2016 年 12 月 5 日質疑・回答書国立研究開発法人理化学研究所横浜

2016 年 12 月 5 日
質疑･回答書
国立研究開発法人理化学研究所
横浜事業所
契約担当役
研究支援部長岩田伸一
件名: タンパク質溶媒自由エネルギー計算ソフトウェアライセンス
番号
1
対象書類
仕様書
3.3-1(1)
質問内容
回
「半経験的自由エネルギー計算」とは、半経験的分子軌道法で求められる生成熱（Heat 生成熱ではなく系全体のエネルギーを計算
of formation）と理解してよろしいでしょうか。
できれば可とする。
「リガンドの脱溶媒和エネルギーの」定義は、溶媒中の結合エネルギーを
2
仕様書
3.3-1(3)
答
ΔGbind_sol とした場合、熱力学サイクルによる評価により、
ΔGbind_sol＝ΔGbind_gas+(Gsol_complex-Gsol_ligand-Gsol_reseptor)-TΔS
が成り立つと思います。
「リガンドの脱溶媒和エネルギー」とは、上式の右辺第 2 項と
理解してよろしいでしょうか。
よろしい。
弊社が提案する予定の製品は、グラフィカルユーザーインターフェースの機能を搭載
3
仕様書
3.3-1(4)
しておりません。そのため入力としてサポートしている.pdb 形式のファイルであって入力ファイルの修正は理化学研究所で別途
も一部修正してのご利用が必要となることがあります。.mol2 形式には対応しており
行う、よって、提案納入仕様でよろしい。
ません。以上の納入仕様でもよろしいでしょうか。
入札説明書「入札に関する留意事項」3.②応
札仕様書の説明資料として HP に公開してい
4
仕様書
マニュアルは、HP 等に公開しているものでよろしいでしょうか。それ以外に「トレー
3.3-3
ニングマニュアル」の提供が必須要件でしょうか。
るものを提出のこと。また、HP のもので仕様
を満たしている場合でも、本書類は、検収時
の納品物であるため、紙媒体及び電子媒体
（閲覧可能な電子ファイル：Adobe
AcrobatReader 等）各１部提出のこと。
HP に公開しているもので可とする。ただし、
5
仕様書
「サンプルデータ」を利用した事例は HP 等に公開しております。それ以外のデータの本書類は、検収時の納品物であるため、電子
3.3-3
提供が必須要件でしょうか。
媒体（閲覧可能な電子ファイル：
Adobe AcrobatReader 等）で提出のこと。
6
7
仕様書
3.3-3
仕様書
6.
「トレーニングを１回開催すること」は、必須要件でしょうか。
「検収」は、インストール及び動作確認が必須要件でしょうか。
必須とする。別途、実施（所用時間：1-2 時
間程度）すること。
必須とする。
8
入札説明書
11.
平成 28 年度の年間委任状を提出済の場合でも、案件毎に再提出が必要でしょうか。
提出済の年間委任状（写）を入札書に併せて
提出のこと。
入札説明書 3.(1)に定める期限までに応札仕
9
入札説明書
14.
契約締結時に「使用許諾契約書」の締結が必要となる場合に、本件の契約納期の７営
様書等に併せて「使用許諾契約書(案)」を提
業日までに締結が可能でしょうか。
出のこと。入札参加資格確認書類として確認
するものとする。
以上

Download Report