pharma)
[[[20338]]]
2WD-5
[18:05]
サイトカインストームによる代謝破綻と感染重症化にたいする治療薬の開発
Development of therapeutic agents for severe infectious diseases with metabolic disorder
induced by cytokine storm
○木戸博 (Hiroshi Kido)、高橋悦久 (Etsuhisa Takahashi)、インダラオイレネ (Irene L. Indalao)
徳大・疾患酵素学研究センター (Inst. Enzyme Res. Tokushima Univ.)
[[[20329]]]
2WE
E 会場（5 階小ホール）/ Room E（5F Small hall）
6 月 25 日 ( 木 ) / June 25 (Thu.）　16:00 ～ 18:30
酸素リモデリング・レドックスシグナルとタンパク質修飾の新たな潮流
Paradigm-shifting protein modifications in oxygen remodeling and
redox signal regulation
新学術領域研究「酸素を基軸とする生命の新たな統合的理解」共催
生物種に普遍的に見られる多くの生命現象は、分子状酸素のユニークなレドックス活性に依存している。すなわち、
生命の系譜は、酸素分子の化学的反応性に基づくリモデリング機能により制御されてきた。一方、近年、活性酸素に
よるレドックスシグナル伝達機構が注目されている。そこで、本ワークショップでは、酸素関連レドックス活性小分
子が惹起するシグナル経路を司る新規なタンパク質化学修飾を、翻訳と翻訳後レベルで横縦断的に俯瞰して、酸素レ
ドックスバイオロジーと酸化ストレス病態理論にパラダイムシフトをもたらす新たな潮流について議論する。
Many organisms conduct high-level vital activities by energy metabolism that uses the chemical reactivity of
molecular oxygen (oxidation-reduction: redox activity). The oxygen remodeling that modulates and optimizes
biological functions of various protein effector molecules, as affected by reactive oxygen species is now found to be
critically regulated via both translational and post-translational pathways. Through our innovative workshop, we will
explore several new protein modifications as paradigm-shifting discovery evolving from the changing concept of
oxygen and redox biology, and even redox pathology known as oxidative stress.
オーガナイザー：赤池孝章（東北大）、森泰生（京都大）
Organizers: Takaaki Akaike (Tohoku Univ.), Yasuo Mori (Kyoto Univ.)
2WE-1
[[[20260]]]
[16:00]
TRPA1 チャネルの酸素受容機能を担うタンパク質修飾
Protein modifications underlying oxygen-sensing function of TRPA1 channels
○森泰生 (Yasuo Mori)
京大・工及び地球環境 (Grad. Sch. Engineering & Global Environ. Studies, Kyoto Univ.)
（51）
WorkShop
[17:05]
Day 2 (June 25)
2WD-3
2WE-2
[16:25]
阪大・微研・細胞制御 (Dept. of Cell. Reg., Res. Inst. Microb. Dis., Osaka Univ.)
[[[20022]]]
Day 2 (June 25)
WorkShop
2WE-3
[16:50]
慶應・医・医化学 (Dep. of Biochem., Sch. of Med., Keio Univ.)
[17:15]
名大・院・生命農 (Grad. Sch. Bioagric. Sci., Nagoya Univ.)
[17:40]
アルコール脱水素酵素 III（ADH3）による生体防御機構と代謝制御
Multilayered contribution of Alcohol dehydrogenase III (ADH3) to cytoprotection
○本橋ほづみ (Hozumi Motohashi)
東北大・加・遺伝子発現制御 (Dept. Gene Expression Regulation, Tohoku Univ. IDAC)
[[[20175]]]
2WE-6
小分子酸素センサーによるタンパク質カルボニル化
Protein carbonylation by small molecular oxygen sensors
○内田浩二 (Koji Uchida)
[[[20225]]]
2WE-5
低酸素応答とミトコンドリアストレス
Hypoxic response and mitochondrial stress
○南嶋洋司 (Yoji A. Minamishima)
[[[20298]]]
2WE-4
マグネシウムイオン輸送のレドックス制御
Redox regulation of magnesium-ion transport
船戸洋佑 (Yosuke Funato)、山崎大輔 (Daisuke Yamazaki)、○三木裕明 (Hiroaki Miki)
[18:05]
システインパースルフィドの新しいタンパク質翻訳機構：タンパク質ポリチオール化
Cysteine persulfide-dependent protein translation: Protein S-polythiolation
○赤池孝章 (Takaaki Akaike)
東北大・医・医学系 (Dept of Environ. Health Sci. & Mol. Toxicology, Tohoku Univ. Grad. Sch. of Med.)
[[[20219]]]
2WF1
F 会場（5 階会議室 6）/ Room F（5F Conference room 6）
6 月 25 日 ( 木 ) / June 25 (Thu.）　13:00 ～ 15:30
レア・イベントとしてのタンパク質構造ダイナミクスの理論と実験
Protein structure dynamics as rare event problem addressed with theoretical
and/or experimental approaches
NMR によりタンパク質が溶液中では最安定構造とは異なる「低存在率構造」を取ることが分かってきた．一方で，レア・
イベントとしての低存在率構造への変化の経路を解析する理論的方法は様々に提案されてきており，実験情報を理解
するための相補的な技術になりつつある．本ワークショップでは，タンパク質構造ダイナミクスの実験的観測と，レア・
イベント物理学の理論的手法の協働をめざし，それぞれの立場から研究の現状を紹介する．
Protein structural dynamics induces higher energetic protein structure, although it happens rarely. Despite its low
population, typically less than 10%, the higher energetic structure has become revealed to functionally relevant. In
this workshop, we will discuss the structural and functional aspects of the rarely happening protein structure from
experimental and theoretical points of view.
オーガナイザー：楯真一（広島大）、藤崎弘士（日本医科大）
Organizers: Shin-ichi Tate (Hiroshima Univ.), Hiroshi Fujisaki (Nippon Medical School)
2WF1-1
[[[20017]]]
[13:00]
天然変性タンパク質が過渡的に形成する構造の機能上の意味
Functional significance of the transient folding of intrinsically disordered proteins (IDPs)
○楯真一 1,2 (Shin-ichi Tate)
1
2
広島大・理・数理分子 (Dept. Math. and Life Sci., Hiroshima Univ.)、
広島大・クロマチン動態数理拠点 (RcMcD, Hiroshima Univ.)
（52）
[13:25]
MTA-DE Momentum Laboratory of Protein Dynamics, Department of Biochemistry and Molecular Biology,
University of Debrecen
[13:55]
広島大・RcMcD (RcMcD, Hiroshima Univ.)
[[[20113]]]
2WF1-4
[14:15]
1
[14:35]
慶應大・理工・物理 (Dept. of Physics, Keio Univ.)、2JST, さきがけ (JST, PRESTO)
The String Method for the Study of Rare Event
○ Ren Weiqing
National University of Singapore and IHPC
[[[99986]]]
2WF1-6
緩和モード解析を用いた蛋白質のダイナミクスの研究
Dynamics of Proteins Studied by Relaxation Mode Analysis
○光武亜代理 1,2 (Ayori Mitsutake)
[[[20116]]]
2WF1-5
Coarse-grained molecular dynamics and rare events: suggestions by low-cost methods
○冨樫祐一 (Yuichi Togashi)
[15:05]
生体分子に対するレアイベントサンプリングの理論的アプローチ
Theoretical approaches to rare event sampling for biomolecules
○藤崎弘士 (Hiroshi Fujisaki)
日医大 (Nippon Medical School)
[[[20183]]]
2WF2
F 会場（5 階会議室 6）/ Room F（5F Conference room 6）
6 月 25 日 ( 木 ) / June 25 (Thu.）　16:00 ～ 18:30
バイオ医薬品の品質管理技術と蛋白質科学
Protein science underlying the quality control technologies for
biopharmaceuticals
バイオ医薬品の生産においては、有効性と安全性を保証するための高度な品質管理が求められる。それを支えるのは
タンパク質物性に関する深い理解と最新の分析技術である。本ワークショップでは、各分野の専門家の先生方からバ
イオ医薬品の品質管理に関して、現状と課題、技術開発の動向、品質と安全性の関係等の話題を紹介していただく。
また、タンパク質科学はいかなる貢献が可能なのかをワークショップ参加者ともに議論したい。
Quality control for biopharmaceuticals requires the deep understanding about protein molecules and the latest
analytical technologies. In this workshop, several subjects, such as the current situation of the quality control of
biopharmaceuticals, the challenges of the technology development, and the topics in protein science associating with
therapeutic safety will be presented by the experts.
オーガナイザー：大政健史（大阪大）、本田真也（産総研）
Organizers: Takeshi Omasa (Osaka Univ.), Shinya Honda (AIST)
2WF2-1
[16:00]
第一三共 ( 株 ) (Daiichi Sankyo Co., Ltd.)
[[[20050]]]
2WF2-2
[[[20042]]]
バイオ医薬品の品質特性に基づく品質管理と特性解析の現状と展望
Current status and future aspect in quality control and characterization based on
biopharmaceutical quality attribute
○柴田真吉 (Masayoshi Shibata)
[16:25]
動物細胞培養から考えるバイオ医薬品の蛋白質科学
Protein science of biologics from the point of view of mammalian cell culture
鬼塚正義 1 (Masayoshi Onitsuka)、○大政健史 2 (Takeshi Omasa)
1
徳島大院・STS 研 (Inst. of Tech. & Sci., Univ. of Tokushima)、2阪大院・工・生命先端 (Grad. Sch. of Eng., Osaka Univ.)
（53）
WorkShop
[[[99987]]]
2WF1-3
Fuzzy complexes: linking regulation to protein dynamics
○ Monika Fuxreiter
Day 2 (June 25)
2WF1-2
2WF2-3
[16:50]
Analysis of glycan heterogeneities in therapeutic antibodies by LC/MS:
application for process analytical technology
○橋井則貴 (Noritaka Hashii)、栗林亮佑 (Ryosuke Kuribayashi)、原園景 (Akira Harazono)
Day 2 (June 25)
WorkShop
国立衛研 (Natl. Inst. Health Sci.)
[[[20154]]]
2WF2-4
[17:15]
静岡県立大学薬学部臨床薬剤学分野 (Department of Clinical Pharmaceutics, School of Pharmaceutical Sciences,
University of Shizuoka)
[17:40]
[[[20123]]]
バイオ医薬品の物理化学分析の過去、現在、未来
Biophysical characterizations of therapeutic proteins -past, present and future○内山進 (Susumu Uchiyama)
阪大・工・生命先端 (Dept. Biotech. Grad. Sch. Eng., Osaka Univ.)
[[[20090]]]
2WF2-6
バイオ医薬品注射剤調製時に発生する凝集体のキャラクタリゼーション
Characterization of protein aggregation promoted by the preparation of
biopharmaceutical injection
○内野智信 (Tomonobu Uchino)
[[[20252]]]
2WF2-5
液体クロマトグラフィー / 質量分析による抗体医薬品の糖鎖不均一性解析：
プロセス解析工学への応用
[18:05]
「次世代抗体医薬等の製造技術」プロジェクトにおける分析技術開発のとりくみ
Analytical technology developments in the national project for novel biopharmaceutical
manufacturing platform
○大政健史 1,2 (Takeshi Omasa)、本田真也 3 (Shinya Honda)
1
3
阪大院・工・生命先端 (Grad Sch Eng, Osaka U)、2徳島大・STS 研究部 (Inst Sci Tech, Tokushima U)、
産総研・バイオメディカル (Natl Inst Adv Indust Sci Tech (AIST))
（54）
3WA
A 会場（1 階ホール）/ Room A（1F Hall）
6 月 26 日 ( 金 ) / June 26 (Fri.)　15:00 ～ 17:30
天然モノと人工モノ、両面から迫る最新のタンパク質構造観
Naturally occurring proteins implement various machineries for folding and function in the structures. Developing
insights into protein structures for understanding how such machineries are implemented is quite important for
designing proteins.Here,we invite the both speakers who are studying on natural proteins and who are actually
creating proteins to develop the insights.
オーガナイザー：古賀信康（分子研）、千見寺浄慈（名古屋大）
Organizers: Nobuyasu Koga (IMS), George Chikenji (Nagoya Univ.)
[15:00]
Opening Remarks
千見寺浄慈 (George Chikenji)
名古屋大 (Nagoya Univ.)
[[[99985]]]
3WA-1
はじめに
[15:05]
進化分子工学による構造と機能の共創出
Co-emergence of structure and function through the directed evolution of infantile proteins
○本田真也 1,2 (Shinya Honda)、渡邊秀樹 1 (Hideki Watanabe)
1
[[[20120]]]
2
3WA-2
[15:29]
1
[15:53]
[16:17]
[[[20206]]]
タンパク質相互作用データベースを利用した超分子モデリング法の開発
Development of method for protein-protein interaction modeling using IntAct database
○辻敏之 (Toshiyuki Tsuji)、依田隆夫 (Takao Yoda)、白井剛 (Tsuyoshi Shirai)
長浜バイオ大学バイオサイエンス学部 (Nagahama Institute of Bio-Science and Technology)
[[[20293]]]
主鎖二面角パターンを用いたタンパク質構造デザイン
分子研・協奏分子 (CIMoS, IMS)
3WA-5
名大・情科 (Grad. Sch. of Info. Sci., Nagoya Univ.)、2名大・計理 (Dept. of Comp. Sci. & Eng., Nagoya Univ.)
Design of protein structures with main-chain torsion patterns
○古賀信康 (Nobuyasu Koga)
[[[20062]]]
3WA-4
二次構造の空間的配置パターンに注目して天然タンパク質構造の持つ普遍的特徴を探る
A study of universal characteristics of natural protein folds : focused on spatial
arrangement of secondary structures
○南慎太朗 1 (Shintaro Minami)、太田元規 1 (Motonori Ota)、千見寺浄慈 2 (George Chikenji)
[[[20083]]]
3WA-3
産総研・バイオメディカル (Biomed Res Inst, Natl Inst Adv Indust Sci Tech (AIST))、
東大院・新領域 (Grad Sch. of Fron. Biosci., Univ. of Tokyo)
[16:41]
ドメインスワップ二量体人工蛋白質を用いた蛋白質ナノブロックによる人工蛋白質複合体の創出
Artificial protein complexes created from protein nano-building blocks using
domin-swapped dimeric de novo proteins
○小林直也 (Naoya Kobayashi)、新井亮一 (Ryoichi Arai)
信州大・繊維・応生 (Appl. Biol., Fac. of Tex. Sci. Tech., Shinshu Univ.)
（55）
WorkShop
進化の産物である天然のタンパク質には、特定の構造に折りたたみ、機能を発現するための様々な工夫が立体構造中
に凝らされている。望みのタンパク質を自在にデザインするためには、それら工夫を見抜くための「タンパク質構造観」
を身に付ける事が必須となる。本ワークショップでは、天然モノのタンパク質を情報論的、物理的に解析している研
究者と、人工モノを実際に創っている研究者を一同に会し、両者の側面からタンパク質構造観を深める。
Day 3 (June 26)
Natural vs. Design: What is the difference ?
3WA-6
[17:05]
タンパク質の柔らかさと酵素活性
Conformational flexibility of protein and enzymatic catalysis
○林重彦 (Shigehiko Hayashi)
京大・理 (Dept. of Chem., Grad. Sch. of Sci., Kyoto Univ.)
[[[20304]]]
[17:29]
おわりに
Day 3 (June 26)
WorkShop
Closing Remarks
古賀信康 (Nobuyasu Koga)
分子研 (IMS)
[[[99984]]]
3WB
B 会場（4 階大会議室）/ Room B（4F Main conference room）
6 月 26 日 ( 金 ) / June 26 (Fri.)　15:00 ～ 17:30
動的構造生命科学を拓く新発想測定技術
Novel measurement techniques for visualizing 'live' protein molecules at work
新学術領域研究「動的構造生命科学を拓く新発想測定技術－タンパク質が動作する姿を
活写する－」共催
生命現象の本質を理解するには、タンパク質などの生体高分子が実際に働いている細胞環境などの現場において、過
渡的にしか存在しない準安定状態を適切な手法を用いて動的に観測する必要があります。磁気共鳴法、原子間力顕微鏡、
結晶解析手法などの計測手法を新発想に基づいてさらに強力な計測手法へとバージョンアップし、構造生物学の新分
野として「動的構造生命」を開拓します。
The 3D static structures determined by X-ray crystallography provide convenient explanations of protein functions.
However, most structural biological techniques cannot properly convey the dynamic aspects of protein structures.
In this workshop, we discuss the development of innovative measurement techniques, to vividly describe protein
structures at their sites of action.
オーガナイザー：神田大輔（九州大）、西田紀貴（東京大）
Organizers: Daisuke Kohda (Kyushu Univ.), Noritaka Nishida (The Univ. of Tokyo)
3WB-1
[15:00]
空間分布を視覚化する
Crystal contact-free space for analyzing spatial distribution of protein internal motions
○神田大輔 (Daisuke Kohda)
九大・生医研・構造生物 (Struct. Biol., Med. Inst. Bioreg., Kyushu Univ.)
[[[20012]]]
3WB-2
“ 結晶コンタクトフリー空間 “ を利用する新しい結晶解析技術を用いて蛋白質分子の内部運動の
[15:30]
ダイナミックに動作中のタンパク質分子を直接可視化する高速 AFM
High-speed AFM for directly visualizing protein molecules in dynamic action
○安藤敏夫 1,2 (Toshio Ando)
1
[[[20044]]]
2
3WB-3
[[[20335]]]
[16:00]
金沢大・理工・数物 (Dept. of Physic, Kanazawa Univ.)、
金沢大・理工・バイオ AFM センター (Bio-AFM Center, Kanazawa Univ.)
ダイアモンド粒子の窒素 - 空隙中心 (NVC) を用いた生体・細胞の
ナノジャイロセンシング手法の開発
Nano-gyrosensor utilizing Nitrogen-vacancy centers in diamond particles
○白川昌宏 1 (Masahiro Shirakawa)、五十嵐龍治 1 (Ryuji Igarashi)、久美屋雄太 1 (Yuta Kumiya)、
杉拓磨 2,3 (Takuma Sugi)、外間進悟 1 (Shingo Sotoma)、杤尾豪人 4 (Hidehito Tochio)、
吉成洋祐 2 (Yohsuke Yoshinari)、原田慶恵 2 (Yoshie Harada)
京大院・工 (Graduate School of Engineering, Kyoto University)、
京大・iCeMs (Institute for Integrated Cell-Material Sciences(WPI-iCeMS), Kyoto University)、3JST, さきがけ (JST, PRESTO)、
4
京大院・理 (Graduate School of Science, Kyoto University)
1
2
（56）
3WB-4
[16:30]
生細胞内の生命現象を活写する in-cell NMR 法の開発と応用
in-cell NMR method to observe the biological events within living cells
○西田紀貴 (Noritaka Nishida)、嶋田一夫 (Ichio Shimada)
東大院薬 (Grad. Sch. Pharm. Sci., Univ. of Tokyo)
[17:00]
マルチレゾリューション法を用いたタンパク質複合体の動的構造解析
Structure and dynamics analysis of a protein complex by multi-resolution method
○杉田有治 (Yuji Sugita)
理研・杉田理論分子 (Theoreical Molecualr Science Labo. RIKEN)
[[[20286]]]
3WC
C 会場（4 階会議室 2）/ Room C（4F Conference room 2）
6 月 26 日 ( 金 ) / June 26 (Fri.)　15:00 ～ 17:30
生体膜上における事象の分子機構解明を目指すペプチド生命科学
Peptide Life Science for Elucidating Mechanism of Biology on the Membrane
生体膜上においては、様々な生物学的に重要な事象が生じている。それらの分子機構の解明、さらには、その制御は
新たな創薬的研究アプローチの提唱等に大きく貢献する。本ワークショップでは、生体膜およびペプチドをキーワー
ドとして、生体膜上で生じる事象の分子機構の解明を目指した最先端の研究を紹介する。
A number biological phenomena occur on the membrane, which are crucial for cell homeostasis and important
targets in a field such as drug designing. In this workshop, introducing “the membrane” and “peptide” as key words,
researches for elucidating molecular mechanism of biology on the membrane will be presented and discussed.
オーガナイザー：川村出（横浜国立大）、佐藤毅（大阪大）
Organizers: Izuru Kawamura (Yokohama National Univ.), Takeshi Sato (Osaka Univ.)
3WC-1
[15:00]
Structure and function of the single transmembrane protein using synthetic peptide
○佐藤毅 (Takeshi Sato)
阪大・蛋白研 (Inst.Protein.Res., Osaka Univ.)
[[[20138]]]
3WC-2
[15:25]
1
[15:50]
[16:15]
[[[20122]]]
マイクロ加工・流体技術を用いた人工細胞膜システムの開発
Development of Artificial Cell-membrane System using Microfabication and Microfluidics
○川野竜司 (Ryuji Kawano)
農工大生命工 (Division of Biothechnology and Life Science, Tokyo University of Agriculture and Technology (TUAT))
[[[20054]]]
組換え抗菌ペプチドの安定生産技術とその解析への利用
北大・先端生命 (Fac. Adv. Life Sci., Hokkaido Univ.)
3WC-5
阪府大・21 機構・ナノ (N2RC, Osaka Prefecture University)、2京大化研 (Inst. Chem. Res, Kyoto University)
Recombinant production of antimicrobial peptides and application for analysis
○相沢智康 (Tomoyasu Aizawa)
[[[20202]]]
3WC-4
膜透過性アルギニンペプチドの細胞内移行における syndecan-4 及び PKC αの寄与
Roles of syndecan-4 and PKCα for cellular uptake of arginine-rich cell-penetrating peptides
○中瀬生彦 1 (Ikuhiko Nakase)、大崎勝弘 2 (Katsuhiro Osaki)、二木史朗 2 (Shiroh Futaki)
[[[20137]]]
3WC-3
合成ペプチドを用いた 1 回膜貫通型タンパク質の構造機能解析
[16:40]
固体 NMR による抗菌ペプチドの生体膜結合構造と膜相互作用解析
Biological membrane bound structure of antimicrobial peptides and their interactions with
membrane as revealed by solid state NMR
○内藤晶 (Akira Naito)
横浜国大・院・工 (Grad. Schl. Eng., Yokohama Natl. Univ. )
（57）
WorkShop
3WB-5
Day 3 (June 26)
[[[20065]]]
3WC-6
[17:05]
ガングリオシドクラスターを舞台とする神経変性疾患関連タンパク質の構造転移
Conformational transitions of neurodegenerative disordered proteins promoted on
ganglioside clusters
○矢木 - 内海真穂 (Maho Yagi-Utsumi)、加藤晃一 (Koichi Kato)
自然科学研究機構・統合バイオ (Okazaki Inst. Integ. Biosci., Natl. Inst. Nat. Sci.)
[[[20271]]]
Day 3 (June 26)
WorkShop
3WD
D 会場（4 階会議室 3 ＋ 4）/ Room D（4F Conference room 3+4）
6 月 26 日 ( 金 ) / June 26 (Fri.)　15:00 ～ 17:30
圧力軸から見えてくるタンパク質の構造特性と機能相関
Structural Properties and Functional Correlation of Proteins Revealed from the
Pressure Axis
圧力は、温度と同様に重要な環境変数である。物質を加圧すると、圧力は均一且つ瞬時に伝播し、その物質の体積収
縮をもたらす。水溶液中において、様々な非等方的な分子内および分子間相互作用で支配されているタンパク質への
当方的な圧力の適用は、タンパク質へ大きなメカニカルなゆらぎをもたらすため、常圧下においては観測できない新
奇の現象が現れる。本ワークショップでは、圧力軸を導入したタンパク質の研究事例を紹介し、そこから浮かび上がっ
てくるタンパク質の構造と機能を体積的な観点から議論する。
Pressure as well as temperature are important environmental variables. When pressurizing substances, pressure
propagates into them isotropically and instantaneously and reduced their volumes. Application of pressure to proteins
that are subjected by various anisotropic inter- and intra-molecular interactions in an aqueous solution brings about
great mechanical fluctuation on the proteins, and then novel phenomena that are not be able to observe under
atmospheric pressure appear. In this workshop, several high-pressure protein studies are introduced and discussed the
protein structure and functions revealed by the studies from the viewpoint of volume.
オーガナイザー：松木均（徳島大）、織田昌幸（京都府立大）
Organizers: Hitoshi Matsuki (Tokushima Univ.), Masayuki Oda (Kyoto Prefectural Univ.)
3WD-1
[15:00]
近大・高圧蛋白研セ (High Pressure Protein Res. Center, Kinki Univ.)
[[[20334]]]
3WD-2
高圧 NMR を用いた蛋白質の動態解析 -Cavity による揺らぎの制御 Analysis of protein dynamics performed by high-pressure NMR -Cavity controls
conformational fluctuations of a protein○前野覚大 (Akihiro Maeno)、赤坂一之 (Kazuyuki Akasaka)
[15:25]
高圧力を利用した転写因子 c-Myb DNA 結合ドメインの準安定励起構造解析
Low-lying excited states of c-Myb DNA-binding domain analyzed by pressure perturbation
experiments
○稲葉理美 1 (Satomi Inaba)、前野覚大 2 (Akihiro Maeno)、赤坂一之 2 (Kazuyuki Akasaka)、
織田昌幸 1 (Masayuki Oda)
1
[[[20008]]]
2
3WD-3
[15:50]
[[[20121]]]
酵素の構造安定性と機能における水和の役割
Role of Hydration on Structural Stability and Function of Enzymes
○大前英司 1 (Eiji Ohmae)、宮下由里奈 1 (Yurina Miyashita)、片柳克夫 1 (Katsuo Katayanagi )、
加藤千明 2 (Chiaki Kato)
1
[[[20030]]]
3WD-4
京府大・院生命環境科学 (Grad. Sch. Life Environ. Sci., Kyoto. Pref. Univ.)、
近大・高圧研 (High Pressure Protein Res. Center, Kinki Univ.)
[16:15]
広大・理 (Grad. Sch. of Sci., Hiroshima Univ.)、2海洋研究開発機構 (JAMSTEC)
圧力摂動熱量測定によるシトクロムｃのモルテングロビュール状態の安定性・体積変化の評価
The thermal stability and volumetric properties of the molten-globule state of cytochrome
c evaluated with pressure perturbation calorimetry
○中村成芳 (Shigeyoshi Nakamura)、城所俊一 (Shun-ichi Kidokoro)
長岡技科大・生物機能 (Dept. of Bioeng., Nagaoka Univ. of Tech.)
（58）
[16:40]
立命館大・薬 (Dept. of Pharm. Ritsumeikan Univ.)
[17:05]
麻酔作用は圧力により拮抗するのか：ルシフェラーゼを用いたモデル研究
Does pressure antagonize anesthesia? : model study using firefly luciferase
○松木均 1 (Hitoshi Matsuki)、西本真琴 2 (Makoto Nishimoto)、釜谷比羅志 3 (Hiroshi Kamaya)
徳島大院・ソシオテクノサイエンス研 (Inst. of Tech. and Sci., Tokushima Univ.)、
和歌山高専・物質工 (Dept. of Mater. Sci., Wakayama Nat. Col. of Tech.)、
3
ユタ大・医・麻酔 (Dept. of Anesth., Univ. of Utah Sch. of Med.)
1
[[[20041]]]
2
3WE1
E 会場（5 階小ホール）/ Room E（5F Small hall）
6 月 26 日 ( 金 ) / June 26 (Fri.)　12:50 ～ 14:50
ゲノム情報活用の試み - 蛋白質の機能・構造予測と生化学的同定手法 -
Genome Enabled Approaches for Comprehensive Understanding of Life
次世代型メタシークエンシング解析からゲノム配列が決定された生物種は現在 4 万種以上にのぼるが、この膨大なタ
ンパク質遺伝子の情報を活用する手法は限られている。本セッションでは、最前線のタンパク質機能・構造予測バイ
オインフォマティクス及び、網羅的蛋白質合成・機能解析方法について紹介するとともに、課題を展望したい。
The advent of next generation sequencing technologies has provided an unprecedented amount of genomic data (>
40,000 genomes). While many large-scale experimental technologies have been developed, there are still strategies
that need to be developed to integrate these large-scale data to reach comprehensive understanding of life. In this
workshop, we will overview recent advancements in large-scale experimental techniques and bioinformatics methods.
オーガナイザー：木原大亮（パデュー大）、髙須賀太一（北海道大）
Organizers: Daisuke Kihara (Purdue Univ.), Taichi Takasuka (Hokkaido Univ.)
[12:45]
はじめに
Opening Remarks
[[[99983]]]
3WE1-1
[12:50]
RIKEN Center for Life Science Technologies, Division of Genomic Technologies
[[[99982]]]
3WE1-2
[13:13]
理研・QBiC (RIKEN QBiC)
[13:36]
[[[20021]]]
ゲノムスケールのムーンライトタンパク質の同定
Genome-scale identification and characterization of moonlighting proteins
○木原大亮 (Daisuke Kihara)、カーンイシタ (Ishita Khan)
パデュー大学生物科学科・計算機科学科 (Department of Biological Sciences/Computer Science, Purdue University)
[[[20239]]]
3WE1-4
細胞内生化学反応ネットワークシミュレーション技術の現状と将来
Simulating intracellular biochemical networks
○高橋恒一 (Koichi Takahashi)
[[[20220]]]
3WE1-3
Surprises from studies of mammalian transcriptomes
○ Piero Carninci
[13:59]
メタゲノムを活用した酵素スクリーニング
Metagenomic screening for enzymes
○宮崎健太郎 (Kentaro Miyazaki)
産総研・生物プロセス (AIST)
（59）
WorkShop
[[[20273]]]
3WD-6
モデルペプチドの高圧力研究から見えてくるタンパク質の圧力変性機構
Mechanism of pressure denaturation of proteins revealed from high pressure vibrational
spectroscopies of model peptides
○加藤稔 (Minoru Kato)
Day 3 (June 26)
3WD-5
3WE1-5
[14:22]
Phylogenetic-guided biochemical annotation for glycoside hydrolase families
○高須賀太一 1 (Taichi Takasuka)、Christopher Bianchetti2、Kai Deng1,7、Bergeman Lai2,3、
Sam Deutsch5,6、Trent Northen4,6、Brian Fox2,3
北大・農・連携 (Devision Res. Innov. and Coop., Faculty of Agriculture, Hokkaido Univ.)、
ウィスコンシン大学生化学学部 (Department of Biochemistry, University of Wisconsin)、
3
ウィスコンシン大学マディソン校 Great Lakes Bioenergy Research Center (Department of Energy Great Lakes Bioenergy
Research Center, University of Wisconsin-Madison)、
4
Joint BioEnergy Institute (Department of Energy Joint BioEnergy Institute)、
5
Joint Genome Institute (Department of Energy Joint Genome Institute)、
6
Lawrence Berkeley National Laboratory、7Sandia National Laboratories
1
[[[20308]]]
2
Day 3 (June 26)
WorkShop
3WE2
E 会場（5 階小ホール）/ Room E（5F Small hall）
6 月 26 日 ( 金 ) / June 26 (Fri.)　15:00 ～ 17:30
脳タンパク質老化と認知症制御
Brain Protein Aging and Dementia Control
新学術領域研究「脳タンパク質老化と認知症制御」共催
正常に機能していたタンパク質が、ある時期から変質し、機能を失うあるいは神経細胞に対して毒性を持つようになり、
神経細胞の機能障害、変性、伝播を介して、神経回路破綻を来たし最終的には認知症に至る。この脳タンパク質老化
に基づく神経変性について、A β , TDP-43, タウ , FUS, αシヌクレインなどを中心に議論したい。
We will discuss about brain protein aging process through initiation of transformation at a certain time, functional
loss and toxicity acquisition against neural cells, neural circuits breakdown, functional disorder, degeneration and
propagation of neural cells, and the process of developing dementia in this research field.
オーガナイザー：長谷川成人（都医学研）、佐原成彦（放医研）
Organizers: Masato Hasegawa (Tokyo Metropolitan Inst. of Med. Sci.), Naruhiko Sahara (NIRS)
3WE2-1
[15:00]
都医学研・認知症 (Dementia Pj., Tokyo Met. Ins. of Med. Sci.)
[[[20230]]]
3WE2-2
[15:30]
都医学研・認知症プロジェクト・病態細胞生物 (Dept. of Neuropathol. Cell Biol., Dementia PJ, Tokyo Metropolitan Institute of
Medical Science)
[16:00]
[16:30]
[[[20143]]]
タウタンパク質にとって正常と異常の違いは何か ?
Definition of tau protein status; what is a normal tau?
○佐原成彦 (Naruhiko Sahara)
放射線医学総合研究所分子イメージング研究センター (National Institute of Radiological Sciences, Molecular Imaging Center)
[[[20269]]]
3WE2-5
ALS/FTLD の病態における FUS の役割
Quality loss of function of FUS in ALS/FTLD
○石垣診祐 (Shinsuke Ishigaki)、祖父江元 (Gen Sobue)
名古屋大・院医・神経内科 (Dept.Neurology,.Grad.Sch of .Med. Nagoya Univ.)
[[[20010]]]
3WE2-4
患者脳内で不溶化した TDP-43 のプリオン様性質
Prion-like properties of pathological TDP-43 aggregates from brains of patients
○野中隆 (Takashi Nonaka)、長谷川成人 (Masato Hasegawa)
[[[20187]]]
3WE2-3
脳タンパク質老化と神経疾患
Brain protein aging and neurodegenerative diseases
○長谷川成人 (Masato Hasegawa)
[17:00]
アミロイド繊維と低分子化合物の相互作用
Molecular interactions between amyloid fibrils and low-molecular-weight compounds
○山口芳樹 (Yoshiki Yamaguchi)
理研・糖鎖構造 (Structural Glycobiology, RIKEN)
（60）
3WF
F 会場（5 階会議室 6）/ Room F（5F Conference room 6）
6 月 26 日 ( 金 ) / June 26 (Fri.)　15:00 ～ 17:30
タンパク質のリン酸化は真確生物において最も広範に認められる翻訳後修飾であり、タンパク質の酵素活性、局在、
安定性、相互作用などを可逆的かつダイナミックに制御することが可能である。ヒトにはタンパク質リン酸化酵素（キ
ナーゼ）が 500 種類以上も存在し、様々な細胞内シグナル伝達系で重要な役割を果たしている。本ワークショップでは、
最近のイメージングやプロテオミクスなどの技術革新による、リン酸化シグナル伝達研究の新たな展開について議論
する。
Protein phosphorylation is the most widespread type of post-translational modifications and can regulate diverse
properties of proteins. Protein kinases are encoded by over 500 genes in the human genome and are major components
of cell signaling. Recent advances in various imaging and proteomic technologies have enabled more comprehensive
and quantitative analysis of phosphorylation-mediated signaling networks in cells and tissues.
オーガナイザー：小迫英尊（徳島大）、青木一洋（京都大）
Organizers: Hidetaka Kosako (Tokushima Univ.), Kazuhiro Aoki (Kyoto Univ.)
3WF-1
[15:00]
京大・医・生命動態 (Grad. Med., Kyoto Univ.)
[[[20018]]]
3WF-2
[15:30]
東大・薬・細胞情報 (Grad. Sch. of Pharm. Sci., UTokyo)
[16:00]
愛媛大・PROS (PROS, Ehime Univ.)
[16:30]
The CDK family member PCTK3/CDK18 is activated by cyclin A and PKA, and is involved in
actin dynamics
松田真弥 (Shinya Matsuda)、○湯浅恵造 (Keizo Yuasa)
徳島大院・STS (Grad. Sch. Biol. Sci. & Tech., Univ. of Tokushima)
[[[20261]]]
[[[20094]]]
CDK ファミリーメンバー PCTK3/CDK18 は cyclin A 及び PKA によって活性調節を受け、
アクチン動態を制御する
3WF-5
コムギ無細胞系を用いたキナーゼ基質の探索技術
New technology for substrate screening of protein kinases using wheat cell-free system
○澤崎達也 (Tatsuya Sawasaki)
[[[20226]]]
3WF-4
ストレスシグナルのリン酸化制御とキナーゼ
Regulation of Stress Signaling by Phosphorylation
○一條秀憲 (Hidenori Ichijo)
[[[20110]]]
3WF-3
ERK 活性の細胞間伝搬の定量解析
Quantitative analysis of intercellular ERK activity propagation
○青木一洋 (Kazuhiro Aoki)
[17:00]
先端プロテオミクス技術によるタンパク質キナーゼ基質の同定と機能解析
Identification and functional analysis of protein kinase substrates using advanced proteomic
technologies
○小迫英尊 (Hidetaka Kosako)
徳島大・藤井センター (Fujii Memorial Inst. of Med. Sci., Tokushima Univ.)
（61）
WorkShop
Various approaches for understanding phosphorylation-mediated signaling
networks
Day 3 (June 26)
多彩なアプローチを用いたリン酸化シグナル伝達系の解明

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