PDF - Stellenwerk Bochum

Job-ID:
BO-2016-12-12-95145
Online seit:
16.12.2016 - 08:30
Anbieter
Universität
Ruhr-Universität Bochum
Institut / Einrichtung
Medizinisches Proteom Center
Kategorie
Wissenschaftl. Mitarbeiter(in)
Angebot
Titel
Quantitative Proteom und Phosphoproteomanalyse
Einsatzort
Universitätsstraße 150
44801 Bochum
Deutschland
Beschreibung
Die Ruhr- Universität Bochum (RUB) ist eine der führenden Forschungsuniversitäten in
Deutschland. Als reformorientierte Campusuniversität vereint sie in einzigartiger Weise die
gesamte Spannbreite der großen Wissenschaftsbereiche an einem Ort. Das dynamische
Miteinander von Fächern und Fächerkulturen bietet den Forschenden wie den Studierenden
gleichermaßen besondere Chancen zur interdisziplinären Zusammenarbeit.
Stellenbeschreibung:
Das Medizinische Proteom-Center (MPC) unter der Leitung von Prof. Dr. Katrin Marcus ist eines
der führenden Institute für die Proteom- und Proteinanalytik. Mit Hilfe von Gel- und
Chromatographie-basierten Trenntechniken und nachfolgender Massenspektrometrie, sowie
mittels Protein-Biochips und innovativer Bioinformatik werden hier Fragestellungen aus allen
Bereichen der Medizin, wie auch aus dem naturwissenschaftlichen Grundlagenbereich
bearbeitet.
Ein Schwerpunkt der Arbeitsgruppe Clinical-Proteomics unter der Leitung von Jun.-Prof. Dr.
Barbara Sitek liegt auf der quantitativen Proteomanalyse von Krebserkrankungen mit dem Ziel
der Entdeckung neuer potentieller therapeutischer Zielmoleküle. Im Rahmen eines durch die
Wilhelm Sander-Stiftung geförderten Kollaborationsprojektes mit der Kinderklinik am
Universitätsklinikum Essen sollen Interaktionen zwischen TrkA und MYCN und ihre Rolle bei der
Modulation des aggressiven Potentials von Neuroblastomen untersucht werden. Am Standort
Bochum wird hierzu die Massenspektrometrie-basierte markierungsfreie Proteomanalyse
verwendet (LC-MS/MS-based label-free proteomics). Zusätzlich zur globalen Proteomanalyse
sollen mittels quantitativer Analyse des Phosphoproteoms Veränderungen in zellulären
Signalwegen untersucht werden. Hierzu sollen auch markierungs-basierte
Quantifizierungsstrategien (SILAC, TMT) verwendet werden. Neben der Generierung und
Analyse von Proben beinhaltet die Arbeit die statistische und bioinformatische Auswertung von
high-throughput-Datensätzen sowie die Interpretation der Ergebnisse und die Einordnung in
bestehendes Wissen. Zur Interpretation der Daten wird es notwendig sein sich tiefgehend mit
den Mechanismen der Krebsbiologie und zellulären Signaltransduktion auseinanderzusetzen. Die
Verifizierung neu entdeckter therapeutischer Zielmoleküle erfolgt durch Inhibition und mittels
klassischer immunologischer Methoden wie Western Blot-Analyse oder Immunhistochemie. Im
Rahmen dieses Verbundprojekts besteht eine enge Zusammenarbeit mit dem beteiligten
1
klinischen Partner.
Anforderungsprofil
hr Profil:
·
Abgeschlossenes Hochschulstudium der Biologie, Biochemie, Chemie oder Pharmazie
·
Quantitative Proteom und Phosphoproteomanalyse
· Sehr gute Kenntnisse proteinanalytischer Methoden (SDS-PAGE,
Affinitätschromatographie)
· Sehr gute Kenntnisse immunologischer Methoden (Western Blot-Analyse,
Immunpräzipitation, Immunhistologie)
·
Sehr gute Kenntnisse der molekularen Mechanismen von Krebserkrankungen
· Bevorzugt Erfahrung mit der Massenspektrometrie-basierten quantitativen
Proteomanalytik (label-free/label-based proteomics)
·
Bevorzugt Erfahrung mit der Analyse großer Datensätze
·
Gute Kenntnisse statistischer Methoden
·
Sehr gute Englischkenntnisse
Unser Angebot:
·
Mitarbeit in einem jungen, sich dynamisch entwickelnden Team
· Eine exzellente instrumentelle Ausstattung (Orbitrap Elite, QExactive, QExactive
HF)
· Bearbeitung einer interessanten Fragestellung im Bereich translationaler
onkologischer Forschung
· Erwerb von praktischer Erfahrung in der Durchführung und Auswertung von
Proteomics-Experimenten
· Erwerb von hands-on-Erfahrungen in der Bedienung eines modernen
Massenspektrometers
· Erwerb von Kenntnissen und der Durchführung fortgeschrittener statistischer
Auswertungsmethoden
·
Durchführung eines breiten Spektrums proteinanalytischer Methoden
Bitte schicken Sie Ihre Bewerbung als PDF-Datei bis zum 15.01.2017 an:
babara.sitek@ rub.de
Wir wollen an der Ruhr- Universität Bochum besonders die Karrieren von Frauen in den
Bereichen, in denen sie unterrepräsentiert sind, fördern und freuen uns daher sehr über
Bewerberinnen. Auch die Bewerbungen geeigneter schwerbehinderter und
gleichgestellter Bewerber und Bewerberinnen sind herzlich willkommen.
Fahrtkosten für evtl. Bewerbungsgespräche können nicht erstattet werden.
Vergütung
TV- L E 13 (65%)
Art der Beschäftigung
Teilzeit
Zeitraum der Beschäftigung
15.02.2017 bis 14.02.2019, mit der Option auf 1 Jahr Verlängerung
Bewerbungsfristende
Sonntag, 15. Januar 2017 - 23:59
Kontakt
Vorname
Barbara
Name
Sitek
Telefon
+49 234 32024362
E-Mail
barbara.sitek@ rub.de
2
Link zu dieser Stellenanzeige: https://www.stellenwerk-bochum.de/jobboerse/wissenschaftl-mitarbeiterin-quantitative-proteomund-phosphoproteomanalyse-bo-2016-12-12-95145
Bitte beziehe Dich in Deiner Bewerbung auf https://www.stellenwerk-bochum.de/
3